胡军华
- 作品数：4 被引量：29H指数：3
- 供职机构：中国农业科学院烟草研究所更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 番茄C2H2型锌指蛋白的鉴定及生物信息学分析被引量：12
- 2018年
- 植物C2H2型锌指蛋白转录因子广泛参与植物的生长发育及对逆境应答反应等生命过程。为了更好地理解番茄中C2H2型锌指蛋白转录因子的种类和数量,利用番茄基因组数据库,鉴定出92条番茄C2H2型锌指蛋白。蛋白质理化分析结果表明,不同亚家族成员的氨基酸长度差异较大,且多为碱性氨基酸;进化树分析结果表明,所有C2H2家族成员被分为5个亚家族,每个亚家族成员数量差异较大;结构域分析显示每个成员都含有C2H2结构域,同一亚家族间结构域的数量、种类、分布具有一致性;染色体定位结果显示,有91个成员定位在12条染色体上;组织表达分析结果表明,C2H2转录因子基因家族成员在各个组织中都有表达,表达量具有差异性。本研究将为番茄C2H2型锌指蛋白的生物学功能分析提供参考。
- 胡军华王大伟杨明磊王新朱海朱佩刘贯山
- 关键词：C2H2型锌指蛋白番茄生物信息学进化树结构域染色体定位
- 普通烟草长叶柄突变性状的遗传分析被引量：2
- 2017年
- 叶柄是烟草叶片的重要组成部分,烟草长叶柄性状遗传分析可用于研究烟草叶柄和叶片的发育。利用甲基磺酸乙酯(EMS)诱变普通烟草烤烟品种中烟100和红花大金元各获得一个(极)长叶柄突变体(M48和M50),将两个突变体分别与各自的野生型中烟100和红花大金元及普通烟草烤烟品种革新三号杂交获得F_1,F_1自交获得F_2群体,F_1与其相应的野生型亲本回交获得BC_1F_1群体。对各类型材料进行表型调查和统计分析结果显示:F_1均表现为(极)长叶柄突变表型,在F_2群体和BC_21F_1群体中,经χ~2检验,(极)长叶柄突变表型与野生型表型的理论分离比均符合3:1和1:1,表明(极)长叶柄突变性状由染色体上一对显性单基因控制。上述结果为进一步定位和克隆(极)长叶柄突变基因,揭示其在烟草叶柄和叶片发育中的作用奠定基础。
- 陈果吴新儒屈旭晁江涛向小华胡军华陈浣王新刘贯山王元英王绍美
- 关键词：普通烟草EMS诱变
- 普通烟草DREB转录因子的序列鉴定与表达分析被引量：4
- 2017年
- DREB转录因子含有一个保守的AP2/ERF结构域,在植物抗逆过程中起关键作用。利用生物信息学分析手段,以拟南芥DREB家族成员序列为参照,在普通烟草(Nicotiana tabacum)基因组公共数据库中鉴定出了68个DREB转录因子。对烟草DREB转录因子家族进行了理化性质、系统进化、保守结构域和表达分析。结果表明,普通烟草基因组编码68个DREB转录因子家族成员,氨基酸数目差异较大;系统发育分析表明,拟南芥和烟草的DREB转录因子共125个成员形成6个进化分支,其中烟草比拟南芥缺少A6分支;结构域分析表明,同一分支内的DREB转录因子的保守结构域以及motif具有高度的一致性;组织表达分析表明,大多数DREB家族基因在烟草中表达量较低,在衰老、干旱和病害胁迫下基因表达量较多。此研究将为烟草DREB转录因子的深入分析奠定了生物信息学基础。
- 胡军华王大伟杨明磊王新吴新儒吴华刘贯山
- 关键词：DREB转录因子普通烟草生物信息学
- 烟草C2H2锌指蛋白转录因子家族成员的鉴定与表达分析被引量：16
- 2016年
- C2H2锌指蛋白转录因子家族在真核生物中具有重要的生物学功能,广泛参与植物叶的发生、花器官的调控、侧枝的形成及逆境胁迫等生命过程。植物C2H2锌指蛋白不仅结合DNA和RNA,而且与蛋白质之间相互作用。本研究利用普通烟草(Nicotiana tabacum)基因组数据库,运用Blastp比对,结合Pfam和SMART分析,鉴定了118条普通烟草C2H2锌指蛋白家族成员;对烟草C2H2锌指蛋白家族进行了进化树分析、结构域分析、物理化学性质分析、染色体定位、基因结构分析、三维结构分析及组织表达分析等。结果表明:不同成员的氨基酸长度差异较大;系统进化及结构域分析显示,所有C2H2家族成员可以被分为5个亚家族,同一亚家族成员之间在结构域和理化性质上呈现较高一致性;每个成员都含有C2H2结构域,在数量上存在较大差异;将所有基因家族成员定位在22条染色体上;组织表达分析表明,每个C2H2亚家族都有成员在不同组织中表达,在叶及根中有些基因的表达量较高。
- 杨明磊晁江涛王大伟胡军华吴华龚达平刘贯山
- 关键词：烟草基因家族
