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卢姗
作品数:
1
被引量:9
H指数:1
供职机构:
吉林大学植物科学学院
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相关领域:
农业科学
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合作作者
王岩
吉林大学植物科学学院
方奎
吉林大学植物科学学院
唐心龙
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张静
吉林大学植物科学学院
李兆阳
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2009
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拟南芥基因组NBS-LRR类基因家族的生物信息学分析
被引量:9
2009年
【研究目的】对拟南芥(Arabidopsis thaliana)中含有核苷酸结合位点(Nucleotide binding site,NBS)和富含亮氨酸的重复序列(Leucine-richrepeat,LRR)类基因进行了分析。【方法】利用TAIR、Pfam网站,数据库和Chromosome Map Tool、MEGA3.0、ClustalX软件,分析确定NBS-LRR基因及其类型、染色体物理分布、系统发育学关系。【结果】在拟南芥全基因组中共有204个NBS-LRR类基因,大多位于1号和5号染色体上,其中71.6%的NBS-LRR类基因分布在基因簇内。对NBS-LRR类基因家族进行了氨基酸多序列比对和系统进化树分析,NBS-LRR类基因家族可分为四个亚家族。另外,NBS-LRR基因在进化过程中存在较多的复制现象。
王岩
李兆阳
唐心龙
卢姗
许鹏
张静
方奎
席景会
关键词:
拟南芥
基因家族
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