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刘驰
作品数:
1
被引量:107
H指数:1
供职机构:
中国科学院成都生物研究所
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发文基金:
国家自然科学基金
国家重点基础研究发展计划
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相关领域:
生物学
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合作作者
安家兴
中国科学院成都生物研究所
李家宝
中国科学院成都生物研究所
李香真
中国科学院成都生物研究所
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作者
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李香真
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李家宝
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安家兴
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刘驰
传媒
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生态学报
年份
1篇
2015
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16S rRNA基因在微生物生态学中的应用
被引量:107
2015年
16S rRNA(Small subunit ribosomal RNA)基因是对原核微生物进行系统进化分类研究时最常用的分子标志物(Biomarker),广泛应用于微生物生态学研究中。近些年来随着高通量测序技术及数据分析方法等的不断进步,大量基于16S rRNA基因的研究使得微生物生态学得到了快速发展,然而使用16S rRNA基因作为分子标志物时也存在诸多问题,比如水平基因转移、多拷贝的异质性、基因扩增效率的差异、数据分析方法的选择等,这些问题影响了微生物群落组成和多样性分析时的准确性。对当前使用16S rRNA基因分析微生物群落组成和多样性的进展情况做一总结,重点讨论当前存在的主要问题以及各种分析方法的发展,尤其是与高通量测序技术有关的实验和数据处理问题。
刘驰
李家宝
芮俊鹏
安家兴
李香真
关键词:
RRNA基因
微生物群落
多样性
高通量测序
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