郭艳芳
- 作品数:4 被引量:12H指数:1
- 供职机构:南方医科大学基础医学院更多>>
- 发文基金:国家教育部博士点基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学更多>>
- PBL教学法在医学生物信息学实践教学中的应用被引量:11
- 2011年
- 实践教学是医学生物信息学课程的最重要的特点,改进实践教学方法是提高本课程教学质量的重要途径。探讨了在医学生物信息学实践课程中结合"基于问题的学习"(PBL)的教学思路与方法,为完善医学生物信息学教学提供参考。
- 郭艳芳李金明
- 关键词:生物信息学实践教学PBL教学法
- 通路分析提示钙信号转导通路与酒精依赖关联
- 2014年
- 背景:酒精依赖是一种严重而常见的复杂疾病,大量关联研究常致力寻找其易感基因,目前对已发现的遗传变异还缺乏整体的分析和认识。方法:采用基因富集通路分析法对来自31项饮酒相关研究的1438个单核苷酸多态性进行分析。结果:钙信号传导通路(hsa04020) (P = 5.4 ´10?5)显示出最显著的关联富集,经多重检验校正后仍显著(bonferroni P = 0.8 ´10?3, FDR = 0.6 ´10?2)。有研究证实钙信号转导通路在脑功能调节中必不可少,该通路中的基因与酒精对身体的抑郁作用有关。结论:钙信号转导通路可能对酒精依赖具有重要影响。
- 郭艳芳
- 关键词:全基因组关联研究通路分析酒精依赖
- 基因的单核苷酸多态性与乳腺癌关系的研究进展被引量:1
- 2014年
- 乳腺癌是女性发病率最高的恶性肿瘤,具有家族聚集性,其发生发展是一个复杂的过程,涉及多种不同基因的相互作用和相互调控。随着基因技术和分子生物技术的飞速发展,许多基因被揭示在乳腺癌的发生发展中起关键作用,如BRCA、FGFR、ATM、ZNF365、Pokemon基因等。基于流行病学研究,这些易感基因可被分为高外显率易感基因和低外显率易感基因,其多态性对乳腺癌具有重要的影响。对乳腺癌易感基因的研究有助于阐明乳腺癌的发生机制、发展过程,对其早期诊断、预后判断和良恶性鉴别也有着重要的意义,可为乳腺癌的临床生物基因靶向治疗提供新的靶点和理论基础。本文主要对这些基因的单核苷酸多态性与乳腺癌关系的研究进展进行了综述。
- 陈诗哲马天骏周文琪李金明郭艳芳
- 关键词:单核苷酸多态性乳腺癌BRCAFGFRATMPOKEMON
- 基因型估算法对全基因组关联荟萃分析的影响
- 2014年
- 目的:评估基因型估算技术对全基因组关联荟萃分析的影响,通过模拟量化基因型估算法关联分析的效率,为实践应用基因型估算法进行全基因组关联荟萃分析提供参考依据。方法:利用实际的Framingham全基因组关联研究构建子样本,在不同荟萃组合情况下,进行了大量的模拟实验,考察基因型估算技术对荟萃分析的统计功效的影响。结果:基因型估算引起显著的研究群体间异质性,由此导致关联荟萃分析的功效下降约20%~40%;使用随机效应模型控制因基因型估算引起的研究间异质性,关联荟萃分析的功效有所提高。结论:全基因组关联研究荟萃分析,若部分研究需要进行基因型估算,采用随机效应模型更为合适。
- 郭艳芳
- 关键词:全基因组关联研究