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宋来鹏
作品数:
8
被引量:29
H指数:3
供职机构:
中国水产科学研究院黄海水产研究所
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发文基金:
青岛市科技发展计划项目
国家高技术研究发展计划
国家科技基础条件平台建设计划
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相关领域:
生物学
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合作作者
李健
中国水产科学研究院黄海水产研究...
刘萍
中国海洋大学海洋生命学院
高保全
中国水产科学研究院黄海水产研究...
刘振辉
中国海洋大学海洋生命学院
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作者
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宋来鹏
7篇
刘萍
7篇
李健
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高保全
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刘振辉
传媒
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中国水产科学
1篇
水产学报
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年份
2篇
2011
6篇
2008
共
8
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三疣梭子蟹ptssr36微卫星DNA标记的检测技术
一种三疣梭子蟹ptssr36微卫星DNA标记的检测技术,其特点是:首先提取三疣梭子蟹基因组DNA并稀释备用;再利用三疣梭子蟹基因组文库中的ptssr36微卫星核心序列,在其序列两端设计特异性引物;然后使用该引物对三疣梭子...
刘萍
李健
宋来鹏
高保全
文献传递
三疣梭子蟹ptssr17微卫星DNA标记的检测技术
一种三疣梭子蟹ptssr17微卫星DNA标记的检测技术,其特点是:首先提取三疣梭子蟹基因组DNA并稀释备用;再利用三疣梭子蟹基因组文库中的ptssr17微卫星核心序列,在其序列两端设计特异性引物;然后使用该引物对三疣梭子...
刘萍
李健
宋来鹏
高保全
文献传递
三疣梭子蟹基因组小卫星特征分析
被引量:6
2008年
通过构建三疣梭子蟹部分基因组文库,对获得的4164个克隆测序,共获得总长度h622409bp的DNA序列。在序列拼接后长度500--1500bp的709个克隆中,筛选到130个小卫星序列,其序列总长度占测序序列总长度的2.55%。小卫星序列中,以12bp重复单位的序列数量最多(10.77%),总体趋势表现为重复单位越长,相应的重复序列数目越少(R=-0.663,P〈0.01)。小卫星重复单位拷贝数分布范围以8bp重复单位最广为3.9~66.5;其次是13bp重复范围在2.0~40.6;再次是26bp重复,范围在2.3~21.0。平均拷贝数最高的三种重复类型分别为8bp重复(19.96),25bp重复(16.00)和22bp重复(15.85)。小卫星序列中各重复单位的拷贝数分布范围2~66.5,集中分布在2~25,且表现为拷贝数目越大,其相应的重复序列数目越低的趋势。130个重复序列分别由123种重复单位所组成,因而小卫星重复序列的类型很多。初步分成三类:2种碱基组成类别、3种碱基组成类别和4种碱基组成类别,并进一步根据各个重复序列中所含有的碱基种类的数量从大到小排列这些碱基而分成若干小类。从这些分类中可以看出,三疣梭子蟹基因组中的小卫星整体上是富含A/T的重复序列,并揭示了其与微卫星重复序列之间的关系,即一部分小卫星重复序列可能起源于微卫星序列。
宋来鹏
刘萍
李健
刘振辉
关键词:
三疣梭子蟹
基因组
小卫星
三疣梭子蟹基因组串联重复序列分析及微卫星标记的初步筛选
本文构建了三疣梭子蟹部分基因组文库,对片段长度为500~1500bp的4164个克隆进行测序,在此基础上分析了微卫星和小卫星在基因组上的分布特征。利用筛选的含有微卫星的克隆序列,设计出30对微卫星引物,并筛选出了9对多态...
宋来鹏
关键词:
三疣梭子蟹
基因组文库
微卫星标记
文献传递
三疣梭子蟹ptssr36微卫星DNA标记的检测技术
一种三疣梭子蟹ptssr36微卫星DNA标记的检测技术,其特点是:首先提取三疣梭子蟹基因组DNA并稀释备用;再利用三疣梭子蟹基因组文库中的ptssr36微卫星核心序列,在其序列两端设计特异性引物;然后使用该引物对三疣梭子...
刘萍
李健
宋来鹏
高保全
文献传递
蟹类微卫星DNA标记的筛选及其在遗传学研究中的应用
被引量:8
2008年
微卫星DNA标记是近年来最受研究者青睐的分子标记之一。由于其具有高度多态性、共显性遗传、基因组中含量丰富且随机分布等特点,已被应用于种群分化研究、亲缘分析、基因连锁分析、进化以及生态学研究等许多领域。近年来,蟹类微卫星的研究报道日益增多。文中对蟹类微卫星分离方法、引物设计、遗传学特性以及在种群遗传、家系分析、遗传多样性评价等方面的最新研究进展进行综述,并分析微卫星分析中无效等位基因(null allele)、"结巴"带(stutter bands)和上游等位基因"扩增丢失"现象(upper allelic dropout)的产生原因以及对微卫星基因型判读带来的影响。
刘萍
宋来鹏
李健
刘振辉
关键词:
蟹类
微卫星
遗传学
三疣梭子蟹ptssr17微卫星DNA标记的检测技术
一种三疣梭子蟹ptssr17微卫星DNA标记的检测技术,其特点是:首先提取三疣梭子蟹基因组DNA并稀释备用;再利用三疣梭子蟹基因组文库中的ptssr17微卫星核心序列,在其序列两端设计特异性引物;然后使用该引物对三疣梭子...
刘萍
李健
宋来鹏
高保全
文献传递
三疣梭子蟹基因组微卫星特征分析
被引量:23
2008年
对三疣梭子蟹(Portunustrituberculatus)部分基因组DNA文库测序,获得了总长度为622409个碱基的基因组DNA序列,从中找到微卫星重复序列(1~6bp重复)697个。统计微卫星重复类型,以两碱基重复数目最多,为445个,占微卫星序列总数目的63.84%;其次是三碱基重复152个,占21.81%;再次分别是单碱基重复45个,占6.46%;四碱基重复31个,占4.45%;五碱基重复14个,占2.01%;六碱基重复10个,占1.43%。在单碱基重复类型中,重复拷贝类别全部为A;两碱基重复类型中,AG重复数目最多,其次是AC和AT;三碱基重复类型中以ACT最多,其次是AGG和AA%四碱基重复类型中,AGAC重复数目最多:五碱基重复类型中,以AACCT重复拷贝类别最多;六碱基重复中以AGGGGA重复数目最多。GC重复拷贝类别的重复数目很少,只发现1个(GenBank注册号为EUII3241)。
宋来鹏
刘萍
李健
刘振辉
关键词:
三疣梭子蟹
基因组
微卫星
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