刘旭
- 作品数:18 被引量:13H指数:3
- 供职机构:北京市理化分析测试中心更多>>
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- 基于土壤宏基因组分析的法医学个体来源地理位置推断被引量:4
- 2021年
- 目的初步探讨基于土壤宏基因组分析方法应用于法医学个体来源地理位置推断的可行性。方法收集黑龙江省、青海省、西藏自治区土壤样本共33例,提取样本中全部细菌总DNA,采用通用引物扩增细菌16S rDNA V3-V4高变区并在MiSeq测序仪上完成高通量测序,对测序数据进行物种组成和样本比较等生物信息学分析,基于分类操作单元(operational taxonomic unit,OTU)结果计算丰富度指数及多样性指数。结果测序共得到2720149条序列,聚类得到114848个OTU。黑龙江省、青海省、西藏自治区土壤微生物Chao1指数分别为797.45、745.11、535.98,Shannon指数分别为6.46、6.36、6.25,土壤中细菌物种数从多到少及群落多样性从高到低均依次为黑龙江省、青海省、西藏自治区。获得了3省土壤细菌在各分类水平下的结构组成,黑龙江省优势菌属为Chthoniobacteraceae科DA101属和Thermogemmatisporaceae科某一未注释的属;青海省优势菌属为Cytophagaceae科某一未注释的属和Nocardioidaceae科某一未注释的属;西藏自治区优势菌属为Comamonadaceae科某一未注释的属和Verrucomicrobiaceae科Luteolibacter属。主坐标分析结果显示,按照加权UniFrac度量分析,3个主成分代表总变量的56.36%,按照未加权UniFrac度量分析,3个主成分代表总变量的34.81%,同一省样本可分别聚类到一起,不同省来源的土壤微生物种类及含量则有明显差别。结论基于土壤宏基因组分析方法可以有效区分不同地区土壤样本,未来在法医学个体来源地理位置推断方面具有潜在的应用价值。
- 刘文丽程凤钱嘉林方晨刘旭刘旭武会娟严江伟
- 关键词:法医遗传学土壤
- 一种基于DNA甲基化检测肝癌的试剂盒及应用
- 本发明涉及一种基于DNA甲基化检测肝癌的试剂盒,包括能检测人体肝特异的试剂,所述试剂包含在APOA5基因甲基化位点肝特异区序列的引物。所述引物的核苷酸序列为以下序列中的一种或多种:APOA5‑M‑F、APOA5‑M‑R、...
- 钱嘉林刘文丽武会娟张小莉田彦捷方晨刘旭
- 文献传递
- 用于检测抑郁症的基因及其检测方法和试剂盒
- 本发明提供了用于检测抑郁症的靶基因及检测试剂盒。本发明提供的用于检测抑郁症的靶基因为ATP1A1,检测该基因的实时荧光定量PCR引物,其核苷酸序列分别如SEQ ID NO.2-3所示,本发明还提供了对ATP1A1进行定量...
- 武会娟吴宁李丽李越钱嘉林李宝明张小莉刘旭
- 文献传递
- 试管容纳盒和试管架
- 本实用新型涉及试管技术领域,提供试管容纳盒和试管架。试管容纳盒包括:容纳盒本体,至少在相对的两个第一表面设置有不同尺寸的试管的容纳腔,且所述容纳盒本体形成有位于所述容纳腔周围的注液腔。该种试管容纳盒,由于在相对的两个第一...
- 方晨武会娟严江伟李宝明刘旭钱嘉林张小莉刘文丽
- 基于新一代测序的基因座D8S1179的STR分型方法
- 本发明涉及分子生物学领域,具体公开了一种扩增D8S1179基因的特异性引物对,所述特异性引物对包括:D8S1179‑FP:5’‑TTTGTATTTCATGTGTACATTCGTAATTC‑3’;D8S1179‑RP:5’...
- 钱嘉林刘旭武会娟严江伟萨日娜
- 文献传递
- 陈旧血痕miRNA高通量测序文库的构建方法
- 本发明公开了陈旧血痕miRNA高通量测序文库的构建方法,包括陈旧血痕样品的预处理,miRNA的提取以及miRNA测序文库构建的步骤,其中文库构建包括:①miRNA 5’和3’接头的连接;②反转录;③PCR扩增;④PCR扩...
- 方晨武会娟严江伟刘旭钱嘉林刘文丽张小莉
- 文献传递
- 宏基因组学在法医学鉴定中的应用被引量:3
- 2017年
- 随着分子生物学与基因组学的发展,宏基因组学在法医学与法医学鉴定中逐渐扮演着重要的角色。近年来,宏基因组学作为研究环境微生物菌群构成与多样性、各成员之间相互关系及与环境之间相互关系的分支学科,在法医学鉴定相关领域的应用也逐渐兴起,并带来了新的契机。本文对宏基因组学研究策略及其在法医学鉴定中个体识别、案发现场生物斑迹来源鉴定及药物滥用检测等方面的应用现状进行了综述,旨在进一步阐明宏基因组学在法医学中的作用与应用价值。
- 萨日娜蔡令艺武会娟严江伟刘旭胡荣
- 关键词:法医遗传学宏基因组学
- 磁力架
- 本实用新型涉及生物实验器材领域,提供一种磁力架,包括:顶板,开设有试管的安装通孔;底座,对应各个安装通孔设置有用于感应试管位置的感应开关,感应开关在断开状态和闭合状态之间切换;照明部件,与感应开关对应,连接感应开关,在断...
- 钱嘉林李宝明方晨刘旭刘文丽张小莉田彦捷武会娟严江伟
- 文献传递
- 法医物证学miRNA分析的研究进展被引量:4
- 2016年
- 在种属和体液鉴定及降解检材等特殊案件的分析时,转录水平的miRNA所具有的生物属性及表达特点,使其能够发挥基因组DNA所不具备的价值。本文通过概述法医物证学miRNA研究的现状,对法医miRNA分析的研究策略和法医物证学应用前景进行了综述,以期为法医miRNA分析的应用研究提供借鉴。
- 胡荣方晨刘旭安云鹤武会娟严江伟
- 关键词:法医物证学MIRNA
- 基于新一代测序的基因座D8S1179的STR分型方法
- 本发明涉及分子生物学领域,具体公开了一种扩增D8S1179基因的特异性引物对,所述特异性引物对包括:D8S1179?FP:5’?TTTGTATTTCATGTGTACATTCGTAATTC?3’;D8S1179?RP:5’...
- 钱嘉林刘旭武会娟严江伟萨日娜