修林春
- 作品数：2 被引量：4H指数：1
- 供职机构：南京农业大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 高等植物液泡加工酶VPE家族的生物信息学分析被引量：4
- 2010年
- 利用已经分离的植物液泡加工酶(vacuolar processing enzyme,VPE)蛋白家族的Peptidase_C13结构域序列为检索序列,对拟南芥和水稻中的VPE家族成员进行序列分析,同时利用所有成员的氨基酸序列构建系统进化树,并对其中的保守序列以及信号肽区段和亚细胞定位进行了分析。结果表明:1)结合同源序列的搜索和结构域的鉴定,最终在拟南芥和水稻中确定了8个和13个VPE,其中2个拟南芥和11个水稻VPE成员为首次报道;2)蛋白系统进化分析表明,该基因家族的基本特征在拟南芥和水稻分离之前就已经形成;3)多序列联配以及MEME分析表明,Peptidase_C13结构域在VPE家族成员间高度保守;4)亚细胞定位分析表明,VPE成员定位于细胞中的不同特定位置,定位于液泡中的占多数。
- 修林春张炜
- 关键词：拟南芥生物信息学
- 高等植物液泡加工酶VPE家族的生物信息学分析及验证
- 本文以水稻和拟南芥液泡加工酶(VPE)家族为研究对象,对所有VPE成员进行了初步的生物信息学分析,并且进一步对部分VPE成员在细胞程序性死亡PCD过程中发挥的作用进行了实验验证,主要内容如下： 1.高等植物液泡加工酶VP...
- 修林春
- 关键词：拟南芥PCD生物信息学
- 文献传递
