洪瑞
- 作品数：4 被引量：11H指数：2
- 供职机构：重庆师范大学更多>>
- 发文基金：重庆市科技攻关计划美国国立卫生研究院基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生语言文字更多>>
- 基于关联理论的冷笑话推理机制研究
- 幽默在人们交流中起着至关重要的作用，在任何一种语言和文化中都随处可见。冷笑话作为一种新兴的特殊的幽默，在近些年开始流行起来。在日常生活中，冷笑话用于创造愉悦和轻松的交流氛围，同时反映了讲冷笑话的人的幽默和机智。对冷笑话已...
- 洪瑞
- 关键词：语境分析
- 中华按蚊GSTO1基因的鉴定及生物信息学分析
- 2015年
- 谷胱甘肽S-转移酶(GST)是有机体内一类具有解毒和抗氧化等多功能的超家族蛋白酶。在昆虫中GST主要分为七大家族,Omega家族(GSTO)为研究较少的家族。在本研究中,通过Blast方法搜索中华按蚊(Anopheles sinensis)转录组数据,得到中华按蚊GSTO1cDNA序列,全长1 059bp,其中阅读框ORF长744bp,编码248个氨基酸。推测该基因编码蛋白的分子量和等电点分别为28.5kD和6.92。分析发现该蛋白不存在跨膜区和信号肽,亚细胞定位预测显示该蛋白质位于细胞质中。同源性分析表明GSTO1蛋白与达氏按蚊(Anopheles darlingi)氨基酸序列相似性最高。本研究进一步丰富了GST蛋白的基础数据,为进一步研究昆虫GSTO蛋白的功能奠定了理论基础。
- 洪瑞李可人吴传剑闫振天陈斌
- 关键词：S-转移酶基因生物信息学分析
- 中华按蚊CYP6P5基因的生物信息学鉴定及特征分析被引量：6
- 2014年
- 目的鉴定中华按蚊CYP6P5基因并分析其序列特征，为研究中华按蚊CYP6P5基因杀虫剂抗性机制提供理论依据。方法以催命按蚊基因CYP6P5为询问基因，基于中华按蚊转录组测序数据，采用双向Blast方法搜寻中华按蚊CYP6P5cDNA序列。利用生物信息学相关软件对该基因编码蛋白序列的一级结构、疏水区、跨膜区、结构域、3D结构等进行预测分析，并采用最大似然法（maximumlikelihood，ML）建立代表性蚊种的系统发育关系。结果搜索获得1条中华按蚊CYP6P5全长cDNA序列。该cDNA序列具备P450超家族和CYP6家族特征性的保守序列，命名为CYP6P5（GenBank登录号：KF358704）。该cDNA全长为1583bp，开放阅读框为1527bp，编码508个氨基酸，推测其相对分子质量为58．32×10-3，等电点为7．17。分析表明该基因编码的蛋白序列第5～21位氨基酸是疏水区，第5～22位氨基酸是跨膜区，第36～505位氨基酸是P450保守结构域，并具有多个酶活性位点。系统发育关系和相似性分析表明，中华按蚊CYP6P5与催命按蚊CYP6P5和冈比亚按蚊CYP6P5亲缘关系最近，形成一个单系，相似率分别为89．4％和89．0％。结论为进一步研究中华按蚊CYP6P5基因溴氰菊酯抗性的分子机制奠定了基础。
- 车燕飞张玉娟唐尧洪瑞陈斌
- 关键词：细胞色素P450中华按蚊生物信息学分析
- 中华按蚊CYP6Y亚家族基因的鉴定和生物信息学分析被引量：8
- 2014年
- 【目的】鉴定中华按蚊Anopheles sinensis CYP6Y亚家族基因,分析它们的结构和特征,推测其可能的功能。【方法】以冈比亚按蚊An.gambiae CYP6Y1作为询问序列,通过双向Blast方法检索中华按蚊转录组中CYP6Y亚家族基因,并通过生物信息学方法分析基因结构、特征及可能的功能。【结果】从中华按蚊转录组测序数据中鉴定出2条CYP6Y亚家族基因,分别命名为AsCYP6Y1(GenBank登录号:KF709397)和AsCYP6Y2(GenBank登录号:KF709398)。序列分析显示,AsCYP6Y1和AsCYP6Y2全长分别为1 713 bp和1 815 bp,分别编码502和526个氨基酸。基因结构分析显示,该亚家族基因仅含有1个相位1型内含子并与其他P450基因形成保守的共线性分布。蛋白结构分析显示,这2个基因编码的蛋白含P450特有的5个特征序列和6个底物结合位点,且均不存在信号肽,其亚细胞定位为细胞质。3D结构分析显示,AsCYP6Y1有18条α螺旋和13股反向平行的β折叠,AsCYP6Y2有19条α螺旋和11股反向平行的β折叠。通过同样的方法,在达林按蚊An.darlingi中也鉴定出2个CYP6Y亚家族基因。系统进化分析显示,AsCYP6Y1和AsCYP6Y2分别与其他3种按蚊的CYP6Y1和CYP6Y2聚成一支,Bootstrap值均大于90%。替换率分析显示,中华按蚊AsCYP6Y1和AsCYP6Y2与其他3种按蚊同源基因的Ka/Ks均小于1。相对进化速率分析显示,中华按蚊CYP6Y和CYP6M亚家族的相对进化速率均显著快于CYP6P亚家族,而CYP6Y和CYP6M亚家族之间没有显著差异。【结论】在中华按蚊和达林按蚊中存在2个CYP6Y亚家族基因,之前在冈比亚按蚊和不吉按蚊An.funestus中也发现2个CYP6Y亚家族基因,表明CYP6Y亚家族基因可能在按蚊属广泛存在,且可能为按蚊属昆虫所特有。
- 唐尧乔梁张玉娟车燕飞洪瑞陈斌
- 关键词：中华按蚊基因序列生物信息学分析基因结构
