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彭武林
作品数:
2
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供职机构:
南昌师范学院
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发文基金:
江西省自然科学基金
江西省教育厅科学技术研究项目
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相关领域:
生物学
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合作作者
饶友生
南昌师范学院
王樟凤
南昌师范学院
柴学文
南昌师范学院
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机构
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作者
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饶友生
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彭武林
传媒
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江西农业大学...
1篇
生物信息学
年份
2篇
2013
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珍珠鸟(Taeniopygia guttata)小染色体基因表达的密码子偏性
2013年
从NCBI数据库(http:∥www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/mapview/map)下载珍珠鸟全部小染色体基因的cDNA序列,最终共有1 586个基因的CDS序列纳入统计分析。密码子的偏性分析使用CodonW(1.4.2)完成,初步确定了UUC、UCC、UCG等27个密码子为珍珠鸟小染色体基因表达的"最优"密码子。对应分析表明,影响珍珠鸟小染色体基因密码子使用的主要因素分别为GC3s、CDS的GC含量基以及因的表达丰度。珍珠鸟小染色体基因的密码子用法受到了基因碱基组成的显著影响,其密码子的偏性是碱基组成及选择等因素综合作用的结果。本研究的目的是系统探究珍珠鸟小染色体基因的密码子用法,探究鸟类基因表达的分子调控机制。
王樟凤
柴学文
黄润红
彭武林
饶友生
关键词:
珍珠鸟
密码子偏性
珍珠鸟(Taeniopygia guttata)Z染色体基因表达的密码子用法
2013年
从EMBL数据库下载珍珠鸟(Taeniopygia guttata)Z染色体全部基因的cDNA序列,共有610个基因的CDS序列纳入统计分析。使用CodonW(1.4.2)对CDS序列进行密码子偏性研究,确定了UUC、CUC、CUG等28个密码子为珍珠鸟Z染色体基因表达的"最优"密码子。对应分析表明,影响珍珠鸟Z染色体基因表达的密码子用法的主要因素分别为GC3s(同义密码子第3位的G C频率)、CDS的GC含量以及基因的表达水平。据此推论,珍珠鸟Z染色体基因表达的密码子偏性是核苷酸组成和选择等因素综合作用的结果。
王樟凤
柴学文
彭武林
黄润红
饶友生
关键词:
珍珠鸟
Z染色体
密码子
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