和世玉
- 作品数:5 被引量:16H指数:2
- 供职机构:石河子大学农学院园艺系更多>>
- 发文基金:国家科技攻关计划引导项目国家自然科学基金兵团科技攻关计划项目更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 适合库尔勒香梨SCoT分析用的DNA提取方法研究
- 2014年
- 【目的】有效利用SCoT分子标记法对库尔勒香梨优良营养系中相关基因,获得高质量基因组DNA,对目前常用的3种提取植物基因组DNA的方法进行比较研究,研究最适合库尔勒香梨SCoT分析的DNA提取方法。【方法】采用改良CTAB法,改良SDS法和试剂盒法从库尔勒香梨优良营养系的叶片中提取基因组DNA。采用NANODROP 2000核酸仪检测DNA浓度和纯度,并用1.2%琼脂糖凝胶电泳检测其完整性。以3种方法提取的基因组DNA为模板分别进行SCoT-PCR。【结果】改良CTAB法提取的基因组DNA的浓度为600~1 600 ng/μL,A260/A280为1.8~2.0,A260/A230〈2.0,电泳结果显示:有一条清晰的带,有拖尾现象,点样孔发亮;改良SDS法提取的基因组DNA的浓度为600~900 ng/μL,A260/A280为1.8~2.0,A260/A230为1.9~2.2,电泳结果显示:一条清晰的带,无拖尾现象只有一个点样孔发亮;试剂盒法提取的基因组DNA的浓度为100~200 ng/μL,A260/A280为1.8~2.0,A260/A230为2.2~2.5,电泳结果显示:一条清晰的带,无拖尾,无点样孔发亮现象,蛋白、多糖、酚类物质、RNA等去除彻底;以3种方法提取的基因组DNA为模板进行SCoTPCR,PCR产物电泳结果显示:试剂盒法提取的DNA可以扩增出7条清晰明亮的带,改良CTAB法提取的DNA只能扩增出4条清晰的带,改良SDS法提取的DNA只能扩增出2条带。【结论】比较目前常用的3种提取植物基因组DNA的方法,综合成本高低,毒性大小,步骤多少,时间长短,试剂盒法是最适合提取库尔勒香梨优良营养系叶片基因组DNA的方法。
- 和世玉牛建新
- 关键词:库尔勒香梨DNA提取
- 库尔勒香梨SCoT分子标记体系的建立和优化
- 建立和优化库尔勒香梨SCoT-PCR反应体系,可为梨树种质资源遗传多样性评价、分子标记辅助选择育种和库尔勒香梨优良营养系鉴定奠定基础。以新疆库尔勒农二师29团、33团和34团的优良营养系库尔勒香梨为材料,通过L_(25)...
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- 关键词:库尔勒香梨正交设计
- 梨SCoT-PCR反应体系的优化及‘库尔勒香梨’营养系变异鉴定被引量:10
- 2016年
- 【目的】建立稳定性好、可重复性强、多态性扩增效果好的‘库尔勒香梨’SCoT-PCR反应体系,证明SCoT分子标记可以用于梨属植物优良营养系的鉴定。【方法】以新疆库尔勒农二师29团、33团和34团的‘库尔勒香梨’优良营养系为试材,通过L25(56)正交试验设计对‘库尔勒香梨’SCoT-PCR反应体系进行筛选,并对扩增反应程序进行优化,运用正交设计直观分析法和正交设计助手Ⅱ软件对正交设计扩增结果进行分析,从筛选出的20个引物中随机选择2条引物对24份材料扩增,用DNAMAN、Editseq、ORF Finder和NCBI-BLAST-tblastx对测序结果分析。【结果】优化后的香梨SCoT-PCR 20μL反应分析体系含(2.5 mmol·L^(-1)10×buffer with Mg^(2+))2.5μL、Taq酶1.5 U、引物10μmol·L^(-1)、模板DNA25 ng、dNTPs 1.6 mmol·L^(-1)。反应程序为94℃预变性4 min;94℃变性1 min,52℃退火45 s,72℃延伸1 min,30次循环;72℃延伸8 min。对测序结果分析表明:扩增产物的大小为200~2 000 bp,23份材料与对照材料存在单碱基的缺失,利用单碱基变异可以区分出24份材料,说明18份优良营养系材料发生了遗传变异。【结论】SCoT分子标记可用于梨树营养系变异的鉴定。
- 和世玉牛建新马建江
- 关键词:正交设计
- 新疆梨树上苹果锈果类病毒的检测与全序列分析被引量:4
- 2013年
- [目的]检测并分析新疆和静县223团场多年生早熟梨树上的苹果锈果类病毒(ASSVd)。[方法]对采自新疆和静县223团多年生早熟梨的枝条和叶片样品进行RNA抽提,经RT-PCR技术鉴定检测。[结果](1)多年生早熟梨树检测到苹果锈果类病毒,得到2条ASSVd核酸序列(JX861258~JX861259),所得序列与GenBank中已报道的国内外ASSVd序列同源性达86%以上。(2)原位RT-PCR检测进一步表明ASSVd的RNA阳性信号主要位于叶片肉组织的细胞核内。[结论]通过序列分析比对,各寄主上的ASSVd分离物核酸序列变异较小,地域和品种间核酸序列无明显差异。建立了优化的RT-PCR检测及原位RT-PCR检测方法,为果树ASSVd的快速检测奠定了良好的基础。
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- 库尔勒香梨SCoT反应体系优化及优良营养系鉴定
- 库尔勒香梨原产库尔勒地区,栽培时间久远,具有品质优良、皮薄肉脆、汁丰味甜、香味浓郁、极耐储藏的优点,库尔勒香梨的品质优良,近年来库尔勒香梨已经远销国内外,成为库尔勒地区主栽的经济作物之一。随着分子生物技术的发展,运用分子...
- 和世玉
- 关键词:库尔勒香梨遗传育种基因表达
- 文献传递