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彭冉

作品数:3 被引量:1H指数:1
供职机构:德州学院物理与电子信息学院更多>>
发文基金:山东省自然科学基金国家自然科学基金更多>>
相关领域:生物学医药卫生更多>>

文献类型

  • 2篇期刊文章
  • 1篇会议论文

领域

  • 2篇生物学
  • 1篇医药卫生

主题

  • 2篇动力学
  • 2篇动力学模拟
  • 2篇抗菌肽
  • 2篇分子
  • 2篇分子动力学
  • 2篇分子动力学模...
  • 2篇LL-37
  • 1篇原子
  • 1篇原子模型
  • 1篇细胞
  • 1篇细胞膜
  • 1篇细菌
  • 1篇细菌膜
  • 1篇胞膜
  • 1篇VALUE
  • 1篇CHARAC...
  • 1篇MOLECU...
  • 1篇PH
  • 1篇ANTIBA...
  • 1篇PEPTID...

机构

  • 3篇德州学院
  • 3篇山东师范大学

作者

  • 3篇赵立岭
  • 3篇彭冉
  • 2篇曹赞霞
  • 2篇王吉华
  • 1篇毛文超

传媒

  • 1篇中国抗生素杂...
  • 1篇德州学院学报
  • 1篇第六届全国生...

年份

  • 1篇2015
  • 2篇2014
3 条 记 录,以下是 1-3
排序方式:
The effect of pH value on the conformational character of the core region (18-29) of the antimicrobial peptide LL-37 by molecular dynamics simulations
Background: LL-37 is an amphipathic α-helical antimicrobial peptide which is the unique member of Cathelicidin...
彭冉赵立岭曹赞霞王吉华
关键词:ANTIBACTERIALPEPTIDESMOLECULARLL-37
抗菌肽与细胞膜相互作用机制的分子动力学模拟研究被引量:1
2014年
抗菌肽由于其具有天然抗菌特性,且对生物体毒副作用小,有望作为新一代抗菌药物而得到了广泛的关注.作为研究生物大分子的有效工具,分子动力学模拟技术被用来研究抗菌肽的抗菌机制及与细菌膜的相互作用.回顾近年来抗菌肽与膜相互作用分子动力学模拟研究,理清利用全原子模型和粗粒化模型模拟抗菌肽与细菌膜作用情况,包括模拟力场的选择、细菌膜模型的建立,以及利用模拟得到肽/膜作用信息等,对了解抗菌肽的抗菌活性及新药设计提供帮助.
彭冉毛文超赵立岭曹赞霞王吉华
关键词:抗菌肽分子动力学模拟细菌膜
基于分子动力学模拟研究pH对抗菌肽LL-37结构的影响
2015年
目的研究溶液p H变化对抗菌肽LL-37结构的影响。方法利用分子动力学模拟方法,采用GROMACS软件包和OPLS-AA力场,分别在中性和强碱性条件下对LL-37进行模拟,总模拟时间达1微秒,最后对模拟轨迹进行分析处理。结果LL-37在中性环境下具有部分螺旋结构存在,特别是N端部分残基,结构具有较大柔性;在强碱性环境下,螺旋含量增多,抗菌核心区域残基形成螺旋结构的几率明显增大,结构稳定性增强。结论 p H值的增大会促进LL-37螺旋结构的形成,螺旋结构的形成和与膜结合是协同的。N端残基易形成螺旋,然后是抗菌核心区域。LL-37在中性环境下的结构特征与其行使多功能的角色相一致。该研究首次分析了LL-37在中性环境下的结构特征及p H的影响,有助于认识其抗菌机制及新药设计。
彭冉赵立岭曹赞霞王吉华
关键词:分子动力学模拟抗菌肽LL-37
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