金玲
- 作品数：3 被引量：22H指数：3
- 供职机构：沈阳农业大学林学院更多>>
- 发文基金：国家林业公益性行业科研专项更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 野杏经济性状SSR关联分析及优异等位变异挖掘被引量：6
- 2022年
- 【目的】为野杏优良性状基因挖掘、分子标记辅助育种及野杏资源的开发利用提供参考。【方法】以40个野杏无性系为研究对象,采用GLM模型,利用多态性较高的120对SSR引物对野杏20个重要经济性状进行关联分析,并通过无效等位基因对关联位点等位变异的表型效应进行分析,利用表型效应值找到最优无性系,获得典型载体材料。【结果】共获得64个与野杏经济性状显著关联的SSR位点(P<0.05),包括43个极显著相关联位点(P<0.01),64个位点的变异解释率为12.21%~77.48%,与产核量相关联的X44H位点的解释率最高。有40个位点分别与多个性状相关联,P1位点和X36位点分别与7个性状相关联,是关联性状最多的位点。除果形指数外,其余19个经济性状均受多个位点基因共同调控,表明这些性状可能存在连锁遗传,与核宽显著关联的位点最多,有18个。通过表型效应分析找出了406个有效等位变异,包含215个正向效应,190个负向效应,1个表型效应值为0。其中,122个有效等位变异同时对多个性状产生正向或负向效应,X19H-130的表型效应值最大,为4429.39,Y54-10的表型效应值最小,为-1501.23,二者均是与产果量相关联的等位变异。共挖掘出18个典型载体材料,其中210号、207号、164号、162号、211号、232号、241号、248号、198号分别携带了2个或2个以上优异等位变异。【结论】基于SSR的关联分析,筛选出与野杏重要经济性状相关联的优异等位变异及聚合优异等位变异的典型载体材料。
- 董胜君温佳星卢彩云陈建华刘权钢金玲
- 关键词：经济性状SSR等位变异
- 97个山杏无性系的遗传多样性及SSR指纹图谱被引量：14
- 2018年
- 【目的】山杏是北方半干旱地区重要的生态经济型树种,种质资源异常丰富,形态鉴定与分类难度大。利用SSR分子标记研究山杏优选无性系的遗传多样性并构建指纹图谱,以期为山杏种质鉴定提供科学依据。【方法】根据山杏简化基因组测序结果,合成600对SSR引物,利用4个山杏无性系进行引物筛选,选出155对扩增条带清晰的引物,对97个山杏优选无性系进行PCR扩增。应用引物组合法构建指纹图谱,采用非加权组平均法(UPGMA)进行聚类分析。【结果】利用155对SSR引物对97个山杏无性系进行扩增,共扩增出933个等位基因,每个位点的等位基因数为3~11个,平均为6.019个;各位点的多态性信息含量(PIC)为0.476~0.885,平均值为0.681,具有较高的多态性。50个山杏无性系在59个位点上具有特异等位基因,89个无性系在131个位点上具有特异基因型。采用5对引物(L56、X47H、L79H、P40H和X47)的组合可区分全部97个无性系,构建了指纹图谱。对97个山杏无性系进行亲缘关系分析,无性系间的遗传相似系数变化范围为0.669~0.943,平均值为0.757;基于遗传相似系数进行聚类分析,将97个无性系分为5大类,第1大类和第2大类下又分为3个亚类,分类结果与无性系的来源区域有明显的相关性。【结论】从600对SSR引物中筛选出155对,其扩增位点多态性较高、重复性较好。发现89个山杏无性系具有特异基因型,其中50个既具有特异基因型也具有特异等位基因。应用引物组合法构建了基于5对SSR引物扩增位点的山杏无性系指纹图谱。供试山杏无性系遗传差异较小,亲缘关系较近。研究结果可为山杏种质鉴别提供科学依据,也为山杏的育种工作奠定基础。
- 金玲刘明国董胜君吴月亮张欣
- 关键词：山杏无性系SSR指纹图谱
- 山杏SSR-PCR反应体系优化被引量：3
- 2017年
- 以4种山杏群体为试材,采用L16(45)正交实验设计,研究了适合4种山杏群体的SSR-PCR反应体系。结果表明:总反应体系为20μL,其中DNA模板量20ng,引物浓度0.15μmol·L^(-1),Mg2+2.0mmol·L^(-1),Taq聚合酶量1.0U,dNTPs 0.25mmol·L^(-1)。采用引物Y45对43个山杏无性系的DNA进行扩增,扩增产物在100~200bp,多态性良好,稳定度高,可以用于山杏SSR分子标记研究。
- 张皓凯董胜君刘明国仲维平卢彩云金玲
- 关键词：山杏SSR-PCR
