王健
- 作品数:10 被引量:39H指数:4
- 供职机构:辽宁师范大学生命科学学院更多>>
- 发文基金:辽宁省科学技术计划项目辽宁省海洋与渔业厅科研计划项目公益性行业科研专项更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 圆斑星鲽肌钙蛋白Ⅰ基因的克隆和序列分析被引量:2
- 2010年
- 通过建立圆斑星鲽肌肉cDNA文库,大规模的EST测序和PCR技术得到了圆斑星鲽肌钙蛋白Ⅰ的完全表达序列,该序列全长845 bp,编码171个氨基酸。经同源性分析结果表明,与多种鱼类的肌钙蛋白Ⅰ具有较高同源性,其中与鳜鱼的肌钙蛋白Ⅰ同源性最高,为86%。序列提交GenBank收录,登录号为GU229275。
- 王健苏浩高祥刚李云峰赫崇波
- 关键词:圆斑星鲽CDNA文库
- 圆斑星鲽肌肉和脾脏组织cDNA文库构建及部分ESTs分析被引量:1
- 2010年
- 构建了圆斑星鲽肌肉和脾脏组织的cDNA文库,2个文库的库容量分别为5.0×106和1.1×106,重组率为97.3%和93.2%,平均插入片断长度大于800 bp。进行了1002个(肌肉541个,脾脏461个)ESTs测序,得到621个(肌肉192个,脾脏429个)单基因簇,其中包括110个(肌肉87个,脾脏23个)重叠群和511个(肌肉105个,脾脏406个)单拷贝。BLASTX分析的结果显示,318(51.2%)个基因簇有相关同源性,其他的303个EST(48.8%)无明显的同源性(E值≤E-5)。
- 李云峰贺凌史晓明高祥刚傅立元王健刘星赫崇波
- 关键词:圆斑星鲽CDNA文库ESTS
- 仿刺参线粒体全基因组序列结构及比较研究被引量:6
- 2012年
- 利用已构建的仿刺参cDNA文库得到的线粒体DNA(mtDNA)相关基因序列设计扩增引物,测定了大连仿刺参线粒体基因组全序列,并对其进行了基因构成和进化分析。仿刺参线粒体基因组序列长16 109bp,其基因构成与其他后口动物基本一致,包括37个基因(2个rRNA基因、22个tRNA基因和13个蛋白质编码基因)和3个主要的非编码区。在其37个基因中,ND6、tRNASer(AGN)、tRNAGln、tRNAAla、tRNAVal、TrnaAsp位于L链上,其余均位于H链上。在13个蛋白质编码基因中,除ND1的起始密码子为GTG外,其余均以ATG作为起始密码子;除Cytb以"T"作为终止密码子外,其他蛋白质基因均具有完全的终止密码子,且在已知的棘皮动物线粒体蛋白质基因中,部分基因的起始和终止密码子表现出一定的纲内特异性。比较分析了大连、青岛、威海仿刺参线粒体基因组,三者的基因组成和排列相同,碱基组成相近,蛋白质编码基因的起始和终止密码子完全一致,但存在核苷酸和氨基酸序列的差异。三者的控制区序列存在多个插入/缺失和SNP位点。根据COI、Cytb和ND4计算了三者之间的遗传距离为0.006~0.018,遗传距离分析和系统进化关系分析都显示青岛仿刺参和威海仿刺参的关系较大连仿刺参更近。
- 李云峰李梦遥王健高祥刚赫崇波周遵春杨爱馥
- 关键词:仿刺参线粒体DNA线粒体基因组单核苷酸多态性系统进化
- 圆斑星鲽的生物学及繁育技术研究进展
- 2010年
- 圆斑星鲽(Verasper variegatus)是中国海域仅存的一种星鲽属鱼类,属于稀有品种,其自然资源匮乏,捕获量极少。而圆斑星鲽的人工繁殖较为困难,开展人工养殖缺乏足够的苗种数量。在介绍圆斑星鲽的生物学特性、苗种繁育及其分子遗传学等方面研究进展的基础上,对当前圆斑星鲽存在的问题和养殖前景提出了分析与展望。
- 李云峰赫崇波高祥刚刘卫东王健王娟
- 关键词:圆斑星鲽生物学特性
- 文蛤肠、外套膜和肝胰脏组织cDNA文库构建及其ESTs序列分析被引量:7
- 2010年
- 利用SMART cDNA文库构建试剂盒构建了文蛤(Meretrix meretrix)肠、外套膜和肝胰脏组织的cDNA文库。经测定原始文库滴度分别为2.10×106、1.70×106和1.60×106,重组率高于95%,肠组织文库插入片段长度均大于1000bp,外套膜和肝胰脏组织文库的插入片段长度大于1kb的占87.5%,文库质量符合标准要求。随机选取文库的3168个克隆进行5′端测序,获得高质量表达序列标签(Expressed Sequence Tags,ESTs)3029个(肠:1005,外套膜:1019,肝胰脏:1005),测序成功率95.58%。经质量控制和拼接得到1796个单基因簇(Unigene),其中306个叠联群(Contigs),1490个单一序列(Singletons)。通过Blastx搜索比对、查询和注释分析,共得到已知基因696个(肠:216,外套膜:235个;肝胰脏:245个),占总数38.75%。在1796个单基因簇(Unigene)发现微卫星序列55条,这些存在微卫星位点的序列占整个ESTs数据库的3.1%。
- 高祥刚李云峰宋文涛王健傅立元刘卫东鲍相渤赫崇波
- 关键词:文蛤CDNA文库表达序列标签
- 仿刺参(Apostichopus japonicus)C型凝集素基因的序列分析
- 王健赫崇波高祥刚
- 关键词:仿刺参MRNAPCR
- 虾夷扇贝外套膜和肾脏组织cDNA文库构建以及EST的初步分析被引量:21
- 2010年
- 利用SMARTcDNA文库构建试剂盒首次构建了健康虾夷扇贝(Mizuhopecten yessoensis)外套膜和肾脏2种组织的cDNA文库。2个文库容量分别为2.30×106CFU/mL和1.20×106CFU/mL,重组率均超过98%,平均插入片段长度均大于1kb,文库质量符合标准要求。将随机选取的4009个克隆进行5′端测序,得到3884个有效序列(外套膜923个,肾脏2961个),测序成功率96.9%。经过质量控制和拼接,共得到2007条单基因簇(Unigenes),包含363个序列重叠群(Contigs)和1644条单一序列(Singletons)。通过BLASTx和BLASTn搜索比对,共有659个Unigenes(外套膜157个;肾脏502个)获得了基因注释(E
- 李云峰刘卫东高祥刚李文姬刘莹傅立元李宏俊王健鲍相渤赫崇波
- 关键词:虾夷扇贝CDNA文库免疫相关基因EST-SSR
- 虾夷扇贝β-actin基因的克隆和序列分析被引量:1
- 2010年
- 为进一步研究虾夷扇贝功能基因的表达调控。利用SMART cDNA文库构建试剂盒成功构建了健康虾夷扇贝外套膜和肾脏两种组织的cDNA文库。对随机选取的4009个克隆进行5′端测序,比对,筛选出1条β肌动蛋白同源序列,对此EST序列两端进行扩增、测序,得到肌动蛋白基因cDNA全长序列。肌动蛋白基因cDNA全长1536bp(不包括polyA),5′端非编码区84bp,3′端非翻译区321bp,阅读框1131bp,编码377个氨基酸。在基因组DNA中,该基因被一个内含子分为两段,内含子位于第41和第42个氨基酸之间,长度为1498bp。系统发育分析显示该肌动蛋白属于β类型。本研究得到的虾夷扇贝β-肌动蛋白基因可以被用于作为定量某种虾夷扇贝mRNA的标准,这为继续研究虾夷扇贝其它功能基因,及其分子生物的进一步研究、促进其他相关分子发育和系统进化研究奠定了基础。
- 傅立元高祥刚李云峰王健赫崇波
- 关键词:虾夷扇贝CDNA文库Β-肌动蛋白基因克隆
- 文蛤金属硫蛋白基因的克隆与分析被引量:6
- 2009年
- 金属硫蛋白是一种普遍存在于生物体内的低分子量、半胱氨酸含量丰富、易于被外界刺激诱导的金属结合蛋白。采用表达序列标签(EST)法,首次获得了文蛤金属硫蛋白(Mm-MT)的全长cDNA序列,序列全长657bp,开放阅读框长度为231bp,可以编码76个氨基酸。编码的氨基酸中半胱氨酸含量丰富,达27.6%,含有软体动物等无脊椎动物金属硫蛋白的特征序列。序列特征分析表明,该序列具备金属硫蛋白的典型特征,是金属硫蛋白家族成员。
- 高祥刚赫崇波李云峰王健朱丹刘卫东鲍相渤
- 关键词:文蛤金属硫蛋白基因ESTCDNA文库
- 文蛤线粒体基因组序列测定及进化分析
- 文蛤/(Meretrix meretrix/)属软体动物门/(Mollusca/)、双壳纲/(Lamellibranchia/)、异齿亚纲/(Heterodonta/)、帘蛤目/(Veneroida/)、帘蛤科/(Ven...
- 王健
- 关键词:文蛤线粒体基因组基因重排
- 文献传递