张娜
- 作品数:2 被引量:3H指数:1
- 供职机构:大连海洋大学更多>>
- 发文基金:辽宁省科学技术计划项目博士科研启动基金辽宁省科技厅基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 口虾蛄卵黄蛋白原(Vg)基因的初步研究被引量:2
- 2016年
- 为研究口虾蛄Oratosquilla oratoria卵黄蛋白原(vitellogenin,Vg)基因,利用cDNA末端陕速扩增(RACE)技术克隆口虾蛄坛基因cDNA全长序列(GenBank登陆号:KR422400),并应用相对实时荧光定量PCR技术检测雌雄口虾蛄不同组织、不同发育时期卵巢瞻mRNA的表达量。结果表明:口虾蛄增基因全长7727bp,其中5’端非编码区为36bp,开放阅读框(ORF)为7521bp,3’端非编码区为170bp,共编码2506个氨基酸:预测的氨基酸序列中存在1个长度为20个氨基酸的信号肽,1个类似于枯草蛋白酶的内切蛋白酶识别位点(RSKR),3个潜在的N-连接糖基化位点,1个在无脊椎和脊椎动物卵黄蛋白原中都比较保守的KALGNVG基序;对其结构域分析表明,口虾蛄Vg蛋白含有4种保守结构域,分别为卵黄蛋白原N端结构域(Vitellogenin_N)、血管性血友病因子(vWFD)和两种未知功能结构域(domainofun-known function)DUFl943与DUFl081;经NCBIBLASTP同源性比较,口虾蛄Vg氨基酸序列与其他甲壳类的相似性为46%~52%;系统发育分析结果显示,口虾蛄Vg单独聚为一支;实时定量PCR结果显示,15虾蛄瞻基因在性腺和肝胰腺中均有表达,在肌肉中均不表达,卵巢中增mRNA的表达量显著高于其他组织(P〈0.05),且15虾蛄坛mRNA的相对表达量随着卵巢的发育不断增加(P〈0.05),在成熟期时达到最高值,随后显著下降,坛mRNA表达量在卵巢中的变化规律可以作为了解15虾蛄性腺发育的有效指标。本研究结果为口虾蛄Vg蛋白的功能研究奠定了基础。
- 刘海映张娜闫红伟刘奇邢坤陈雷隋宥珍林原李成久郭良勇
- 关键词:口虾蛄分子克隆荧光定量PCR
- 口虾蛄高血糖激素基因全长cDNA的克隆及表达分析被引量:1
- 2016年
- 本文首次采用RACE技术获得口虾蛄(Oratosquilla oratoria)眼柄部高血糖激素(crustacean hyperglycemic hormone,CHH)基因cDNA全长序列,共2 421bp,5′UTR长度为180bp,3′UTR为1 821bp,开放阅读框(ORF)长420bp,编码139个氨基酸。预测蛋白二级结构α-螺旋23.74%,延伸链占23.02%,无规则卷曲占53.24%,预测分子量为15.47kD,等电点(pI)为7.049。CHH成熟肽包含6个CHH家族中位置保守的Cys残基,C端为GK,推断为ES型CHH基因。聚类分析表明:口虾蛄CHH和十足目CHH聚为同一个分支的两亚群,具有较近的亲缘关系。荧光定量PCR分析结果表明,CHH基因在肠中表达量最高,在眼柄、触角中有较高的表达量,在肌肉中表达量相对较低,在卵巢中表达最低,而在精巢中不表达。
- 刘海映张秀芹隋宥珍李宏俊邢坤姜玉声杨贵福陈雷张娜
- 关键词:口虾蛄分子克隆荧光定量PCR