李永君
- 作品数:13 被引量:12H指数:2
- 供职机构:中国科学院北京基因组研究所更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家高技术研究发展计划国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- miRNA调控恶性黑色素瘤细胞上皮-间充质转化的分子网络及机制被引量:9
- 2015年
- 黑色素瘤是一种极易发生转移的恶性皮肤肿瘤,具有高度的致死性。上皮–间充质细胞转化(Epithelial-mesenchymal transition,EMT)在胚胎发育过程中起到非常重要的作用,同时在肿瘤的发生和恶化过程中也扮演着重要的角色。mi RNA具有广谱的调节能力,对于肿瘤发生和EMT形成都能产生不同程度的影响。本文整合黑色素瘤细胞系转录组和mi RNA组测序数据,在转录组数据中筛选得到参与肿瘤EMT过程的基因,通过Mirsystem软件预测并从mi RNA组数据中筛选出与之负相关的11个mi RNA,包括mi R-130a-3p、mi R-130b-3p、mi R-125a-5p、mi R-30a-3p、mi R-195-5p、mi R-345-5p、mi R-509-3-5p、mi R-374a-5p、mi R-509-5p、mi R-148a-3p和mi R-330-3p。经过生物信息学分析mi RNA靶基因富集的分子网络和信号途径,发现了两个与细胞发育和细胞间相互作用密切相关的网络,以及多个参与调控EMT过程的信号通路。对11个mi RNA进行分子生物学验证,发现mi R-195-5p、mi R-130a-3p、mi R-509-5p和mi R-509-3-5p共4个可以调节重要肿瘤基因的mi RNA。本研究运用m RNA和mi RNA两种转录组的测序数据筛选EMT相关mi RNA的方法,为肿瘤多组学数据整合分析提供了新的研究思路,并以期能为肿瘤精准基因组学的发展发挥重要的推进作用。
- 王冬李永君丁楠王均云杨琼杨雅冉李艳明方向东赵华
- 关键词:转录组
- 一种特异性抑制TWIST1基因表达的小干扰RNA及其应用
- 本发明提供了一种特异性抑制TWIST1基因的小干扰RNA及其应用。本发明小干扰RNA的正义链和反义链序列分别如SEQ ID NO.1‑2所示。该小干扰RNA干扰的TWIST1靶序列如SEQ ID NO.3所示,其通过作用...
- 方向东赵华李永君杨琼
- 文献传递
- 非编码RNA调控上皮间充质化及肿瘤干细胞的研究进展
- 2014年
- 肿瘤干细胞是具有自我更新能力并能发展成为不同分化程度的肿瘤的一类细胞,它的存在是肿瘤转移和复发的重要原因。最新研究表明,肿瘤干细胞可通过肿瘤细胞的上皮–间充质化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)产生。作为研究细胞调控的热点—非编码RNA,通过调控EMT可能会促使肿瘤细胞获得肿瘤干细胞特征。该文主要综述了近年来非编码RNA调控肿瘤细胞EMT以及干性获得的研究进展,以有助于理解肿瘤中非编码RNA的调控机制和功能。
- 杨琼李永君方向东
- 关键词:非编码RNA肿瘤干细胞
- 一种特异性抑制CTGF基因表达的小干扰RNA及其应用
- 本发明提供了一种特异性抑制CTGF基因的小干扰RNA及其应用。本发明小干扰RNA的正义链和反义链序列分别如SEQ ID NO.1‑2所示。该小干扰RNA干扰的CTGF靶序列如SEQ ID NO.3所示,其通过作用于CTG...
- 方向东赵华李永君杨琼彭四娥
- 文献传递
- 一种特异性抑制MAGEA1基因表达的小干扰RNA及其应用
- 本发明提供了一种特异性抑制MAGEA1基因的小干扰RNA及其应用。本发明小干扰RNA的正义链和反义链序列分别如SEQ?ID?NO.1-2所示。该小干扰RNA干扰的MAGEA1靶序列如SEQ?ID?NO.3所示,其通过作用...
- 方向东赵华李永君杨琼
- 文献传递
- 一种特异性抑制MAGEA1基因表达的小干扰RNA及其应用
- 本发明提供了一种特异性抑制MAGEA1基因的小干扰RNA及其应用。本发明小干扰RNA的正义链和反义链序列分别如SEQ ID NO.1‑2所示。该小干扰RNA干扰的MAGEA1靶序列如SEQ ID NO.3所示,其通过作用...
- 方向东赵华李永君杨琼
- 文献传递
- HEY1在恶性黑素瘤转移机制中的作用
- 目的 恶性黑素瘤在皮肤肿瘤中病死率最高,且恶性黑素瘤的转移是造成死亡的主要原因.Notch信号通路在肿瘤转移的EMT(上皮间充质转化)过程中有重要作用,且Notch信号通路的这一作用在恶性黑素瘤中也有报道.HEY1为No...
- 王睿李永君
- 一种特异性抑制MAGEA1基因表达的小干扰RNA及其应用
- 本发明提供了一种特异性抑制MAGEA1基因的小干扰RNA及其应用。本发明小干扰RNA的正义链和反义链序列分别如SEQ ID NO.1‑2所示。该小干扰RNA干扰的MAGEA1靶序列如SEQ ID NO.3所示,其通过作用...
- 方向东赵华李永君杨琼
- 文献传递
- 一种特异性抑制TWIST1基因表达的小干扰RNA及其应用
- 本发明提供了一种特异性抑制TWIST1基因的小干扰RNA及其应用。本发明小干扰RNA的正义链和反义链序列分别如SEQ?ID?NO.1-2所示。该小干扰RNA干扰的TWIST1靶序列如SEQ?ID?NO.3所示,其通过作用...
- 方向东赵华李永君杨琼
- 文献传递
- MAGEA1通过激活Wnt/β-catenin信号通路促进恶性黑色素瘤的转移被引量:3
- 2021年
- 背景恶性黑色素瘤是源自黑色素细胞的恶性肿瘤,恶性程度高。其中转移性黑色素瘤患者的5年生存率不足10%,且发病率逐渐增加。黑色素瘤相关抗原家族A1(melanoma associated antigen family A1,MAGEA1)是MAGE-A基因亚家族的成员,在多种恶性肿瘤中均有表达,但其在恶性黑色素瘤中的表达和作用机制尚不明确。目的探讨MAGEA1促进恶性黑色素瘤转移的信号通路,并进行验证。方法通过黑色素瘤细胞系A375与A2058的RNA-Seq数据分析,确定MAGEA1正向调控Wnt/β-catenin信号通路,利用TOP/FOP、免疫荧光染色研究通路活性,利用Western blot和qRT-PCR分别在蛋白水平与转录水平验证通路基因的表达情况。结果MAGEA1通过c-Jun激活Wnt/β-catenin信号通路,促进黑色素瘤细胞上皮-间充质转化,提高黑色素瘤细胞的侵袭与迁移能力。结论MAGEA1作为一种与恶性肿瘤转移相关的基因,在恶性黑色素瘤中可通过激活Wnt/β-catenin信号通路促进细胞的转移。
- 许媛媛王晨贺赞王冬杨琼李永君郝永红胡辉莹方向东赵华
- 关键词:恶性黑素瘤WNT/Β-CATENIN信号通路