肖云
- 作品数:7 被引量:8H指数:1
- 供职机构:哈尔滨医科大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家高技术研究发展计划黑龙江省自然科学基金更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学更多>>
- 毒蕈乙酰胆碱受体亚型关系的研究被引量:7
- 2007年
- 利用不同类型的生物学数据,运用生物信息学方法和策略,从分子进化、序列相似性、表达相关性以及蛋白互作4个层面对M受体亚型之间的关系进行了比较全面的研究。分析表明,从分子进化和序列相似性角度,毒蕈乙酰胆碱受体5种亚型可分为2个亚类,分别为M1、M3、M5亚类(第一亚类)与M2、M4亚类(第二亚类),每一亚类内部亚型之间进化距离相对较近,序列相似性较高。在表达层面发现第一亚类中受体亚型与第二亚类中受体亚型在某些组织中正表达相关,呈现共表达趋势。在互作层面发现两亚类之间受体亚型存在着间接互作的关系,呈现协同作用的现象。
- 于海龙肖云艾静李霞宫滨生
- 关键词:分子进化
- 整合大规模的miRNA表达谱揭示miRNA功能协同异常诱导的疾病发生
- microRNA(miRXA)是一类长度约为22个核苷酸的非编码小分子,功能上能够通过与其靶mRNA序列的3UTR结合进而降解mRNA或抑制mRNA翻译。大量的研究结果表明miRNA在生长发育,细胞增殖分化,细胞周期等过...
- 肖云
- 关键词:MICRORNA表达谱
- 结合已有知识体系的酒精中毒相关的SNP单体型及其相关基因挖掘被引量:1
- 2008年
- 高通量的单核苷酸多态(single nucleotide polym orphism,SNP)检测技术与已有的知识体系(如KEGG,GO数据库等)为与疾病相关的SNP单体型及相关基因挖掘提供了有力支撑.本研究对高通量SNP基因型数据,采用4种SNP单体型板块(block)识别方法(置信区间、FGT、连锁不平衡的稳定连接以及单体型板块融合技术),用聚类分析方法验证其效能,通过风险分析方法确定酒精中毒相关的SNP单体型,并基于已有知识体系建立SNP单体型与基因的映射,通过查询NCBI SNP与gene数据库定位SNP单体型板块,确定候选基因,最后结合KEGG,Biocarta及GO数据库进行基因功能注释.在对人类22对常染色体的分析中,寻找到可能与酒精中毒相关的159个单体型板块,包含227个SNP单体型,并预测其中102个SNP单体型可能会增加酒精中毒的发病风险.挖掘得到了121个酒精中毒相关基因,并进一步进行可靠的生物学功能注释验证.结果提示:采用聚类效果验证及风险分析的单体型识别机制,基于单体型的疾病相关基因定位并结合已有知识体系的疾病相关基因挖掘策略,不仅能大大缩减SNP数据挖掘的工作量,实现复杂疾病相关基因的精细定位,而且对于多因素复杂疾病发病机制的探索将更有指导意义.
- 张瑞杰李霞姜永帅刘桂友李传星张帆肖云宫滨生
- 关键词:酒精中毒基因定位
- 用于人乳腺癌循环肿瘤DNA检测的探针及其用途
- 本发明公开了一种用于人乳腺癌循环肿瘤DNA检测的探针及其用途,属于疾病的诊断和防治领域。本发明设计了一种乳腺癌“selector”,它是由靶向乳腺癌相关基因突变区域的DNA片段组成。将乳腺癌患者循环肿瘤DNA(ctDNA...
- 庞达张显玉肖云魏巍
- 文献传递
- 一种MTX耐药肿瘤细胞的高置信断裂点筛选方法
- 本发明公开了一种MTX耐药肿瘤细胞的高置信断裂点筛选方法,涉及生物技术领域,利用MTX作为主要治疗药物且易产生耐药性的恶性肿瘤的生物治疗提供新的研究方案,为有效对抗MTX耐药提供了科学的依据,针对MTX耐药且DHFR基因...
- 宋盈孟祥宁蔡梦迪肖云傅松滨冯犇王利强关荣伟
- 文献传递
- 独立生长因子GFI1在炎症相关结直肠癌转移中的作用及机制
- 研究背景及目的:临床上,90%以上的结直肠癌死亡可归因于转移,因此如何早期发现及干预转移是目前结直肠癌治疗的最大挑战。肿瘤转移需要肿瘤细胞与微环境间的紧密配合,因此阐明炎症与肿瘤转移间的关系,深入探讨肿瘤细胞对炎症的反应...
- 邢文婧肖云卢信良李霞任欢
- 关键词:结直肠癌
- 文献传递
- 一种MTX耐药肿瘤细胞扩增子的进化和形成机制分析方法
- 本发明公开了一种MTX耐药肿瘤细胞扩增子的进化和形成机制分析方法,涉及生物技术领域,可以针对MTX耐药且DHFR基因高度扩增的恶性肿瘤细胞,以断裂点接头序列为切入点,构建置信断裂点筛选模型,揭示扩增子的非线性进化过程和肿...
- 宋盈孟祥宁蔡梦迪肖云傅松滨冯犇王利强关荣伟