王春蕾
- 作品数:6 被引量:9H指数:2
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- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 一种快速检测细菌是否产多糖的方法
- 本发明公开了一种快速检测细菌是否产多糖的方法:提取待检测海洋细菌的总DNA,利用特异性引物对(GF,GR)和特异性引物对(FP1,FP2)进行PCR扩增,扩增产物经琼脂糖凝胶电泳检测,若能扩增出1230bp和600bp的...
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- 一种快速检测细菌是否产多糖的方法
- 本发明公开了一种快速检测细菌是否产多糖的方法:提取待检测海洋细菌的总DNA,利用特异性引物对(GF,GR)和特异性引物对(FP1,FP2)进行PCR扩增,扩增产物经琼脂糖凝胶电泳检测,若能扩增出1230bp和600bp的...
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- 文献传递
- 环境因子对海洋细菌Pseudoalteromonas agarivorans Hao2018胞外多糖构效关系的影响及组学分析
- 我国海洋面积大,海水中的微生物资源丰富,海洋细菌是其中数量最多的一类。由于生存环境的复杂性及特殊性,海洋细菌能够分泌结构新颖且有高生物活性的胞外多糖。胞外多糖在海洋细菌的自我保护过程中起着重要的作用。环境污染造成的海洋酸...
- 王春蕾
- 关键词:海洋细菌环境因子
- 文献传递
- 仿刺参采苗板上细菌的分离与鉴定
- 2017年
- 为了解仿刺参采苗板时期细菌的多样性,对分离自仿刺参采苗板上的细菌进行了分离和鉴定。应用常规生理生化鉴定、16S r DNA序列分析和构建系统发生树对其进行分子鉴定。结果表明:共分离得到19株海洋细菌,鉴定为7个属,包括短芽孢杆菌属(Brevibacillus sp.)、假交替单胞菌属(Pseudoalteromonas sp.)、Cobetia属、肠杆菌属(Enterobacter sp.)、芽孢杆菌属(Bacillus sp.)、普罗威登斯菌属(Providencia sp.)和海洋螺菌属(Oceanospirillaceae sp.)。从海洋环境中分离筛选细菌对海洋资源的开发与利用具有重要意义,此外对仿刺参育苗时期进行细菌种类的鉴定有助于疾病的预防和治疗,对仿刺参的水产养殖具有一定的指导意义。
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- 关键词:仿刺参细菌
- 基于高通量测序技术分析使它隆对玉米根系内生菌多样性的影响被引量:4
- 2018年
- 利用Illumina Miseq高通量测序技术,对玉米根系内生菌16S rRNA的V4~V5可变区序列进行测定,分析不同时期有杂草生长(长草组)与使用使它隆除草对玉米根系内生菌群落组成的影响。从5个玉米根系样品共得到166 647条有效序列、145 298条优质序列和4 464个细菌OTUs。Alpha多样性分析结果表明,玉米根系内生菌的群落多样性随玉米植株的生长而增加;使用使它隆除草后,群落的丰富度和均匀度在花期下降,在成熟期下降明显。对群落组成分析发现,使用使它隆除草后,与长草组相比,花期和成熟期的内生菌在门及属水平上的分布均发生较大变化。内生菌的基因功能分析表明,使用使它隆除草后,花期根系内生菌的异型生物质的降解代谢通路丰度高于未喷施使它隆的长草组样品;成熟期糖代谢通路丰度高于长草组。结果表明,喷施使它隆能降低玉米根系内生菌的多样性,并使内生菌的组成比例发生变化。花期根系内生假单胞菌属等比例的增加与异型生物质的降解代谢有关;成熟期肠杆菌属、芽孢杆菌属等比例的增加与糖代谢功能的提高有关。
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- 关键词:高通量测序使它隆玉米细菌多样性
- “使它隆”对玉米根部不同微生环境细菌群落多样性的影响被引量:4
- 2019年
- 【目的】研究除草剂"使它隆"施用后对玉米根部不同微生环境细菌群落结构和多样性的影响。【方法】利用Illumina Miseq高通量测序技术,对玉米根系内生菌、根际和非根际土壤细菌16S rRNA的V4–V5可变区序列进行测定,分析不同生长期喷施除草剂使它隆对玉米土壤细菌及根系内生菌群落结构和多样性的影响。【结果】本研究15个样品共得到544393条有效序列,333565条优质序列。多样本共有OTU分析表明,非根际和根际土壤的群落结构更为相似,在一定程度上说明玉米根部相关细菌的定殖具有选择性并且是从根际到根系逐步专一化。丰度等级曲线和Alpha多样性结果显示非根际和根际土壤群落的丰富度和均匀度较高,而玉米根系内生菌群落的丰富度和均匀度都比较低,且成熟期玉米根系内生菌群落的丰富度在施用除草剂使它隆后下降比较剧烈。群落组成分析发现,使它隆除草后,玉米根部相关细菌各时期在门及属水平上的分布都发生了较大变化。菌群代谢功能预测结果表明玉米生长从苗期到成熟期,微生物的生长压力逐渐加大,需要消耗更多的能量用于新陈代谢和环境适应。【结论】施用除草剂使它隆后会降低玉米根部土壤细菌群落的多样性,使它隆对成熟期玉米根系内生菌群落影响最为显著。
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- 关键词:高通量测序玉米使它隆细菌多样性