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张忠华

作品数：3 被引量：4H指数：2
供职机构：浙江大学更多>>
发文基金：国家自然科学基金浙江省重点科技计划更多>>
相关领域：农业科学更多>>

合作作者

文献类型

  • 1篇期刊文章
  • 1篇学位论文
  • 1篇专利

领域

  • 2篇农业科学

主题

  • 3篇水稻
  • 2篇数据库
  • 2篇基因
  • 2篇基因组
  • 2篇假基因
  • 1篇多态
  • 1篇多态性
  • 1篇三核苷酸
  • 1篇三核苷酸重复
  • 1篇数据库构建
  • 1篇水稻基因
  • 1篇水稻基因组
  • 1篇水稻全基因组
  • 1篇全基因组
  • 1篇微卫星
  • 1篇微卫星多态
  • 1篇微卫星多态性
  • 1篇离散量
  • 1篇基因数据
  • 1篇基因数据库

机构

  • 3篇浙江大学
  • 1篇中国科学院

作者

  • 3篇张忠华
  • 1篇薛庆中
  • 1篇孙奕钢
  • 1篇高雷
  • 1篇黄志华

传媒

  • 1篇遗传

年份

  • 2篇2006
  • 1篇2005
共 3 条 记 录，以下是 1-3
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排序方式：
水稻全基因组假基因数据库构建方法
本发明公开了一种基因序列数据处理方法，特别涉及水稻全基因组假基因数据库构建方法。包括将计算机系统中构建已知水稻全基因组序列的本地数据库；利用BLAST程序对前述数据库进行搜索比对，获取标准BLAST格式的比对结果；使用B...
薛庆中黄志华张忠华
文献传递
寻找水稻DNA编码与非编码区边界方法的比较研究被引量：2
2005年
在分析DNA序列复杂度、预测基因编码区和非编码的DNA边界识别等问题中,以熵为基础构造的离散量度量提供了一种强有力的工具。为改进寻找水稻基因编码与非编码区边界的效率,提出了两个新的离散量度量(αKL离散量与αJensenShannon离散量),根据密码子的GC含量对氨基酸对应密码子构建了粗粒化向量。比较了融合JensenShannon离散量、JensenRenyi离散量、αKL离散量和αJensenShannon离散量等不同向量所获得的精度,结果表明,在对水稻基因编码区‘终止子’的识别效率上,构建的密码子粗粒化向量融合新引进的度量方法比Bernaola等人的方法(2000)提高了4～5倍。
孙奕钢高雷张忠华薛庆中
关键词：编码区水稻
水稻基因组微卫星多态性数据库构建及假基因分析
对水稻基因组和全长cDNA序列分析发现三核苷酸重复(TNRs，Tri-nucleotiderepeats)在水稻基因组中相当丰富，GC含量高的TNRs数量多，相同GC含量条件下，只有嘌呤或嘧啶组成的TNRs相对丰富，其中...
张忠华
关键词：水稻三核苷酸重复分子标记
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