陈亮 作品数:17 被引量:69 H指数:5 供职机构: 山西农业大学生命科学学院 更多>> 发文基金: 山西省科技攻关计划项目 山西省普通本科高等教育教学改革研究项目 国家现代农业产业技术体系建设项目 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
曼地亚红豆杉染色体核型分析 2017年 利用曼地亚红豆杉硬枝扦插产生的不定根,进行根尖染色体制片,并做核型分析。结果发现,曼地亚红豆杉染色体数目为2n=2x=24,核型公式为2n=24=20m+2sm+2st,曼地亚红豆杉中部着丝粒染色体(m)为10对,近中部着丝粒染色体(sm)为1对,近端着丝粒染色体(st)为1对,曼地亚红豆杉核型为2A型。 陈亮 崔芬芬 宋芸 朱琴梅 乔永刚关键词:曼地亚红豆杉 染色体 核型 基于转录组金银花AP2基因家族的生物信息学及表达分析 被引量:18 2019年 为研究金银花AP2转录因子参与低温的应答机制,本研究基于低温下金银花转录组测序数据,利用在线生物信息学工具对金银花AP2转录因子的理化性质、亚细胞定位、磷酸化位点、蛋白基序以及进化分析进行鉴定和分析;利用实时荧光定量PCR检测3个DREB基因和1个RAV基因在低温胁迫下的表达情况。结果表明,在金银花中共筛选了34个AP2转录因子,不同转录因子之间的理化性质存在差异,表明其在不同的微环境中发挥不同的功能;亚细胞定位结果显示,仅有2个AP2定位于叶绿体,其余均定位于细胞核,符合其作为转录因子调控下游基因的表达特性;所有AP2的磷酸化位点均依次表现为丝氨酸>苏氨酸>酪氨酸;根据AP2中所含有的AP2数量以及序列同源性,可将34个AP2分为四个大类,20个AP2属于ERF亚家族,3个属于DREB亚家族,RAV亚家族仅有1个,其余10个属于AP2亚家族。实时荧光定量PCR检测结果表明,DREB和RAV基因均能响应低温胁迫,且不同低温处理时间的不同组织的表达量存在差异。本研究为阐明金银花AP2转录因子响应低温胁迫的机制奠定了一定的理论基础。 乔永刚 陈亮 崔芬芬 曹亚萍 王勇飞 宋芸关键词:金银花 基因鉴定 基于转录组金银花WRKY转录因子的挖掘与分析 被引量:5 2019年 WRKY转录因子是植物抗逆应答过程中最为常见的蛋白家族。为了挖掘金银花抗寒相关的WRKY基因,本研究基于已有的转录组数据,利用植物转录因子数据库和BioEdit对WRKY进行筛选及保守结构域分析,对筛选出的WRKY转录因子利用ExPASy进行理化性质分析,利用PSORT进行亚细胞定位预测,NetPhos进行磷酸化位点分析并且利用MEME数据库对WRKY基因的氨基酸进行序列分析,运用MEGA软件对筛选的金银花WRKY转录因子基因和21个已知抗寒的WRKY基因进行序列同源比对,并构建系统进化树。结果表明:金银花中筛选的30个WRKY基因的蛋白为85~721个氨基酸,理论等电点的范围为4.85到9.76。所有LjWRKY基因编码的蛋白中只有LjWRKY6为稳定蛋白,其余均属于不稳定蛋白,所有蛋白均属于亲水性蛋白。亚细胞定位预测结果,LjWRKY所有蛋白定位于细胞核。除LjWRKY23不具有Try磷酸化位点,其它所有氨基酸均具有Ser、Thr和Try磷酸化位点。LjWRKY蛋白比较保守,WRKYGQK没有发生任何变异,且包含三类WRKY转录因子。系统进化树发现,有12个WRKY基因与已知抗寒基因有同源性,推测其参与了金银花低温逆境下的反应。研究结果可以通过筛选的WRKY基因,进行进一步的转基因验证,进而为植物抗寒分子育种提供分子基础。 陈亮 崔芬芬 王勇飞 曹亚萍 宋芸 乔永刚关键词:金银花 WRKY 系统发育 药用植物金银花Dof基因家族的筛选及表达分析 被引量:2 2020年 Dof(DNA-binding one zinc finger)蛋白是一类植物所特有的转录因子,N-末端具有高度保守的C2-C2单锌指结构域,C-末端的转录调控区的氨基酸具有高度多样性,其在植物光合、细胞周期及逆境响应等过程中发挥着重要的作用。本研究基于金银花测序数据,利用生物信息学的方法筛选了候选的LjDof基因,并对其理化性质、亚细胞定位、同源序列比对、保守基序、系统进化发育和表达模式进行了深入分析。结果表明,金银花Dof转录因子家族包含11个基因,编码的氨基酸的个数为157~492,理论等电点为5.45~9.48,均为不稳定亲水性蛋白。亚细胞定位显示,LjDof基因都在细胞核中有定位,个别在其他部位也有定位。同源比对和Motif分析发现,11个LjDof基因都含有完整的C2-C2单锌指结构。系统进化发育分析表明,金银花Dof蛋白分为五个亚类。实时荧光定量PCR及表达模式分析表明,LjDof基因在金银花低温胁迫不同时间下有着不同的表达规律。本研究结果为进一步研究金银花Dof基因在逆境胁迫下的功能提供了理论基础。 乔永刚 陈亮 王勇飞 崔芬芬 曹亚萍 贺嘉欣 贾孟君 宋芸关键词:金银花 DOF 生物信息学分析 金银花花器官实时荧光定量PCR内参基因的筛选 被引量:5 2017年 为了筛选金银花花器官基因表达分析的适宜内参基因,试验以金银花花器官6个时期为材料,选取金银花的9个候选内参基因Lonja.ACT11,Lonja.ACT2/7,Lonja.G6PD,Lonja.GAPDH,Lonja.MTP,Lonja.TUA,Lonja.UBQ10,Lonja.EF1A,Lonja.UBC,利用q RT-PCR技术及Ge Norm,Norm Finder软件对它们的表达稳定性进行分析评价。结果表明,Lonja.ACT2/7和Lonja.G6PD在金银花花器官生长的不同时期表达水平较稳定,运用q RT-PCR研究金银花花器官基因表达时可选用Lonja.ACT2/7和Lonja.G6PD组合作为内参基因。 刘霞宇 陈亮 乔永刚 宋芸 王金胜关键词:实时荧光定量PCR 内参基因 温度及光照对远志种子发芽的影响 被引量:2 2016年 为研究温度及光照对远志种子发芽的影响,在光照以及黑暗条件下采用7个不同的温度对远志种子进行处理,统计远志种子的发芽率和发芽势等指标。结果表明:温度对远志种子的萌发影响显著,远志种子发芽的最适宜温度为20-30℃,光照或黑暗条件对远志种子的发芽没有影响,即远志种子无论在光照还是黑暗条件下,20-30℃时最适宜发芽。 崔芬芬 陈亮 任艳文 乔永刚 宋芸关键词:远志 温度 光照 种子 发芽 苦参种子硬实性的组织解剖学分析 被引量:6 2019年 硬实是种子常见的休眠类型之一,制约种子的种质创新利用。为研究硬实性的解剖结构,对不同种源的苦参种子的硬实率进行统计,利用石蜡切片法制作苦参种子及不同发育时期的种皮切片进行观察。结果表明,苦参种子具有很高的硬实率,高达93%;苦参种子由种皮、种脐及子叶等结构组成;种皮由角质层、栅栏组织、骨状石细胞、厚壁细胞以及薄壁细胞等组成,种皮结构较复杂,具有典型的豆科种皮结构特征;种脐部位由珠柄残余物和维管系统等组成;苦参子叶富含大量的淀粉粒。并且随着种子的发育,种皮的厚度不断增加,栅栏组织在种皮中所占的比例逐渐增加,这一特征可能是造成苦参硬实的原因之一。不同发育时期苦参种子解剖结构的观察结果可为进一步揭示苦参种子硬实性的形成机制奠定研究基础。 崔芬芬 陈亮 曹亚萍 王勇飞 乔永刚 宋芸关键词:石蜡切片 忍冬ICE1基因的cDNA克隆及表达分析 被引量:5 2019年 采用RT-PCR技术克隆得到忍冬(Lonicera japonica)ICE1(inducer of CBF expression 1)基因LjICE1(GenBank:MK584895),其cDNA序列全长为1575 bp,编码524个氨基酸,理论等电点5.58,为不稳定亲水性蛋白,含多个糖基化和磷酸化位点,且具有类似MYC元件的bHLH结构。同源比对发现ICE1蛋白含有富S区、NLS区、bHLH结构域、Zipper结构域和跨膜区,系统进化分析发现LjICE1与茶树(Camellia sinensis)的亲缘关系最近。RT-qPCR结果表明,LjICE1基因在低温胁迫3 h时表达量最高。本研究为进一步解析忍冬低温响应机制提供了基因资源。 乔永刚 贾孟君 陈亮 崔芬芬 王勇飞 曹亚萍 王文斌 宋芸关键词:忍冬 基因克隆 生物信息学 基因表达 苦参种子形态解剖结构研究 被引量:5 2017年 用体视显微镜观察苦参种子的形态,并且对用常规石蜡切片法制作的苦参种子横切结构进行观察。结果表明:苦参的种子呈卵圆形,平滑而有光泽,种皮呈黄褐色,有明显的种脐。苦参种子的横切面解剖结构特征为:最外层为栅栏组织逐渐加厚而形成的角质层;表皮层下面为"工"字形的骨状石细胞;种脐部位有较为发达的维管系统;苦参子叶较大,富含大量的淀粉粒。加厚的角质层和骨状石细胞增强了苦参种皮的保护功能,这一特征可能是苦参种子休眠的原因之一。苦参种子形态解剖结构观察为进一步研究苦参种子休眠和硬实性的形成奠定基础。 宋芸 崔芬芬 陈亮 王立 乔永刚关键词:石蜡切片 形态解剖结构 温度及光照对苦参种子萌发的影响 被引量:9 2017年 为获得苦参种子发芽适宜的温度和光照条件,试验选择5,10,15,20,25,30,35℃共7个温度梯度,分别在全光照或全黑暗下进行处理,研究温度及光照对苦参种子萌发的影响。结果表明,适宜苦参种子萌发的温度为15~30℃,且15℃时发芽率达到最高;全光照或全黑暗对苦参种子的发芽情况影响不明显。 刘霞宇 乔永刚 陈亮 崔芬芬 王金胜关键词:苦参 温度 光照 种子萌发