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基于LAMP技术的对虾白斑综合征病毒现场快速高灵敏度检测试剂盒的评价被引量：4: 2016年; 根据OIE《水生动物诊断手册》、农业部公告第683号和质检行业标准等规范性技术文件,为验证本实验室基于环介导恒温扩增技术(LAMP)研发的对虾白斑综合征病毒(WSSV)现场快速高灵敏度检测试剂盒的有效性,本研究对随机抽样的157套试剂盒的分析特异性(ASp)、分析灵敏度(ASe)、诊断特异性(DSp)、诊断灵敏度(DSe)、重复性和稳定性等进行分析和评价。ASp结果显示该试剂盒与黄头病毒、偷死野田村病毒、肝胰腺细小病毒、致急性肝胰腺坏死病副溶血弧菌、虾肝肠胞虫、传染性皮下及造血组织坏死病毒6种对虾病原及对虾组织核酸均无交叉反应;ASe为102拷贝/μL;与OIE标准中WSSV的套式PCR方法相比,该试剂盒测试374份临床样品的DSp为95.8%,DSe为94.6%;该试剂盒对阴性样品及强阳性样品的检测重复率为100%,弱阳性样品的检测重复率为88.9%;该试剂盒可以在-20℃保存6个月以上。所研制的WSSV现场快速高灵敏检测试剂盒与OIE标准套式PCR方法检测结果符合率高。本研究结果表明该试剂盒具有操作简便、快速、灵敏度高、特异性强、重复性好稳定性强等优点,能够满足实际应用中的WSSV高灵敏度检测需求。; 马芳张庆利万晓媛邱亮黄倢; 关键词：白斑综合征病毒诊断试剂试剂盒

基于等温扩增技术的对虾白斑综合征病毒现场快速高灵敏度检测试剂盒的评价及优化: 传统捕捞业已经难以满足未来世界对鱼类和甲壳类动物的需求,海水养殖已经进入了新的领域;虾体在养殖过程中遇到新病原的风险也将增大。对虾病原传播的原因有:对养殖对虾不规范的引入造成对虾病原的跨区域传播,以及用鲜活饵料去喂养SP...; 马芳; 关键词：白斑综合征病毒诊断试剂盒

我国一株新型黄头病毒的分子流行病学被引量：4: 2016年; 为查明黄头病毒(Yellow Head Virus,YHV)在我国的存在和变异情况,本研究采用世界动物卫生组织(OIE)《水生动物诊断手册》中YHV套式RT-PCR检测方法对2012–2014年采集的299份样品进行了YHV监测,并对部分YHV阳性样品基因进行了克隆测序及系统发育分析。流行病学调查显示,299份样品中YHV的阳性率为11%,我国养殖的中国明对虾、凡纳滨对虾、日本囊对虾以及罗氏沼虾的部分样品中均检出了YHV,中国明对虾和罗氏沼虾是本次调查中新发现的YHV自然宿主,而且YHV在中国明对虾中的检出率最高。对6份较强阳性样品YHV基因组ORF1b内1002 bp的分型片段进行克隆测序和序列分析,序列比对结果显示,阳性样品的YHV与国外报道的YHV的6个基因型相似度为81.0%–90.5%;系统发育分析显示,6份阳性样品归于同一分支,但与已知YHV的6个基因型均不在同一分支内,其与YHV基因1型(YHV-1)亲缘关系较近。对阳性样品YHV基因组ORF3内编码gp116蛋白的一段序列进行克隆测序,得出其序列长度为509 bp,与YHV-1a的545 bp、YHV-1b的383 bp和YHV-2(即鳃联病毒GAV)的476 bp均不同;依据该片段构建的系统发育树显示,6份阳性样品归于同一分支,与YHV已知的6个基因型不同,与YHV-1亲缘关系较近,且与YHV-1a相似度大于YHV-1b。对其中两份样品的ORF2序列进行比对显示,两份样品序列相似性为99.8%,蛋白序列完全相同,与YHV-1的序列相似度为85.9%,与YHV-2相似性为80.9%。样品调查结果对增补YHV的宿主范围有重要意义;YHV核酸检测和序列比对结果表明,感染我国养殖对虾的YHV为一种新的致病株型。; 朱罗罗张庆利万晓媛邱亮马芳黄倢; 关键词：新基因型系统发育树对虾流行病学

对虾白斑综合征病毒现场快速高灵敏检测试剂盒的评价: 目的评价本实验室研发的对虾白斑综合征病毒(WSSV)现场快速高灵敏检测试剂盒的相关性能。方法根据OIE《水生动物诊断手册》、农业部公告第683号和质检行业标准等规范性技术文件,随机挑取参试试剂盒一共157套;对抽样试剂盒...; 马芳张庆利万晓媛邱亮黄倢; 关键词：白斑综合征病毒

虾肝肠胞虫(Enterocytozoon hepatopenaei)实时荧光定量PCR检测方法的建立及对虾样品的检测被引量：49: 2016年; 根据Gen Bank中公布的虾肝肠胞虫(Enterocytozoon hepatopenaei)(EHP)SSU r DNA序列设计1对特异性引物,建立并优化了EHP的SYBR Green I实时荧光定量PCR(q PCR)检测方法。结果显示,该方法在60℃的退火温度时扩增效果最好,产物的熔解曲线为1个单峰,构建的方法对8.3×101–8.3×108 copies/μl的EHP SSU r DNA片段的检测响应具有良好的线性关系,扩增产物阈值循环数(Ct)与模板起始量的对数[log(Sq)]的关系为Ct=–3.369 log(Sq)+39.364(R2=0.992),扩增效率为98.1%,检测灵敏度下限为8.3×101 copies/μl,在线性范围内具有良好的组内和组间重复性。对实际样品的检测表明该方法比已报道的套式PCR的检测灵敏度约高4倍。利用本方法对采集自江苏、海南和山东的3批凡纳滨对虾样品的肝胰腺组织DNA(Hp DNA)中的EHP SSU r DNA进行了q PCR检测,结果显示,EHP的载量指数与对虾生长速率呈负相关关系,肝胰腺中EHP载量在103 copies/(ng Hp DNA)时代表了较高的风险水平。本研究建立的q PCR方法具有特异、灵敏、快速、定量的优点,所建立的方法及检测数据可为EHP的防控提供技术参考。; 刘珍张庆利万晓媛马芳黄倢; 关键词：实时荧光定量PCR SYBR I

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马芳

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