刘志新
- 作品数:9 被引量:13H指数:3
- 供职机构:中国科学院水生生物研究所更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划淡水生态与生物技术国家重点实验室开放课题基金更多>>
- 相关领域:生物学农业科学医药卫生更多>>
- 牛山湖浮游生物群落DNA指纹结构与物种组成的关系被引量:3
- 2009年
- 利用RAPD及DGGE指纹技术揭示牛山湖5个采样点浮游生物群落的DNA多态性,并定性地探讨其与物种组成的关系。结果如下:(1)从40条随机引物中筛选出9条引物,共获得93条谱带,多态率为58%;各采样点所得谱带平均为67条,其中Ⅰ站最少,为61条,Ⅴ站最多,为74条;(2)PCR-DGGE指纹图谱共含102条谱带,其中原核生物56条,真核生物46条,谱带总数以Ⅲ站、Ⅳ站和Ⅴ站较多,Ⅰ站和Ⅱ站较少;(3)5个采样点共观察到62种/类浮游生物,其中Ⅰ站和Ⅱ站种类较少,Ⅲ站、Ⅳ站和Ⅴ站种类较多,分布概率在100%的种类达19种。多维尺度(MDS)分析表明:基于RAPD指纹和DGGE指纹,Ⅰ站和Ⅱ站最相似,Ⅲ站、Ⅳ站和Ⅴ站最相似;基于物种组成,Ⅳ站和Ⅴ站相似性最高,Ⅲ站和Ⅳ站次之,相对RAPD指纹和DGGE指纹,Ⅰ站和Ⅱ站相似性较低。研究表明:浮游生物群落DNA指纹结构与物种组成有一定的相关性,可能因部分物种信息的缺失导致些许偏差。
- 吴利余育和冯伟松张堂林邓文娜张翔刘志新
- 关键词:浮游生物RAPDDGGE物种组成
- 草鱼血清诱导下柱状黄杆菌主要膜相关蛋白酶基因的表达研究
- 刘志新谢海侠李楠姚卫建聂品
- 关键词:柱状黄杆菌
- 柱状黄杆菌外膜蛋白中免疫原性蛋白的筛选与鉴定
- <正>柱形病是一种全球性的危害极广的水产动物细菌性疾病,其病原为柱状黄杆菌。开展柱状黄杆菌疫苗的研究能为柱形病的有效防治奠定基础。细菌的外膜蛋白是细菌与细胞外环境相互作用的界面,容易被宿主识别,而被认为是开发基因工程疫苗...
- 罗璋刘志新聂品
- 文献传递
- 草鱼免疫球蛋白重链基因及其基因座的研究
- 硬骨鱼类免疫球蛋白(Ig)目前发现三大类,即IgM、IgD和IgZ/IgT,三类免疫球蛋白都具有分泌型和膜结合型。同时,硬骨鱼类免疫球蛋白重链基因座一般以(VH)n–(D)n–(JH)n–(Cζ)–(D)n–(JH)n–...
- 陈善楠罗璋肖凡书刘志新汪亚平聂品
- 关键词:草鱼免疫球蛋白
- 文献传递
- 东湖天蓝喇叭虫(Stentor coeruleus)种群的离散分化
- 2007年
- 利用筛选的12条10 bp的随机引物对采自武汉市东湖(3个样点)、南湖(3个样点)、月湖(1个样点)和关桥(1个样点)四个水体的天蓝喇叭虫(Stentor coeruleus)种群进行了随机扩增多态DNA(RAPD)研究,所得清晰条带显示不同样点样本之间存在着一定的变异,其遗传距离在0.076-0.416之间.用Rapdistance 1.04构建聚类图并探讨不同样点之间的遗传距离远近.结果显示南湖的3样点的遗传距离较近,在聚类图上聚成一枝,应该为同一个种群;而东湖的3个样点可能是由于地理隔离原因,在聚类图上有2个样点聚成一枝,而另1个样点被其他样点所分隔,不属于同一个种群.这种现象的发现从实例上支持了生物地理学关于物种形成的离散假说.更有意义的是本研究可启动水体微生物种群分化和物种形成及过渡的研究,并期望促进种群生态学方面的研究和谱系生物地理学及离散分化生物地理学的发展.
- 刘志新龚迎春王爱芹王启烁余育和冯伟松
- 关键词:RAPD种群
- 三峡库区浮游生物群落结构与DNA多态性比较分析被引量:6
- 2007年
- 以三峡库区所设A、B、C、D、E、F和G等7个站点为研究区域,利用RAPD技术就其浮游生物群落遗传多样性与物种多样性的关系进行了探索性研究.共鉴定出浮游生物41种,其中藻类4种,原生动物10种,轮虫类19种,枝角类4种,桡足类4种.物种组成相似性最高的是B站和C站,最低的是A站和F站.而站点间浮游生物群落遗传距离分析表明:相距最近的是C站与D站,最远的为D站与F站.树状聚类图也显示:各站点物种组成聚为一类;而DNA多态性RAPD最先聚在一起的是B与F,它们的对应枝由A、C、D、E构成,G单独成为一枝.研究表明,所发现的物种组成与所揭示的遗传多样性并未完全吻合.这或许是物种信息的缺失(如藻类与细菌),或许是RAPD技术的缺陷,或许两者所致.因此,本研究积累了三峡库区浮游生物群落遗传多样性的一些背景资料,而要阐释浮游生物群落遗传多样性与物种多样性之间的相互关系则有赖于应用灵敏的、重复性好的,且能分别分析原核和真核生物的DNA分子标记技术.
- 邓文娜余育和冯伟松颜庆云宋晓红刘志新
- 关键词:三峡库区浮游生物RAPD物种多样性
- 利用RAPD-PCR探讨天蓝喇叭虫生物群系分化被引量:1
- 2007年
- 选择天蓝喇叭虫(Stentor coeruleus)作为研究对象,对武汉市南湖、月湖、关桥3个水体共5个样点天蓝喇叭虫(S.coeruleus)样本的总DNA进行随机扩增多态DNA聚类分析,以检测各个样本的遗传相似性和趋异程度,借以评估样本间的遗传变异度。结果如下:(1)从98条随机引物中筛选12条引物共扩增出89条大小为100~1500bp的清晰条带,平均每条引物扩增出7.4条片段。(2)用Rapdistance1.04分析显示,不同样点样本之间存在着一定的变异,其遗传距离在0.076~0.416之间。(3)构建的聚类图中,南湖3个样点的遗传距离较近,在聚类图上聚成一枝,应该为同一个种群。本试验将为探讨水体原生动物迁徙能力对生物群系分化的影响积累实例资料,更希望可以促进水体原生动物的研究和种间过渡区本质及物种扩散行为的研究。
- 刘志新龚迎春王爱芹余育和冯伟松
- 关键词:RAPD
- 草鱼免疫球蛋白重链基因及其基因座的研究
- 硬骨鱼类免疫球蛋白(Ig)目前发现三大类,即IgM、IgD和IgZ/IgT,三类免疫球蛋白都具有分泌型和膜结合型。同时,硬骨鱼类免疫球蛋白重链基因座一般以(VH)n-(D)n-(JH)n-(Cζ)-(D)n-(JH)n-...
- 陈善楠罗璋肖凡书刘志新汪亚平聂品
- 关键词:草鱼免疫球蛋白
- 原生动物单细胞PCR应用初探--以天蓝喇叭虫为例被引量:3
- 2008年
- 以天蓝喇叭虫(Stentor coeruleus)为研究对象,探索了单细胞单基因PCR扩增及单细胞全基因组PCR扩增技术在原生动物中的应用.经过不断探索和优化条件后,试验取得了理想的结果.在40例单细胞单基因(SSU rDNA基因全序列)PCR的一次性扩增中,新鲜细胞和经过中性红染色的细胞都获得了100%的成功率,室温下酒精(95%)保存一周的细胞获得了82.5%的成功率.在单细胞全基因组PCR扩增中,采用高效高保真的phi29DNA聚合酶结合随机引物(Random Primer)进行扩增,获得了丰富且质量较高的PCR产物.以全基因组扩增产物(稀释10倍)对四个常用的基因位点(TEF1、SSU rRNA、18S-ITS1-5.8S、a-tubulin)进行扩增,均成功获得相应的基因片断.
- 刘志新余育和
- 关键词:原生动物