杨晨
- 作品数:11 被引量:13H指数:1
- 供职机构:华中农业大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家科技重大专项更多>>
- 相关领域:农业科学理学自动化与计算机技术生物学更多>>
- 基于k-tree优化贝叶斯网络的上位性位点挖掘方法
- 本发明提供一种基于k‑tree优化贝叶斯网络的上位性位点挖掘方法。均匀抽样蒲公英代码,得到每个节点的邻居节点集合,构建对应的特征树结构;利用与k‑clique中节点进行合并组成新节点的方法,构建得到包括大规模SNP位点和...
- 刘建晓阚裕隆杨晨杨轩王李光
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- 基于人工蜂群优化贝叶斯网络的上位性挖掘方法研究
- 全基因组关联分析方法作为目前常用的检测影响表型性状的基因位点的方法,可用于分析复杂疾病中的相关遗传机制。但该方法主要侧重于主效基因的检测,忽略了基因与基因之间的相互作用,即上位性。贝叶斯网络在因果关系构建方面具有独特的优...
- 杨晨
- 关键词:人工蜂群贝叶斯网络
- 文献传递
- 一种整数线性规划优化贝叶斯网络的上位性位点挖掘方法
- 本发明涉及一种整数线性规划优化贝叶斯网络的上位性位点挖掘方法,包括S1‑S4四个步骤。首先使用条件互信息计算,并经过扩张、收缩和检查一致性三个阶段,得到每个节点的马尔科夫毯,将每个节点的马尔科夫毯作为其候选父节点集,构建...
- 刘建晓杨轩杨晨雷继萌
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- 再生稻肥料管理对不同品种产量和品质的影响被引量:12
- 2022年
- 【目的】探明肥料管理、品种及其互作对再生稻头季和再生季产量和品质的影响,为再生稻高产优质育种和栽培提供理论依据。【方法】采用大田试验的方法,以4个华中地区主推的再生稻品种为材料,设置4种肥料管理方法,分别测定水稻的产量和产量构成因素、稻米品质(加工品质和外观品质)、干物质生产及相关农艺性状等。【结果】相比推荐施肥对照(CK),全生育期施用再生稻专用缓释肥(SRF)使两季施肥的次数从5次减少到3次,而且产量在头季和再生季分别达8.86和6.39 t/hm^(2),较CK仅降低了6.2%和9.1%。SRF在头季减产主要归因于较低的结实率,而在再生季减产是每穗颖花数和总颖花数共同下降的结果。促芽肥施与不施对再生季产量没有影响。再生稻两季的加工品质和外观品质主要受品种的影响,肥料处理及其与品种的互作影响很小。相比其他3个品种,甬优4949的头季和再生季产量最高,加工品质和外观品质最好。【结论】施用专用缓释肥和省施促芽肥均能够在不大幅损失稻谷产量的同时减少施肥次数促进再生稻轻简化栽培。
- 杨晨郑常袁珅徐乐彭少兵
- 关键词:肥料管理再生稻稻米品质缓释肥
- 基于k-tree优化贝叶斯网络的上位性位点挖掘方法
- 本发明提供一种基于k‑tree优化贝叶斯网络的上位性位点挖掘方法。均匀抽样蒲公英代码,得到每个节点的邻居节点集合,构建对应的特征树结构;利用与k‑clique中节点进行合并组成新节点的方法,构建得到包括大规模SNP位点和...
- 刘建晓阚裕隆杨晨杨轩王李光
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- 基因枪介导的抗穗发芽基因转化小麦的研究
- 小麦穗发芽(Pre-harvest sprouting)是世界性的自然灾害,每年给小麦生产者造成重大经济损失。长期以来,采用传统育种方法难以有效实现小麦穗发芽抗性的提高,因此,利用转基因技术将穗发芽抗性基因转入小麦,成为...
- 杨晨
- 关键词:小麦穗发芽基因枪BARPMI
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- 一种人工蜂群优化贝叶斯网络的上位性位点挖掘方法
- 本发明涉及生物信息技术领域,提供了一种人工蜂群优化贝叶斯网络的上位性位点挖掘方法,包括S1‑S4四个步骤。本发明的一种人工蜂群优化贝叶斯网络的上位性位点挖掘方法,首先利用扩张、收缩、对称性检测三个阶段,通过条件互信息计算...
- 刘建晓杨晨高辉杨轩黄穗宇阚裕隆
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- 一种基于遗传禁忌和贝叶斯网络的上位性位点挖掘方法
- 本发明公开了一种基于遗传禁忌和贝叶斯网络的上位性位点挖掘方法,包括:1、将基因型数据转换为二进制表示的布尔型数据;2、利用逻辑与操作快速地计算任意SNP位点对与表型间条件互信息,取出top‑N节点对,构建包含SNP位点的...
- 刘建晓果杨钟芷漫杨晨胡江峰蒋雅玲梁子珍高辉
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- 基因枪介导的转Vp-1基因小麦的获得及检测被引量:1
- 2014年
- 为了探究源于玉米的抗穗发芽基因Vp-1改良小麦(Triticum aestivum L.)抗穗发芽性状的可行性,以pmi及bar为筛选标记基因,通过基因枪介导法将Vp-1基因导入小麦栽培品种郑麦9023幼胚愈伤组织中,用甘露糖和双丙氨磷(Bialaphos)2种不同的筛选剂筛选得到抗性植株并对其进行PCR鉴定。结果显示,通过pmi/甘露糖筛选体系得到53株抗性植株,其中5株为转基因小麦植株,转化率为0.29%;通过bar/Bialaphos筛选体系得到152株抗性植株,其中11株为转基因小麦植株,转化率为0.78%。
- 杨晨黄涛
- 关键词:AESTIVUM基因枪转化BAR基因
- 一种基于遗传禁忌和贝叶斯网络的上位性位点挖掘方法
- 本发明公开了一种基于遗传禁忌和贝叶斯网络的上位性位点挖掘方法,包括:1、将基因型数据转换为二进制表示的布尔型数据;2、利用逻辑与操作快速地计算任意SNP位点对与表型间条件互信息,取出top‑N节点对,构建包含SNP位点的...
- 刘建晓果杨钟芷漫杨晨胡江峰蒋雅玲梁子珍高辉
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