孔娟娟
- 作品数：3 被引量：5H指数：1
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- 基于模糊综合评价方法对TP53家族的mRNA序列的分析及应用
- 2012年
- p53蛋白在人体肿瘤当中具有重要作用,它已成为癌症治疗的焦点.本文利用数学中模糊综合评价的方法通过建立隶属函数,对人类TP53、TP63以及TP73的mRNA序列及其蛋白质序列进行了分析,讨论了以不同碱基(a,c,g,u(t))结尾的密码子对它们的氨基酸亲疏水性的影响程度.结果表明:以碱基c结尾的密码子对TP53、TP63和TP73的氨基酸的亲疏水性的影响程度为非常强,以碱基u(t)结尾的密码子对其影响程度为强,以碱基g结尾的密码子对其影响程度为中,以碱基a结尾的密码子对其影响程度为弱.
- 孔娟娟王其强朱平
- 关键词：MRNA序列隶属函数
- 癌基因密码子间的距离和Y-内积表示及其应用
- 2011年
- 为了深入研究正常基因变为癌基因时,氨基酸亲疏水性的变化趋势,在已经建立的代数结构的基础上给出了全新的距离及Y-内积的定义,通过计算得出GF(7)上36个本原多项式及其根,并得出了对应的生物意义的表示,利用所建立的理论数学模型分析了在胃癌,食道癌,肺癌以及B细胞淋巴癌中的p53错义突变过程中氨基酸亲疏水性的变化.结果表明:当正常的基因变为癌基因且密码子的第2位碱基发生变化时,密码子间的距离不小于1;特别是当第2位碱基由A变为G,C时,其Y-内积的值为负值;由T变为G,C,A时,Y-内积的值则大于4.
- 朱平闫艳艳孔娟娟
- 关键词：密码子癌基因氨基酸
- 人类p53肿瘤蛋白的偏好性分析及其应用被引量：5
- 2011年
- 为了深入研究人类p53肿瘤蛋白,对七条最新的人类p53肿瘤蛋白的mRNA序列的偏好性及其同源性进行了分析。利用MEGA4.0(molecular evolutionary genetics analysis)软件的Distance功能得到七条基因的mR-NA序列及其相应的蛋白质序列的同源性,并通过比较它们的RSCU和QRSCU值,对p53基因发生突变时偏好使用同义密码子的情况进行了分析。研究结果表明,基于拟氨基酸编码方法能更明显地展示出它们对同义密码子的一致偏好性,并且p53基因发生突变时偏好使用以c/g结尾的密码子,研究结果对其癌变基因和肿瘤基因的研究有一定的意义。
- 孔娟娟朱平
- 关键词：MRNA序列同源性同义密码子
