吕廷德
- 作品数：4 被引量：7H指数：2
- 供职机构：石河子大学动物科技学院更多>>
- 发文基金：国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 扩展莫尼茨绦虫DAZ基因的分离和cDNA序列分析被引量：2
- 2010年
- 为进一步研究扩展莫尼茨绦虫并以其作为模式生物提供基础。通过构建的扩展莫尼茨绦虫成虫cDNA文库,随机挑取重组阳性克隆进行测序,对部分序列进行引物步移法测序,获取其全长cDNA序列;采用生物信息学等技术对该cDNA序列进行开放阅读框(ORF)的寻找、编码氨基酸的推导、核苷酸和氨基酸同源性比较以及蛋白质结构的初步预测。结果显示:获得了1个扩展莫尼茨绦虫新基因DAZ基因,cDNA全长1905bp,包含1个完整的ORF,编码562个氨基酸,登录号为:GH291478。蛋白理论分子量为61.3169kD,等电点为4.77,不稳定系数50.27,脂肪系数65.04,总平均亲水性-0.472。二级结构预测该蛋白有1个跨膜区域,以无规卷曲(L)为主,没有二硫键结合位点。本研究成功分离扩展莫尼茨绦虫DAZ基因。
- 赵文娟朱建军吕廷德薄新文王新华
- 关键词：扩展莫尼茨绦虫
- 扩展莫尼茨绦虫反应元件结合蛋白基因的克隆和cDNA序列分析
- 2009年
- 克隆扩展莫尼茨绦虫(Moniezia expansa)新基因,通过生物信息学方法分析该基因的生物学信息,初步预测该基因的功能,为进一步研究扩展莫尼茨绦虫并以其作为模式生物,为人类的某些基因未知功能的研究提供基础。构建扩展莫尼茨绦虫成虫cDNA文厍,随机挑取重组阳性克隆进行测序,对部分序列进行引物步移法测序,获取其全长cDNA序列;在NCBI上对该cDNA序列进行开放阅读框(ORF)的寻找、编码氨基酸的推导、核苷酸和氨基酸同源性比较以及蛋白质二级结构的初步预测。结果:获得了1个扩展莫尼茨绦虫基因-应结合蛋白,全长1861bp,编码592个氨基酸,属于DUF 906家族,与曼氏血吸虫反应结合蛋白基因具有72.1%的同源性。编码蛋白的理论分子量为69.7653kDa,等电点为9.83。结论:获得了扩展莫尼茨绦虫反应结合蛋白的全长cDNA序列,对该基因功能的初步预测,它是一种基因转录因子,在扩展莫尼茨绦虫虫体中的具体作用机制目前还不清楚,推断该基因的功能在脊椎动物,乃至人类的基因功能研究中具有一定借鉴意义。
- 朱建军赵文娟张慧吕廷德薄新文
- 关键词：扩展莫尼茨绦虫表达序列标签
- 扩展莫尼茨绦虫引发酶蛋白基因的克隆和cDNA序列分析
- 2009年
- 分离和鉴定扩展莫尼茨绦虫(Moniezia expansa)新基因,为进一步研究该基因的功能奠定基础。构建扩展莫尼茨绦虫成虫cDNA文库,随机挑取重组阳性克隆进行测序,对部分序列进行引物步移法测序,获取其全长cDNA序列;采用生物信息学等分析技术对该cDNA序列进行开放阅读框(ORF)的寻找、编码氨基酸的推导、核苷酸和氨基酸同源性比较及蛋白质二级结构的初步预测。获得了1个扩展莫尼茨绦虫新基因——引发酶蛋白,全长1269 bp,编码422个氨基酸,属于AE_Prim_S家族。编码蛋白的理论分子质量为47.1598 ku,等电点为4.83。获得了扩展莫尼茨绦虫反应结合蛋白的全长cDNA序列,为该基因功能的试验性鉴定工作奠定基础。
- 吕廷德赵文娟朱建军王新华薄新文
- 关键词：扩展莫尼茨绦虫表达序列标签
- 绵羊生殖道抗菌肽cDNA克隆及真核表达载体构建被引量：5
- 2009年
- 绵羊生殖道抗菌肽(ORTAP40)是从中国美利奴绵羊生殖道分离的一种新型的阳离子抗菌肽,在绵羊发育早期的防御中起到了主要的作用。在本研究中,根据ORTAP40 N端氨基酸序列设计引物,利用3′RACE技术克隆了绵羊生殖道抗菌肽3′末端全长cDNA序列,并被GenBank收录,登录号为FJ514476,经过cDNA序列分析显示,ORTAP40是一个4.8 ku的小肽,与先期分离纯化的分子质量一致。作者随后参照巴斯德毕赤酵母(Pichia pastoris)密码子偏好性,设计并人工合成了OR-TAP40成熟肽目的基因片段,所合成的ORTAP40基因全长120 bp,通过基因重组的方法将目的基因克隆到pPIC3.5K和pPICZαA表达载体上,成功构建了重组酵母胞内表达载体pPIC3.5K-ORTAP40和外泌表达载体pPICZαA-ORTAP40,为抗菌肽的开发和应用奠定了基础。
- 库朝锋王新华薄新文张慧吕廷德李娜
- 关键词：抗菌肽CDNA克隆
