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翟文丹

作品数：2 被引量：1H指数：1
供职机构：东北大学信息科学与工程学院更多>>
发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
相关领域：自动化与计算机技术更多>>

合作作者

文献类型

  • 2篇中文期刊文章

领域

  • 2篇自动化与计算...

主题

  • 2篇蛋白
  • 2篇蛋白质
  • 2篇蛋白质鉴定
  • 2篇质谱
  • 2篇数据库搜索
  • 2篇白质
  • 2篇串联质谱
  • 1篇蛋白质序列

机构

  • 2篇东北大学

作者

  • 2篇毛克明
  • 2篇王国仁
  • 2篇于长永
  • 2篇翟文丹

传媒

  • 1篇小型微型计算...
  • 1篇东北大学学报...

年份

  • 1篇2010
  • 1篇2009
共 2 条 记 录，以下是 1-2
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排序方式：
一种基于信息论的蛋白质数据库搜索鉴定算法
2009年
为了有效地利用蛋白质串联质谱数据,提高蛋白质鉴定的准确性,提出了一种基于信息论的蛋白质数据库搜索鉴定算法——ITPIA(information theory based protein identification algorithm)算法.针对多肽串联质谱质量低、噪音多等问题,ITPIA算法利用了信息论中的熵理论提出了一种有效的实验串联质谱和多肽的理论质谱的匹配打分算法.该算法更大程度上从多肽串联质谱中获得蛋白质的结构信息.实验结果表明,ITPIA算法有效地提高了蛋白质鉴定的准确性.
于长永王国仁毛克明翟文丹
关键词：蛋白质鉴定串联质谱数据库搜索
一种新颖的蛋白质序列与其串联质谱的匹配打分算法被引量：1
2010年
为了有效的利用蛋白质串联质谱数据,提高蛋白质鉴定的准确性,提出一种基于KNN的蛋白质序列与蛋白质串联质谱的匹配打分算法.蛋白质序列与蛋白质串联质谱的匹配打分是蛋白质数据库搜索鉴定过程中的关键技术.然而,现有的算法没有很好的利用蛋白质串联质谱中离子的强度信息.针对此问题,本文根据质谱中离子的类型给出了全体离子的一个合理的划分,进而抽象出一个高维的强度特征向量,在已知的高精度的数据集上建立了强度匹配知识集合,最后基于KNN技术构造了序列和质谱的匹配打分算法.实验结果表明,本文算法更加有效的利用了蛋白质串联质谱的结构信息,提高了蛋白质鉴定的准确性.
于长永王国仁毛克明翟文丹
关键词：蛋白质鉴定串联质谱数据库搜索
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