易恒
- 作品数：2 被引量：22H指数：2
- 供职机构：中国海洋大学海洋生命学院更多>>
- 发文基金：江苏省海洋生物技术重点建设实验室基金国家高技术研究发展计划山东省908专项更多>>
- 相关领域：生物学天文地球更多>>
- 龙须菜5．8S rRNA和ITS区的克隆与系统学分析被引量：14
- 2009年
- 研究青岛产龙须菜居群内的遗传多样性和系统学分类,通过对龙须菜居群内不同个体的5.8S rRNA-ITS区(包括ITS1-5.8S rRNA-ITS2)进行PCR扩增和序列分析,得到扩增DNA片段长度均为1 066 bp,包含完整的ITS1(250 bp)、5.8S(159 bp)和ITS2(657 bp);利用GenBank数据库对Gracilaria(江蓠属)和Gracilariopsis属共20个物种的rRNA-ITS相应序列进行了比较和系统进化分析。结果表明,龙须菜和江蓠科19个物种中rRNA的5.8S区的长度和序列非常保守,而ITS区的长度和序列则变异较大,20种江蓠科物种的遗传距离在0.013～0.596之间,龙须菜在5.8S rRNA-ITS区特性上相比江蓠属物种与Gracilariopsis属物种更为相似;采用UPGMA法构建了这20种江蓠科物种的系统发育树;分析结果表明青岛产龙须菜的居群内不存在遗传差异,且应属于Gracilariopsis属,并且在江蓠科中较早分化,而龙须菜处于Gracilariopsis属中比较古老的位置。
- 李敏隋正红易恒张学成阎炳伦朱明
- 关键词：龙须菜系统发育
- 青岛裙带菜孢子体野生种群遗传多样性的AFLP分析被引量：8
- 2009年
- 采用优化的基因组总DNA提取方法,按照经典的AFLP分析路线,对30株青岛近海野生裙带菜（Undaria pinnatifida）孢子体种群内遗传多样性进行了AFLP分析。利用1对引物扩增出38条清晰可重复的带,其中32条呈现多态性,多态位点比例为84.21%,根据引物扩增的指纹图谱,计算出的种群内部平均观测等位基因数（Na）为1.8421、平均有效等位基因数（Ne）为1.3754、平均基因多样性指数,即Nei’s基因多样性指数（H）为0.2351,Shannon’s多样性信息指数（I）为0.3684。该种群内遗传距离的分布范围从0.0267-0.8044,结果显示,野生种群内个体间各项遗传指数水平均较高,种群内遗传变异丰富。聚类分析表明,在遗传距离为0.21的阈值处,30个个体划分为2大类群,推测青岛野生裙带菜进化上在遗传距离为0.21时发生第一次分化。
- 张东隋正红易恒仝舟包振民
- 关键词：裙带菜孢子体AFLP
