齐记
- 作品数：3 被引量：4H指数：1
- 供职机构：集美大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术生物学理学更多>>
- 复杂网络与效率模型及其计算
- 复杂网络在现实世界中广泛存在。近年来,有关复杂网络的研究的一个重要方面是动力学问题上。鉴于网络的加团效应在生物学中广泛存在,并在经济科学等领域有着重要的用途,该课题已成为一个研究型热点问题。
本文的工作分为三...
- 齐记
- 关键词：图形处理器复杂网络无标度网络小世界网络蛋白质相互作用网络度分布
- 文献传递
- 数据来源对蛋白质相互作用网络度分布的影响被引量：1
- 2010年
- 蛋白质-蛋白质相互作用(Protein-protein interaction,PPI)是生命体结构和生命活动的基础和特征,控制着生命活动的各个过程.PPI网络是研究蛋白质相互作用的有效手段.随着高通量实验技术的发展,越来越多的PPI数据得以使用,收录蛋白质相互作用的数据库数据每年都有变化.本文对DIP数据库从2003年到2008年的PPI网络数据分别计算度分布.为提高可信度,对注释蛋白质数据库交集进行抽样,分别探讨对不同年份的数据和注释数据库抽样对PPI网络度分布的影响.结果表明,从2003年到2008年的数据增长对PPI网络度分布没有明显影响,而且拟合度分布最优的函数并不是以往所认为的幂率分布(power-law),而是广延指数(stretched exponential)函数,数据库交集抽样同样得到广延指数(stretched exponential)函数分布最优且可信度的高低并不影响PPI网络的度分布.
- 齐记邴志桐杨孔庆
- 关键词：蛋白质-蛋白质相互作用度分布
- 图形处理器通用计算的实现与验证被引量：3
- 2009年
- 讨论了显示卡用于通用科学计算的问题,并以大型矩阵的基本运算问题详细比较了CPU和GPU计算之间的差别。在基本的矩阵运算中,运用适当的矩阵分块,GPU的计算速度比CPU快50倍左右。而且,显示卡低廉的价格为更多科研工作者实现大规模运算提供了可能。
- 齐记杨孔庆杨磊
