刘立元
- 作品数：2 被引量：0H指数：0
- 供职机构：济南大学更多>>
- 发文基金：山东省高等学校科技计划项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术更多>>
- 利用进化模糊K近邻及其集成预测蛋白质亚核定位
- 2010年
- 针对从蛋白质原始序列中预测蛋白质定位及功能信息这个生物信息学中研究的热点问题,提出进化模糊K近邻算法(Evolutionary Fuzzy K-Nearest Neighbor,EFKNN)直接处理多分类问题的预测模型,用EFKNN及其集成直接从蛋白质序列中预测蛋白质亚核定位。采用5种特征提取算法从蛋白质序列中提取特征,训练了5个基于EFKNN的基分类器,并根据得票量大小原则集成每个基分类器的分类结果作为待测样本的输出。将蛋白质亚核定位预测中常用的数据集SNL9作为训练集,利用jackknife测试方法预测了数据集中每条单定位亚核蛋白,正确率为70.0%,表明该模型可以作为蛋白质亚核定位预测的工具或对现有预测模型和方法的补充。
- 刘立元陈月辉马炳先曹毅
- 关键词：粒子群优化算法
- 基于集成学习的蛋白质亚细胞定位预测
- 随着人类基因组计划的成功实施和现代分子生物学的蓬勃开展,给人们留下了海量的生物学数据,并把人们带入了后基因组时代。由于后基因组时代生物学数据的大规模性,及数据之间关系的复杂性,使得人们不得不借助计算机来存储和处理这些海量...
- 刘立元
- 关键词：蛋白质亚细胞定位
- 文献传递
