基于DNA指纹建立农作物品种身份证的方法探析 被引量:6 2014年 为解决种子生产、经营和知识产权保护中存在的突出问题,本文提出了构建农作物品种身份证及建立品种身份证制度。在借鉴人类身份证建立模式基础上,将品种的商品信息、指纹信息及特异基因信息相结合,构建农作物的品种身份证。农作物品种身份证由3部分构成:第1部分称为商品码,反映作物及品种类别、品种选育(或审定)的区域和时间等,预设14位阿拉伯数字(或字母);第2部分称为指纹码,反映品种的DNA指纹信息,依据作物类型不同预设20~40位阿拉伯数字(或字母);第3部分称为补充码(特异基因识别码),反映品种的特异基因信息,设计为字母"T"(转基因育种)、"S"(分子育种)和"M"(诱变育种)等,加上被导入、渗入或诱变的基因名称;身份证总位数约50位。采用本方法编码的农作物品种身份证,具有准确性高、通用性强及可追溯性等特点,对我国农作物品种的科学识别和管理具有十分积极的意义。 陆徐忠 马琳 倪金龙 张小娟 杨剑波关键词:指纹码 利用SSR标记进行杂交油菜品种鉴定 被引量:8 2014年 利用分布于油菜连锁群上的33对SSR核心引物,对12个育种品系和市场上的杂交油菜品种进行鉴定,探讨取样方案、检测方法和位点判读,将样品间SSR位点类型分为相同位点、疑似相同位点和差异位点3类。分析位点类型发现,12个油菜品种/系间的差异位点数为4~22,其中同父异母杂交种(3个)间差异位点数为4~16,同母异父杂交种(4个)间差异位点数为7~18,市场抽样的品种间差异位点数为12~20。同一品种不同样本间的差异位点数为0~2,据此,将区分品种间与品种内的差异位点阈值设定为2,即在利用33对引物对油菜杂交种与对照样品进行SSR分析时,当两样品间差异位点数〉2时,判定为不同品种;当差异位点数≤2时,判定为近似或极近似品种。盲样鉴定实验及其与田间鉴定方法的对比实验,均证明了本研究确定的SSR鉴定方法可行。 张冰清 陆徐忠 吴新杰 李莉 陈凤祥 马琳 张小娟 倪金龙 汪秀峰 秦瑞英 杨剑波关键词:杂交油菜 SSR分析 阈值 一种农作物品种身份证管理方法 本发明提供了一种农作物品种身份证管理方法,其特征在于,采集农作物品种身份信息并将其存储于服务器中,存储于服务器中的作物品种身份信息再通过数据转化器转换成一一对应的可读取的数字码、条形码或二维码;被采集的农作物品种在流通环... 杨剑波 陆徐忠 马琳 倪金龙 马卉 倪大虎 李莉 张小娟 宋丰顺 汪秀峰 杨亚春文献传递 一个与水稻温敏不育基因tms5紧密连锁标记的开发与应用 本发明提供了一个与水稻温敏不育基因tms5紧密连锁的InDel(insertion-deletion)标记,可用于水稻温敏核不育系的辅助选育及温敏型两系水稻纯度的快速鉴定。本发明依据水稻温敏核不育系与恢复系(或具恢复能力... 杨剑波 陆徐忠 倪金龙 马卉 倪大虎 李莉 马琳 张小娟 宋丰顺 汪秀峰 杨亚春文献传递 陆地棉SSR核心引物筛选及95份骨干种质的遗传多样性分析 被引量:19 2011年 从391对棉花SSR引物中筛选出均匀分布于棉花26条染色体的52对核心引物,对92份陆地棉和3份亚洲棉骨干种质进行多样性分析,结果表明,52对引物的等位基因数范围为2~13,平均5.7692个,多态信息含量(Polymorphism Information Contents,PIC)在0.3457~0.8800间,均值为0.7100,显示在这些位点上,供试材料的遗传变异比较丰富;聚类分析显示,在相似系数为0.73处,3份亚洲棉种质单独聚为一类,92份陆地棉种质被分为4大类群,与系谱分析结果较为吻合;在陆地棉种内,92份种质资源的相似系数在0.71~0.97之间,平均为0.84,表明陆地棉种内的遗传相似性较高,遗传基础狭窄;而广泛的亲本选配与频繁的引种,以及选育过程中未知血缘的渗入,又致使陆地棉遗传背景丰富。 张小娟 何团结 陆徐忠 路曦结 倪金龙 马琳 杨剑波关键词:SSR 核心引物 一个与水稻温敏不育基因tms5紧密连锁标记的开发与应用 本发明提供了一个与水稻温敏不育基因tms5紧密连锁的InDel(insertion-deletion)标记,可用于水稻温敏核不育系的辅助选育及温敏型两系水稻纯度的快速鉴定。本发明依据水稻温敏核不育系与恢复系(或具恢复能力... 杨剑波 陆徐忠 倪金龙 马卉 倪大虎 李莉 马琳 张小娟 宋丰顺 汪秀峰 杨亚春一种农作物品种身份证管理方法 本发明提供了一种农作物品种身份证管理方法,其特征在于,采集农作物品种身份信息并将其存储于服务器中,存储于服务器中的作物品种身份信息再通过数据转化器转换成一一对应的可读取的数字码、条形码或二维码;被采集的农作物品种在流通环... 杨剑波 陆徐忠 马琳 倪金龙 马卉 倪大虎 李莉 张小娟 宋丰顺 汪秀峰 杨亚春文献传递 杂交水稻亲本分子身份证及SSR指纹数据库的建立 被引量:29 2012年 本研究利用GB/T20396-2006推荐的48对SSR核心标记,对133份杂交水稻亲本(包括部分常规品种)进行SSR分析,根据引物在133份材料中扩增的片段大小,构建了各品种的分子身份证和指纹图谱,该身份证由48位数字或数字与字母组合组成,代表了48对引物在该品种中的扩增情况。将品种的身份证信息与品种的形态学特征特性等信息相结合,构建了具查询功能的SSR指纹网络数据库。该SSR指纹数据库除具有品种基本信息查询、品种分子身份证查询、品种间相似率查询和身份证核对等基本功能外,还可指导杂交水稻品种真实性和纯度鉴定,分析亲本间遗传相似性,为杂交稻新组合的选育提供亲本选配的参考。该数据库的建立,不仅为检测单位和育种工作者提供了一个便利的网络数据交换和共享平台,也为品种的选育、试验、管理、评价、仲裁提供技术支撑和科学参考。 陆徐忠 从夕汉 刘海珍 倪金龙 马琳 李莉 倪大虎 杨剑波关键词:杂交水稻 亲本 SSR标记 分子身份证 指纹数据库 一种广亲和性水稻光敏、温敏不育聚合系的选育方法 本发明提供了一种利用分子标记辅助选择手段将水稻广亲和基因S5n、光敏核不育基因pms1、pms3及温敏核不育基因tms5进行聚合,以培育出广亲和性光、温敏不育聚合系的方法。本发明综合运用杂交、回交、穿梭育种、测交等传统育... 杨剑波 倪金龙 陆徐忠 倪大虎 王德正 李莉 汪秀峰 马琳 张小娟文献传递 130份甘蓝型油菜种质分子身份证的构建 被引量:35 2013年 为准确区别油菜种质,从分布于油菜19个连锁群上的463对SSR引物中,筛选出33对扩增清晰、稳定的多态性引物,并用其分析国内外130份甘蓝型油菜材料,共检测到191个等位变异,每对引物的等位变异数变幅为3~9个,平均为5.787 9;有效等位变异数(Ne)变幅为1.906 8~7.479 0,平均为4.730 7;多样性指数(He)变幅为0.773 8~2.045 1,平均为1.551 5;引物个体识别能力(DP值)变幅为0.389 2~0.862 9,平均为0.742 8;多态信息含量(PIC值)变幅为0.475 6~0.866 3,平均为0.764 0。主坐标分析表明:33对核心引物可以将供试材料明确区分,并按照遗传相似性归为3类。通过逐级筛选,最终确定7对引物(BrGMS075、Na14E08、BrAS084、CB10545、Na14G10、CN57和Ra2E04),将每对引物的扩增产物进行数字标识,构建了130份甘蓝型油菜的品种分子身份证,达到用最少的引物组合区分不同品种的目的。 马琳 刘海珍 陆徐忠 倪金龙 张小娟 杨剑波关键词:甘蓝型油菜 SSR 核心引物 分子身份证