曾小涛
- 作品数：6 被引量：6H指数：2
- 供职机构：军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金“十一五”国家科技支撑计划国家科技重大专项更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- 猪链球菌2型强毒株05ZYH33转录调控因子Rgg基因敲除突变体与野生株的基因表达差异分析被引量：1
- 2010年
- 目的:为了解猪链球菌2型强毒株05Z33转录调控因子Rgg的调控作用,用基因芯片方法分析野生株与rgg基因敲除突变体之间的差异表达基因。方法:用猪链球菌2型全基因组序列点样制备芯片,将芯片运用于rgg敲除株与野生株的基因表达差异研究,采用定量real-time PCR(qRT-PCR)验证表达谱结果。结果:在突变体中共发现45个基因表达量变化在2倍以上,其中19个基因表达上调,26个基因表达下调。这些基因在细菌毒力、免疫抗原、DNA合成和修复、基础代谢和ABC转运系统等方面起着重要作用。结论:转录调控因子Rgg是一个全局调控因子,但rgg敲除后并不影响猪链球菌的毒力。
- 王中胜曾小涛袁媛尉研郑玉玲姜永强
- 关键词：猪链球菌2型基因芯片转录调控因子
- 猪链球菌2型全基因组DNA芯片的研制及基因表达谱技术平台的建立被引量：2
- 2009年
- 目的:研制猪链球菌2型(SS2)全基因组DNA芯片,建立SS2基因表达谱技术平台。方法:利用SS2全基因组序列,挑选出2194条基因,经PCR扩增出2156条基因并将产物纯化,点样制备芯片;将芯片用于表达谱研究,采用实时定量PCR验证表达谱结果,对芯片进行可靠性分析。结果:芯片杂交数据与实时定量PCR验证显示了较高的相关性,二者相关系数r=0.87。结论:研制了一批SS2全基因组DNA芯片,并建立了基于DNA芯片的表达谱技术平台。
- 曾小涛袁媛郑玉玲周冬生姜永强陈福生
- 关键词：猪链球菌2型DNA芯片基因表达谱
- 猪链球菌2型05Z33强毒株转录调控因子Rgg基因敲除突变体的构建及毒力分析
- 2010年
- 目的:构建猪链球菌2型强毒株05ZYH33转录调控因子Rgg的基因敲除突变体,观察其生物学性状,并在动物感染实验中比较敲除株与野生株的毒力差异,为进一步研究猪链球菌转录调控因子在致病中的作用提供实验基础。方法:分别以猪链球菌2型05ZYH33基因组和pSET1质粒为模板,扩增基因SSU05_1997两侧各约500 bp的片段为上下游同源臂,氯霉素(Cm)抗性基因为中间片段,采用重叠PCR方法连接3个片段;连接产物先克隆到T载体上,再经过酶切克隆到温度敏感自杀载体pSET4S上;将构建的基因敲除载体pSET4S-1997电转化入05ZYH33感受态细胞,通过改变培养温度筛选出基因敲除突变体05Z33△rgg;对敲除株和野生株的生物学性状及小鼠和猪的致病性进行了初步比较。结果:PCR分析和测序结果均显示基因SSU05_1997完全被Cm抗性基因所替代,基因敲除突变体构建成功;05ZYH33△rgg对小鼠和猪的致病性与野生株相比无明显差异。结论:转录调控因子Rgg可能和猪链球菌2型的毒力无关。
- 王中胜袁媛尉研曾小涛郑玉玲姜永强
- 关键词：猪链球菌2型转录调控因子基因敲除
- 2型猪链球菌DNA芯片制备及其在温度诱导转录谱分析中的应用
- 猪链球菌(Streptococcus suis)是一种重要的人畜共患病原菌。在其35种血清型中,2型猪链球菌(Streptococcus suis serotype2,SS2)是毒力最强,临床分离比例最高的血清型。自19...
- 曾小涛
- 关键词：2型猪链球菌DNA芯片温度调控杂交效果
- 文献传递
- 副溶血性弧菌全基因组DNA芯片的研制和质量评价被引量：3
- 2010年
- 【目的】研制副溶血性弧菌全基因组芯片,建立芯片杂交方法,并对芯片质量进行评价。【方法】利用副溶血性弧菌全基因组序列,挑选出4770条基因,PCR扩增各基因并将PCR产物纯化,点样制备芯片;设计了两个质控杂交组合,采用双色荧光杂交策略,对芯片质量进行评价;PCR方法验证部分芯片结果。【结果】芯片杂交与理论预期结果以及PCR验证结果完全一致。【结论】成功的研制了一批质量良好的副溶血性弧菌全基因组DNA芯片,并建立了基于DNA芯片的副溶血性弧菌比较基因组学技术平台,建立了一套系统的芯片数据分析的标准方法。
- 韩海红曾小涛殷胜骏杨瑞馥刘秀梅周冬生
- 关键词：副溶血性弧菌DNA芯片比较基因组学进化基因组学功能基因组学
- 猪链球菌2型强毒株S.suis 05ZY和弱毒株S.suis 1940的比较转录谱分析
- 2012年
- 目的:比较猪链球菌2型强毒株S.suis 05ZY和弱毒株S.suis 1940毒力相关基因转录水平的差异,为进一步研究强毒株S.suis 05ZY毒力增强的原因提供实验基础。方法:分别提取S.suis 05ZY和S.suis 1940的RNA,反转录成cDNA并纯化,用Cy5或Cy3标记,与猪链球菌全基因组DNA芯片进行杂交,扫描芯片进行数据分析,比较二者在转录水平上的差异基因。结果:编码溶血素、精氨酸氨基肽酶的基因分别上调4.4和6.0倍,参与荚膜多糖合成的相关基因cps2H、cps2I、cps2J和一些可能的毒力相关基因ofs、dpr、SSU05_0196、SSU05_0272、SSU05_1408-1409均发生转录水平的上调。结论:溶血素、荚膜多糖、精氨酸氨基肽酶及一些可能的毒力因子在转录水平的上调很可能与S.suis 05ZY的毒力增强有关。
- 尉研袁媛曾小涛江华郑玉玲周冬生姜永强
- 关键词：猪链球菌2型DNA芯片毒力因子
