李楠
- 作品数：15 被引量：88H指数：3
- 供职机构：吉林大学第二医院更多>>
- 发文基金：吉林省自然科学基金吉林省教育厅科学技术研究项目吉林省科技发展计划基金更多>>
- 相关领域：医药卫生环境科学与工程文化科学生物学更多>>
- 子宫内膜异位症患者细胞外基质相关基因筛选的生物信息学分析被引量：5
- 2022年
- 目的:通过生物信息学工具筛选子宫内膜异位症(EMS)相关的差异表达基因(DEGs),为阐明EMS的病因提供理论依据,为EMS的诊断和治疗开辟新的研究方向。方法:从基因表达汇编(GEO)数据库检索“endmetriosis”,下载涉及EMS组织和正常子宫内膜组织的高通量芯片数据集GSE25628,GSE23339和GSE7305。使用GE02R在线分析工具筛选EMS组织和正常子宫内膜组织的DEGs,使用基因本体功能注释(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)对DEGs进行功能及通路富集分析,利用STRING数据库建立蛋白-蛋白互作(PPI)网络,最后通过Cytoscape软件对PPI网络进行可视化并筛选核心基因。结果:分析确定了27个上调DEGs和43个下调DEGs。GO富集分析,DEGs主要富集于细胞外基质、细胞外空间和细胞外区域等方面;KEGG通路分析,DEGs主要富集于磷酸肌醇代谢信号通路。通过STRING数据库和Cytoscape软件共筛选出核心蛋白聚糖(DCN)、上皮细胞黏附分子(EPCAM)、双链蛋白聚糖(BGN)、脂肪酸结合蛋白4(FABP4)、神经酪氨酸激酶受体2(NTRK2)、磷脂酰肌醇聚糖3(GPC-3)、表皮生长因子受体3(ERBB3)、分化抗原簇蛋白24(CD24)、巢蛋白2(NID2)和血小板反应蛋白2(THBS2)连接度最高的前10个核心基因,其中DCN、BGN、NID2和THBS24种基因与细胞外基质的生物学功能有密切关联。结论:细胞外基质相关基因失调可能在EMS发生发展过程中起重要作用,且细胞外基质相关基因可能成为EMS早期诊断的生物标志物及治疗靶点。
- 李楠陈蕾许天敏张琨
- 关键词：子宫内膜异位症核心蛋白聚糖
- 基于生物信息学分析女性多发肿瘤CDH1的研究
- 目的:应用癌症基因组图谱(TCGA),GEO数据库分析女性多发肿瘤(乳腺癌,卵巢癌,子宫内膜癌,子宫肉瘤,子宫颈癌)E-钙黏蛋白(CDH1)基因表达,改变和蛋白磷酸化以及相关通路的富集分析。方法:用TIMER2和GEPI...
- 陈蕾李楠张琨
- 关键词：E-钙黏蛋白
- 文献传递
- 继发性骨质疏松症常见的病因被引量：1
- 2000年
- 李楠
- 关键词：继发性骨质疏松病因甲亢库欣综合征
- 雌激素相关疾病中铁调素及其信号通路的研究被引量：3
- 2022年
- 雌激素相关疾病发病机制复杂、早期诊断和治疗困难、易复发等特点一直备受关注。近年国内外关于铁代谢用于雌激素相关疾病治疗的研究取得了一定进展,铁调素通过直接或间接作用参与了乳腺癌、卵巢癌、甲状腺癌、绝经后骨质疏松、子宫内膜异位症等的发生发展,其中涉及多条信号通路(如磷脂酰肌醇-3-激酶-蛋白激酶B通路、蛋白激酶B/哺乳动物雷帕霉素靶蛋白、白细胞介素-6/信号转导及转录激活因子3)以及表观遗传修饰。未来作用于以上信号通路的重要调控节点可能为早期治疗雌激素相关疾病提供潜在靶点。
- 陈蕾李楠许天敏张琨
- 关键词：铁调素铁信号通路
- 环境内分泌干扰物对子宫内膜异位症影响的生物信息学分析被引量：1
- 2022年
- 目的应用生物信息学分析挖掘环境内分泌干扰物(EDCs)对子宫内膜异位症(EMS)的潜在作用。方法在毒物基因组学数据库(CTD)数据库分别检索双酚A(BPA)、四氯二苯并对二恶英(TCDD)、邻苯二甲酸二酯(DEHP),并在其关联疾病中找到“Endometriosis”,下载具有相关性的基因;使用Venn图网络工具选取公共作用基因;使用富集分析数据库(DAVID)对公共作用基因进行基因功能注释(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析;利用STRING数据库建立蛋白质互作网络(PPI);通过Cytoscape软件对PPI进行可视化并筛选核心基因。结果最终确定25个公共作用基因。GO分析提示,这些公共作用基因主要富集于对遗传信息的调控,以及受体和信号的转导等功能;KEGG分析提示,这些公共作用基因主要富集于甲状腺激素信号通路、催乳素信号通路、卵巢类固醇合成、MAPK信号通路和雌激素信号通路。通过STRING数据库及Cytoscape软件共筛选出原癌基因(FOS)、糖皮质激素受体(NR3C1)、表皮生长因子受体(EGFR)、雌激素受体β(ESR2)、类固醇受体共激活剂(NCOA1)和前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)6种在该网络中连接度最强的基因。结论FOS、NR3C1、EGFR、ESR2、NCOA1和PTGS2可能是EDCs作用的共同靶点,在EMS发生、发展中起重要作用,并可能成为EMS早期诊断的生物标志物及治疗靶点。
- 李楠陈蕾张琨
- 关键词：生物信息学子宫内膜异位症环境内分泌干扰物
- 人参粉长期喂养去卵巢大鼠对其肝铁代谢影响的初探被引量：1
- 2022年
- 目的研究长期给予去卵巢大鼠一定剂量人参粉对其血清及肝脏铁代谢相关指标的影响。方法分别以0.5、1、3.0g/kg BW d人参粉掺入基础饲料喂饲去卵巢大鼠90d,另设只给予基础饲料的假手术及去卵巢大鼠对照组;试验结束测定血清雌激素与血清、肝脏铁代谢相关指标;对子宫进行大体及组织病理学检查。结果与假手术对照组比较,去卵巢对照组雌激素水平(201.93±19.17vs 148.51±29.75)明显降低(P<0.01)、子宫出现萎缩且脏/体比(9.628±2.695vs 1.960±0.786)明显减少(P<0.01);而给予不同剂量人参粉的去卵巢大鼠血清雌激素随人参剂量增加而升高(144.49±35.35vs 167.81±20.59vs 183.18±21.49)且子宫的萎缩程度逐渐减轻(1.952±0.527vs 3.120±1.120vs 4.379±1.602),且高剂量人参粉组与去卵巢对照组比较差异具有统计学意义(P<0.05)。各组血清铁代谢指标无明显变化;去卵巢后肝脏铁调素(Hepcidin)mRNA表达水平明显降低(11.11±2.34vs 8.66±2.14),FPN mRNA的表达水平升高(2.78±0.49vs 4.27±0.74),BMP6mRNA表达水平有所降低(4.56±0.44vs 3.93±0.73)且分别与假手术组比较差异明显(P<0.05);高剂量组人参粉Hepcidin的缓解性升高(10.82±2.40,P<0.05)及高、中剂量组的FPN mRNA缓解性降低分别与去卵巢对照组比较具有统计学意义(P<0.05);各剂量组人参粉对BMP6mRNA表达水平均未见明显影响。结论一定剂量人参粉长期喂养去卵巢大鼠能够通过调节其肝脏Hepcidin、FPN mRNA表达水平及血清雌激素水平,部分缓解雌激素下降引起的不良影响,提示了人参粉通过影响雌激素和Hepcidin-FPN轴对肝脏铁代谢产生影响,维持部分铁稳态。
- 陈蕾李楠张琨
- 关键词：去卵巢大鼠铁代谢
- 关于医学生临床实践能力培养的几点思考被引量：74
- 2003年
- 安力彬王彦鹏李楠
- 关键词：医学生临床实践能力教学质量教学模式师资队伍建设
- 我国目前医疗事故的处理现状及建议
- ＜正＞新的《医疗事故处理条例》从2002年9月1 日正式实施到今天已经接近五年了。条例针对新形势下科学、公正地处理医疗事故的要求,明确了卫生行政部门在医疗事故处理工作中的职责,将行政处理与司法程序严格区分开来,有利于及时...
- 范哲李丹李楠李鸿雁崔志刚
- 文献传递
- 基于生物信息学分析女性多发肿瘤CDH1的研究
- 目的：应用癌症基因组图谱(TCGA),GEO 数据库分析女性多发肿瘤(乳腺癌,卵巢癌,子宫内膜癌,子宫肉瘤,子宫颈癌)E-钙黏蛋白(CDH1)基因表达,改变和蛋白磷酸化以及相关通路的富集分析。方法：用TIMER2 和GE...
- 陈蕾李楠张琨
- 关键词：E-钙黏蛋白
- 双酚A与子宫内膜异位症相关性不孕的研究进展
- 双酚A(Bisphenol A,BPA)作为一种可干扰机体内源性激素的环境内分泌干扰物,广泛存在于塑料制品中,影响机体的生殖、胚胎发育、神经及免疫系统、肿瘤发生等。子宫内膜异位症(endometriosis,EMS)是育...
- 段雨含李楠张琨
- 关键词：双酚A子宫内膜异位症环境内分泌干扰物雌激素不孕
