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基于叶绿体基因组重建中国野生葡萄的系统发育关系: 2022年; 野生葡萄类群有一半以上分布在中国.学者们基于形态特征和核基因组对其系统发育关系进行了研究,但结果存在比较大的冲突,类群间的亲缘关系仍未明确.为探究基于叶绿体基因组重建的中国野生葡萄的系统发育关系与前人基于形态特征或核基因组的研究结果是否一致,本研究从已公布的重测序数据中组装出26个中国野生葡萄的叶绿体基因组,并使用联合分析和溯祖理论重建了这26个类群的系统发育关系.联合分析的结果将中国野生葡萄分成了3个分支,这与前人的研究结果也存在较大冲突;而基于溯祖理论的分析没有得到较高分辨率的系统发育关系,这可能是由于单个基因的系统发育信息比较低,限制了该理论的应用.另外,相对于编码区和非编码区数据,叶绿体全基因组数据对中国野生葡萄系统发育关系的解析能力较好.; 张丽娜何华勤田甜王亚男吴题郑英杰; 关键词：叶绿体基因组系统发育葡萄属

植物磷酸化蛋白质组学研究进展被引量：8: 2015年; 首先阐述了植物细胞蛋白质磷酸化的作用机制,并从植物磷酸化蛋白质的分离与鉴定技术、植物磷酸化蛋白质数据库及植物蛋白质磷酸化位点的预测工具,对植物磷酸化蛋白质组的研究进展进行综述.最后分析了植物磷酸化蛋白质组研究中亟需关注的3个问题,即磷酸化蛋白质的分离与鉴定技术的提升、位点预测工具的完善及蛋白质功能的分析.; 刘秋林钟月仙万伟峰田甜林授楷黄健薛李春艾玉芳柯玉琴何华勤; 关键词：植物磷酸化蛋白质组学

基于Meta-QTL和RNA-seq的整合分析挖掘水稻抗稻瘟病候选基因被引量：1: 2022年; 稻瘟病菌严重威胁水稻生产,且稻瘟病菌变异快导致抗稻瘟病品种在短短数年后就失去抗性。因此,不断挖掘新的抗稻瘟病基因对培育具有广谱抗病品种至关重要。本研究对43篇文献的783个抗稻瘟病QTL进行元分析,在12条染色体上鉴定到50个Meta-QTL (至少有2个原始QTL映射),平均区间距离为0.87 Mb,共计包含4718个区间基因。随后将抗稻瘟病Meta-QTL和RNA-seq进行整合分析,结果鉴定出2193个既定位于抗稻瘟病Meta-QTL区间上,又响应稻瘟病胁迫的显著差异表达的共同基因,其中22个基因已经克隆且被报道与水稻抗稻瘟病等逆境防御过程相关。此外,从上述共同基因中筛选出99个抗性基因类似物(resistance gene analogue,RGA)和112个转录因子(transcription factor,TF),对这些基因构建基因共表达网络图,基于连接度前20筛选出网络图的hub基因,其中OsJAMyb、bsr-d1和OsWRKY76已被报道与水稻抗稻瘟病相关,而OsSPL9参与水稻抗条纹病毒调控通路中,剩余hub基因作为重要的潜在抗性基因,有待进一步功能验证,为培育广谱抗性的水稻品种奠定基础。; 田甜陈丽娟何华勤; 关键词：水稻抗稻瘟病 RNA-SEQ 候选基因

利用太阳能和风能的山地作物灌溉系统及其应用分析被引量：1: 2015年; 首先对利用太阳能和风能的山地作物灌溉系统的构造和运行情况进行分析,然后研究其在山地茶园的应用效果.结果表明:在平均风速为4 m·s-1时,1级风力提水机结合太阳能节水灌溉控制系统,可管理4.3 hm2铁观音茶园的调亏灌溉,平均每天节省近10 k Wh电能;铁观音茶树叶片的净光合速率、蒸腾速率和气孔导度均显著高于无灌溉系统的茶树,但水分利用率显著低于无灌溉系统的茶树.; 何华兴田甜林授楷艾玉芳林军柯玉琴何华勤; 关键词：太阳能风能灌溉

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田甜