李亚军 作品数:16 被引量:93 H指数:6 供职机构: 四川农业大学动物医学院 更多>> 发文基金: 四川省科技支撑计划 长江学者和创新团队发展计划 更多>> 相关领域: 农业科学 更多>>
兔出血症病毒可视化RT-LAMP检测方法的建立与应用 被引量:2 2017年 为建立一种可视化的兔出血症病毒RT-LAMP检测方法,根据兔出血症病毒(rabbit hemorrhagic disease virus,RHDV)的主要结构蛋白VP60基因的序列设计合成4条特异性引物,以重组pMD19-T-VP60质粒为模板,通过反应条件与反应体系优化,建立RHDV的环介导等温扩增(LAMP)检测方法,测定RT-LAMP对RHDV的最低检测限,并与普通RT-PCR进行比较。结果显示,该RT-LAMP的最佳反应温度为62℃,反应时间为40 min,对RHDV的最低检测限为50 copies/L,常规RT-PCR的检测限为5×10~3copies/L,表明建立的RT-LAMP的灵敏度显著高于常规RT-PCR。建立的RT-LAMP的全部反应可在1 h内完成;反应结束后加入荧光染料Et Br可肉眼判定粉色为阳性,而棕色则为阴性,且与兔巴氏杆菌、大肠杆菌、沙门菌、产气荚膜梭菌、无乳链球菌及肺炎克雷伯菌无交叉反应。上述结果表明,建立的RT-LAMP简便、快速、灵敏、特异,且不需昂贵仪器设备,适合在基层推广应用。 刘星星 耿毅 孙娜 陈勤 杨泽晓 李亚军 牟维豪关键词:兔出血症病毒 RT-LAMP RT-PCR VP60基因 兔源大肠杆菌对喹诺酮药物耐药性及质粒介导的耐药基因检测 被引量:16 2016年 为了解四川省兔源大肠杆菌(E.coli)对喹诺酮药物耐药性及质粒介导的喹诺酮耐药(PMQR)基因的携带情况,本研究从四川地区规模化家兔养殖场共分离鉴定出97株E.coli,采用Kirby-Bauer(K-B)纸片法对分离株进行喹诺酮药物耐药性测定,同时采用PCR方法对qnrA、qnrB、qnrC、qnrD、qnrS、qnrVC、aac(6')-Ib-cr、qep A、oqx A、oqx B等PMQR基因进行检测。结果显示:分离株对左氧氟沙星耐药率最高为49.48%,对依诺沙星、诺氟沙星、恩诺沙星、氧氟沙星和环丙沙星的耐药率依次为48.45%、46.39%、39.17%、35.05%和34.02%;PMQR检测发现:aac(6')-Ib-cr检出率最高为80.4%,qnrD、qnrS、oqxA和oqxB,检出率分别为59.8%、59.8%、63.9%和51.5%,未检出qnrA、qnrB、qnrC、qnrVC和qepA。本研究通过对97株兔源E.coli对喹诺酮药物的耐药性及相关PMQR基因检测,初步明确四川地区兔源大肠杆菌对喹诺酮药物的耐药情况及PMQR的流行情况,为该地区家兔大肠杆菌病的防治中有效使用喹诺酮类药物提供参考。 坤清芳 耿毅 余泽辉 李亚军 牟维豪 邓钊宾 张雨薇 王官关键词:大肠杆菌 喹诺酮类药物 耐药性 拟态弧菌感染黄颡鱼的动态病理损伤及病原分布研究 被引量:7 2017年 以1.0×106CFU·m L^(-1)拟态弧菌(Vibrio mimicus)浸浴感染黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco),于第0、第4、第8、第16、第24、第36、第48、第60、第72小时剖杀取样,研究病理损伤及病原菌的体内动态分布。结果显示,皮肤肌肉、鳃、肠道出现病变最早,其中皮肤肌肉损伤最严重。第16小时表皮变性、坏死,鳃上皮肿胀,肠绒毛水肿;第24~第48小时表皮坏死、脱落,真皮严重出血,肌纤维变性、坏死,鳃出血,上皮局部坏死,肠上皮变性与灶性坏死;第48~第72小时皮肤肌肉坏死更严重,形成溃疡灶,鳃灶性坏死。肾、肝、脾与心36 h后相继出现不同程度的淤血、出血,变性和灶性坏死。q PCR检测发现,第4小时即在鳃、肠、皮肤肌肉检出病菌,细菌含量分别为1.3×102CFU·mg^(-1)、2.6×102CFU·mg^(-1)、4.7×102CFU·mg^(-1);鳃与皮肤肌肉中菌量随时间延长而增加,第72小时皮肤肌肉中菌量达到4.5×107CFU·mg^(-1);第24小时后相继在肾、肝、脾、心检出病菌,菌量介于1.9×10~4.7×102CFU·mg^(-1)之间。结果表明皮肤、鳃和肠道是病菌的入侵位点,并在体内多组织、器官分布。 陈成 耿毅 汪开毓 余泽辉 陈德芳 欧阳萍 黄小丽 李亚军 唐俊辉关键词:黄颡鱼 拟态弧菌 病理损伤 病原分布 鱼源无乳链球菌分子特性及两株不同血清型菌株表型与基因组学的比较研究 无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)是一种宿主范围广泛的革兰氏阳性链球菌,不仅能引起新生儿脑膜炎和奶牛乳腺炎,而且可感染多种养殖鱼类,给水产养殖业造成巨大损失。现有研究发现血清Ⅰa型与Ⅲ型是人源... 李亚军关键词:表型特征 文献传递 四川兔源金黄色葡萄球菌毒力检测及分子分型 被引量:13 2017年 【目的】研究四川部分区域兔源金黄色葡萄球菌Staphylococcus aureus的基因型总体结构特征、遗传变异以及毒力因子的分布情况。【方法】从四川地区分离41株兔源金黄色葡萄球菌,鉴定fem B基因特异性,进行耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(Methicillin-resistant S.aureus,MRSA)筛选,并通过PCR法检测13种常见的毒力基因,采用多位点序列分型(Multilocus sequence typing,MLST)和脉冲场凝胶电泳(Pulsed field gel electrophoresis,PFGE)确定基因型特征。【结果】41株金黄色葡萄球菌中共检测出MRSA 31株,检出率为75.61%;共检出9种毒力基因,其中nuc、hla、eta和clf A在所有菌株中均存在,而sea、sec、see、hlb和PVL的阳性检出率分别为9.7%、85.4%、80.5%、90.2%和7.3%。MLST分型结果显示,41株金黄色葡萄球菌只存在2种序列型(ST398、ST3320)和1个克隆群CC398,其中ST398为优势序列型,所占比例为97.6%。PFGE将41株金黄色葡萄球菌分为18个基因型,但不同区域间的基因型条带差异较小。【结论】四川调查区域兔源金黄色葡萄球菌毒力因子携带率较高,其对家兔的养殖业存在较大的安全威胁;分型分析说明四川部分区域金黄色葡萄球菌的主要流行菌株遗传变异程度小,菌株间亲缘关系较近。 向正刚 耿毅 张雨薇 杨泽晓 欧阳萍 李亚军 牟维豪 王世震关键词:金黄色葡萄球菌 毒力基因 多位点序列分型 脉冲场凝胶电泳 基因分型 RNA干扰对大鲵蛙病毒主要功能基因表达及其增殖的影响 被引量:2 2017年 采用q PCR与病毒滴度测定观察RNA干扰(RNA interference,RNAi)对大鲵蛙病毒(Chinese giant salamander ranavirus,CGSRV)主要衣壳蛋白(major capsid protein,MCP)、甲基转移酶(methyltransferases,MTases)、DNA多聚酶(DNA polymerase)基因表达与病毒增殖的影响。结果表明,小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)能推迟鲤鱼上皮瘤细胞(epithelioma papillosum cyprini,EPC)出现病变,且病变程度也较对照组轻。在各功能基因表达量上,NC-FAM对照组与阴性对照组差异不显著(P>0.05);而干扰组的干扰率极显著高于阴性对照组,其中siR-DP-1组siRNA对MCP基因的干扰率为79%,极显著高于其余组(P<0.01);siR-MT-1、siR-MT-2组siRNA对MTases基因的干扰率为77%,极显著高于其余组(P<0.01);siR-DP-1组siRNA对DNA polymerase基因的干扰率为79%,极显著高于其余组(P<0.01)。干扰实验组病毒滴度与NC-FAM对照组和阴性对照组相比也有不同程度的降低。阴性对照组lg TCID50为8.362,NC-FAM对照组lg TCID50为7.848,siR-MCP、siR-MT、siR-DP实验组最低lg TCID50分别为5.764、5.317、5.362。证实RNAi能够抑制CGSRV主要功能基因的表达并影响病毒的复制。 牟维豪 周燕 耿毅 汪开毓 余泽辉 李亚军 黄小丽 欧阳萍 陈德芳关键词:RNA干扰 基因表达 病毒滴度 四川兔源大肠埃希菌的耐药性及耐药基因检测 被引量:6 2018年 从四川地区规模化家兔养殖场分离鉴定出97株大肠埃希菌(Escherichiacoli),采用Kirby–Bauer纸片法进行耐药性测定,同时采用PCR方法对相关耐药基因进行检测。结果显示:分离菌株对四环素类药物表现高度耐药,耐药率高达90.72%以上,对磺胺类药物的耐药率达72.16%,对氨基糖苷类药物的耐药率31.96%~58.76%,对多肽类的耐药率较低,为14.43%;耐药基因tet A、tet B、tet C、arm A、rmt B和flo R的检出率分别为61.86%、84.54%、16.49%、4.12%、3.09%和8.25%,未检出tet D、tet E、tet M、tet O、tet L、tet K、rmt A、rmt C、rmt D、rmt E、npm A和cfr基因。 坤清芳 耿毅 余泽辉 李亚军 牟维豪 谢航关键词:家兔 大肠埃希菌 耐药性 耐药基因 河南中牟地区斑点叉尾鮰突发性败血症病原分离及鉴定 被引量:16 2016年 为鉴定近期河南中牟地区斑点叉尾鮰突发性败血症的病原,本研究从患病濒死鱼中分离到3株致病菌并对其进行常规理化特性、分子生物学、病理学和致病性试验以及药敏性检测。结果显示,3株分离株理化特性与维氏气单胞菌(A.veronii)特征相符,与Gen Bank中登录的A.veronii的gyr B基因同源性达99%以上,在系统发育树上均与A.veronii聚为一族。病理学和致病性试验显示,病鱼鳃、肝、肾、脾、肠等组织器官具有典型病理变化,人工感染鱼出现与自然发病相似症状,并能够从发病鱼组织中再次分离到相同病原菌,以上结果表明3株分离株均为致病性A.veronii。药敏试验表明3株分离菌株均对氧氟沙星、氯霉素、多西环素3种药物敏感。本实验为中牟地区A.veronii的防治和自然感染A.veronii致病机理的研究奠定了基础。 刘韬 王二龙 汪开毓 朱琳 何洁 段靖 李亚军 贺扬关键词:维氏气单胞菌 斑点叉尾鮰 GYRB 病理损伤 黄河裸裂尻鱼无乳链球菌的分离鉴定与多位点序列分型 被引量:2 2016年 2015年10月四川省雅安市某养殖场的黄河裸裂尻鱼(Schizopygopsis pylzovi Kessler)暴发传染病,临床表现为神经症状,眼球、下颌和鳃盖等出血或无明显临床表现而突然死亡,内脏涂片见革兰氏阳性球菌。从病鱼的肝、脾和肾组织中分离到2株病原菌(ZYW151011,ZYW151012),通过人工感染、无乳链球菌种属特异性cfb基因(GBS-specific gene cfb,CAMP factor)的PCR检测和16S r RNA基因序列分析等方法对病原菌进行鉴定,发现2株病原菌均为无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)。2株病原菌16S r RNA序列(Gen Bank登录号:KU308396和KU308397)与Gen Bank中无乳链球菌16S r RNA序列同源性达99.8%。药敏试验结果表明,2株病原菌对头孢类和喹诺酮类药物敏感,而对强力霉素、氟苯尼考和阿莫西林等耐药。进一步通过荚膜多糖血清分型和多位点序列分型技术对病原菌进行分子特征分析,结果表明2株病原菌荚膜多糖血清型均为致病性Ia型;2株病原菌多位点序列分型均被鉴定为新的序列型ZST-1,与序列型为ST-261的亲缘关系最近,此新型ZST-1在gln A位点发生变异,提交序列到MLST数据库获得新的等位基因编号81(登录ID:BIGSdb_20151110 081850_13025_35759)。 张雨薇 耿毅 余泽辉 汪开毓 李亚军 牟维豪 曾毅仁 叶梦婷关键词:无乳链球菌 多位点序列分型 四种家兔呼吸道疾病病原多重PCR方法的建立与应用 被引量:4 2016年 为建立同时检测家兔肺炎克雷伯菌(K.pneum oniae)、兔病毒性出血症病毒(RH D V)、多杀性巴氏杆菌(P.m ultocida)和支气管败血波氏杆菌(B.bronchiseptica)的多重PC R方法,根据G en Bank中肺炎克雷伯菌的16S r RN A基因、RHDV的VP60基因、多杀性巴氏杆菌的ktm1基因和支气管败血波氏杆菌的ptx A基因的保守序列设计4对特异性引物,优化反应体系与反应条件,建立能同时扩增兔肺炎克雷伯菌(127bp)、RHDV(322 bp)、多杀性巴氏杆菌(457 bp)和支气管败血波氏杆菌(872 bp)相应基因的四重PCR方法。结果显示,该方法能单管同时特异性检测兔源肺炎克雷伯菌、RHDV、多杀性巴氏杆菌与支气管败血波氏杆菌,且对兔源金黄色葡萄球菌、无乳链球菌、大肠杆菌与魏氏梭菌等无特异性扩增,说明该方法具有较强的特异性。该方法的灵敏度分别为9.16、7.24×10-3、7.96、6.8×10-1pg/L。采用建立的方法对人工感染试验病例与临床样本检测结果表明,该方法能快速、特异地鉴别诊断4种病原的单独与混合感染,与单一PCR方法相比,无显著性差异(P>0.05)。该方法的建立为临床上鉴别诊断4种家兔呼吸道疾病病原提供了重要的技术手段。 邓钊宾 陈铭 耿毅 杨泽晓 坤清芳 汪开毓 李亚军关键词:兔病毒性出血症病毒 多杀性巴氏杆菌 支气管败血波氏杆菌 肺炎克雷伯菌 多重PCR 家兔