高战
- 作品数：2 被引量：12H指数：2
- 供职机构：海南大学农学院更多>>
- 发文基金：国家天然橡胶产业技术体系建设专项农业部农作物种质资源保护项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 利用EST-SSRs标记分析巴西橡胶树魏克汉种质的遗传多样性及遗传分化被引量：9
- 2010年
- 橡胶树魏克汉（Wickham）种质是指1976年英国人魏克汉在亚马逊河下游与塔帕若斯（Tapajos）河汇合处的博因（Boim）采集并培育46株母树繁殖的后代中选出的初生代及其后杂交的次生代至多生代栽培品种。本研究利用25对EST-SSRs引物,对中国热带农业科学院橡胶研究所国家橡胶树种质资源圃中保存的来自6个国家的278份魏克汉种质进行遗传多样性和遗传分化分析。种质总群体共检测出等位变异103个,平均等位基因数（Na）4.12个,稀有等位基因占全部等位基因的14.56%;平均期望杂合度（He）值和Nei平均多样性指数（H）值分别为0.4108和0.4100;聚类分析得到种质个体间的遗传距离（GD）为0~1.1632。不同国家种质群体间的遗传多样性指数（H）值：巴西〉斯里兰卡〉印度尼西亚〉中国〉马来西亚〉泰国,但经SPSS非参数检验表明6个国家群体之间的种质遗传多样性水平差异并不显著;不同国家种质群体间的遗传一致度（GI）为0.9812~0.9869,与中国种质的亲缘关系最近的是印度尼西亚、其次马来西亚、泰国、斯里兰卡、巴西;仅3%的遗传变异来源于不同国家种质群体间,不同国家种质间的平均基因流（Nm）为4.463,大而通畅的基因流是橡胶树6个国家群体间遗传分化水平很低的主要原因。研究结果表明,中国国家橡胶树种质资源圃保存的魏克汉种质的遗传多样性较差,但通过EST-SSRs可检测到丰富的稀有等位基因。虽然不同国家种质交流频繁,导致种质之间和不同国家来源种质之间遗传距离非常近,但是,种质之间和不同国家来源种质之间依然存在一定的遗传分化,特别是巴西种质与中国种质遗传距离最远,基因流最小,遗传多样性最为丰富。
- 龙青姨华玉伟高战杨金鑫黄华孙
- 关键词：橡胶树EST-SSRS遗传分化
- 橡胶树甲基化过滤文库的构建被引量：3
- 2010年
- 为高通量富集橡胶树基因编码序列,文章首次利用大肠杆菌McrBC限制修饰系统构建了巴西橡胶树基因组甲基化过滤文库。该文库未扩增和扩增后的滴度分别为2.6×106pfu/mL和9×109pfu/mL,阳性克隆率为86.4%,插入片段大小为1～2.5kb,平均长度为1.2kb。随机挑选100个克隆进行测序,共拼接出81个非冗余序列,其中包括6个重叠群(Contigs)和75个单一序列(Singlets),冗余度为17.35%。Blast分析发现,39.5%非冗余序列与Nr库中功能基因同源,14.81%与EST数据库中序列同源,32.1%序列为未知序列,且部分序列为开花调控、抗虫和抗病等功能相关的同源基因。橡胶树甲基化文库的建立为橡胶树重要功能基因发现和克隆提供一条重要途径。
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- 关键词：巴西橡胶树文库构建
