为完成黍子最佳AFLP(amplified fragment length polymorphism)体系的构建,以黍子为研究材料,通过优化AFLP过程的4个限制因素,确定AFLP的最佳反应体系为:选取300 ng DNA进行酶切,将酶切产物稀释0倍作为模板进行预扩增,得到的产物稀释20倍作为模板进行选择性扩增,选用方法二对PCR产物进行银染。应用该最佳反应体系进行黍子真伪杂交种的验证,取得了同样理想的效果,扩增出清晰可辨的条带,鉴定出黍子的真正杂交种。本研究为黍子的分子研究提供了技术基础。
为系统研究谷子(Setaria italica)参与DNA甲基化修饰相关酶类的编码基因,本研究以测序品种‘豫谷1’为材料,水稻(Oryza sativa L.) DNA甲基化修饰相关酶类基因作为参考,运用序列比对和系统进化树构建的方法,得到13个参与谷子DNA甲基化修饰相关的酶类基因,这些基因与水稻的相应基因相似度为64%~80%。谷子与水稻中DNA甲基化修饰相关酶类基因在系统进化树上主要分成了三个进化枝,并且同功的DNA甲基化修饰相关酶类基因在分枝上彼此相邻。同时,实时荧光定量PCR筛选出13对在谷子中能成功扩增的引物,并对实时荧光定量PCR的程序进行确立和优化。本研究为深入开展谷子的表观遗传学研究提供了科学依据。
