目的探究不同靶区经颅磁刺激(transcranial magnetic stimulation,TMS)治疗脑卒中后吞咽障碍的临床疗效,为TMS治疗脑卒中后吞咽障碍提供临床依据。方法将68例脑卒中后吞咽障碍患者按照随机数字表法分为健侧高频组(A组)、患侧高频组(B组)、双侧高频组(C组)、假刺激组(D组)。四组患者均继续目前内科相关疾病的治疗,吞咽管理护理、吞咽训练及舌三针疗法等康复治疗;根据病情接受物理治疗、作业治疗、言语治疗等康复治疗。采用洼田饮水试验(Water Swallowing Test,WST),渗透-误吸评价量表(Penetration-Aspiration Scale,PAS),空吞时表面肌电图平均时限及平均振幅,经颅磁刺激运动诱发电位(transcranial magnetic stimulation motor-evoked potentials,MEP)潜伏期及波幅评价治疗效果。结果治疗4周后A、B、C组WST,PAS,空吞时表面肌电图平均时限及平均振幅,MEP潜伏期及波幅改善均优于D组,治疗4周后A、B、C组间疗效比较无明显差异。结论经颅磁刺激治疗脑卒中后吞咽障碍疗效确切,安全可靠。