周冉 作品数:15 被引量:26 H指数:3 供职机构: 南京医科大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家科技攻关计划 更多>> 相关领域: 医药卫生 更多>>
1例Dandy-Walker综合征合并Xq28重复综合征胎儿的遗传学分析 被引量:3 2021年 目的对1例超声检查提示为Dandy-Walker综合征和先天性心脏病的胎儿进行遗传学分析。方法取引产胎儿的皮肤样本,进行单核苷酸多态性微阵列分析(single nucleotide polymorphism array,SNP array),并采用多重连接依赖探针扩增技术(multiplex ligation-dependent probe amplification,MLPA)进行验证。胎儿父母外周血样本进行荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)分析。结果SNP array分析结果显示胎儿染色体6p25.3p25.1存在5.4 Mb缺失,Xq28存在4.2 Mb重复,均为致病性拷贝数变异。MLPA验证结果与SNP array结果一致。胎儿父母外周血的FISH分析结果显示未发现相关片段的缺失、重复或易位等异常。结论胎儿6p25.3p25.1缺失和Xq28重复均为新发变异,可能与超声提示Dandy-Walker综合征和先天性心脏病有关。 谭建新 王艳 林颖 冯浩洋 周冉 许争峰关键词:DANDY-WALKER综合征 荧光原位杂交 1例染色体结构变异无精症患者的纳米孔测序临床应用 2022年 目的评价牛津纳米孔测序技术(oxford nanopore technologies,ONT)在诊断复杂结构变异中的临床应用价值。方法采集1例复杂结构变异的非梗阻性无精症患者外周血样本,以染色体G显带核型分析(karyotype analysis)与染色体微阵列分析(Chromosomal microarray analysis,CMA)为参考,进行纳米孔测序寻找致病原因,评价纳米孔测序对变异的检出能力。结果在该患者的基因组中发现,CMA检测出4个缺失,5个重复,共计9个临床意义不明的染色体拷贝数变异(VOUS),3例纯合子状态区段(regions of homozygosity,ROH)以及15q15.3区段缺失,内含PPIP5K1、CKMT1B、STRC、CATSPER2基因;纳米孔测序共检测出6260个缺失、5624个插入、115个重复、22个倒位、32个易位,共计12053个结构变异,能够注释5559个结构变异影响2406个基因;纳米孔测序鉴定出平衡易位46,XY,t(1;3)(q22;q28)与染色体核型结果46,XY,t(1;3)(q21;q27)基本一致,在Chr1:156359988-156363186区域存在3198 bp缺失,该区域影响的基因有TSACC、RHBG和FGF12。结论纳米孔测序技术可快速、高效、准确检测人外周血标本中染色体复杂结构变异和受影响的基因,可检测出传统检测方法无法检出的缺失片段,是常规方法的补充,具有重要的临床应用价值。 王亚 黄明涛 刘安 周冉 张沁欣 胡平 许争峰关键词:基因 全基因组测序用于肾脏异常胎儿的产前诊断 被引量:1 2022年 目的应用全基因组测序技术对4例肾脏异常胎儿进行遗传学检测,以寻找其可能的遗传学病因。方法对4例肾脏异常胎儿的孕妇抽取羊水及胎儿父母外周血进行DNA提取,行全基因组测序检测,根据美国医学遗传学与基因组学学会(American College of Medical Genetics and Genomics,ACMG)原则对数据进行判定,拷贝数变异结果与SNP-array结果进行比对,致病性点变异行Sanger测序验证。结果全基因组测序技术检测2例胎儿为拷贝数变异致病,分别为染色体17q12缺失1.45 Mb和1q21.1-21.2重复1.85 Mb;2例胎儿为基因变异致病,分别为PKHD1 c.8301del(p.Asn2768Thr fs*18)和c.4481del(p.Asn1494Thrfs*6)复合杂合变异和BBS12:c.1372dup(p.Thr458Asnfs*5)纯合变异。SNP-array和Sanger测序结果与全基因组测序数据一致。根据ACMG遗传变异分类标准与指南,PKHD1 c.8301del(p.Asn2768Thr fs*18)和c.4481del(p.Asn1494Thrfs*6)变异均为致病性变异(PVS1+PM2+PM3+PP4),BBS12:c.1372dup(p.Thr458Asnfs*5)变异判定为可能致病性变异(PVS1+PM2)。结论全基因组测序技术可以高效快速的为产前肾脏异常胎儿提供遗传学诊断,并为遗传咨询提供依据。 乔凤昌 胡平 张翠平 王艳 周冉 罗春玉 许争峰关键词:全基因组测序 肾脏异常 产前诊断 拷贝数变异 基因变异 高通量连接探针扩增联合染色体微阵列分析技术在早期自然流产遗传学诊断中的应用 被引量:2 2022年 目的:探讨高通量连接探针扩增(HLPA)联合染色体微阵列分析(CMA)技术在早期自然流产遗传学诊断中的应用价值。方法:收集2020年2月至2021年2月在南京市妇幼保健院就诊的早期自然流产患者722例,分离绒毛并提取DNA,采用荧光定量PCR(QF-PCR)技术排除严重母体污染样本后,进行HLPA检测,HLPA检测结果阴性的样本进一步行CMA检测。结果:排除10例严重母体污染样本后,最终共纳入712例早期自然流产患者;HLPA联合CMA技术在早期自然流产患者中总体染色体异常检出率为60.0%(427/712),其中异倍体为45.9%(327/712),多倍体为8.8%(63/712),染色体大片段结构异常为3.4%(24/712),致病性拷贝数变异为1.3%(9/712),全基因组单亲二倍体为0.6%(4/712)。染色体异常率在首次自然流产与复发性流产患者中分别为61.6%(265/430)、57.4%(162/282),两者比较,差异无统计学意义( χ2=1.240, P=0.265)。 结论:染色体异常是早期自然流产最常见的原因,HLPA联合CMA技术具有快速、准确、经济等优势,有望在早期自然流产遗传学诊断中得以推广。 周冉 王艳 孟露露 朱玉青 林迎春 李一鸣 胡平 许争峰关键词:早期自然流产 遗传学诊断 染色体异常 异倍体 拷贝数变异 X染色休遗传变异在精子生成中的作用及其机制 不孕不育是生殖健康领域亟待解决的重大科学问题。据世界卫生组织(World Health Organization,WHO)报道,约10%~15%的育龄夫妇存在生育障碍,其中由男方因素导致的不育约占50%。近半个世纪,人类... 周冉关键词:非梗阻性无精子症 精原干细胞 非梗阻性无精子症 拷贝数变异 文献传递 线粒体相关精浆微小核糖核酸作为人类严重弱精子症发生的标志物及其应用 本发明属于基因工程及生殖医学领域,公开了线粒体相关精浆微小核糖核酸作为人类严重弱精子症发生的标志物及其应用。该标志物为一些miRNA为线粒体相关miRNA,选自hsa‑miR‑101‑3p、hsa‑miR‑151a‑5p... 陆春城 周冉 秦玉峰 王嵘 傅广波 王晓燕 夏彦恺 王心如文献传递 染色体15q13.3微缺失和微重复胎儿的产前诊断及妊娠结局 2023年 目的:探讨染色体15q13.3微缺失和微重复胎儿在胎儿期的临床表现及妊娠结局。方法:收集2016年1月至2022年8月于南京市妇幼保健院诊断为15q13.3微缺失和微重复胎儿,结合已报道的产前诊断病例,归纳总结胎儿期表型并对遗传学特点及妊娠结局进行分析。结果:本中心7152例胎儿中,共检出3例(0.04%)15q13.3微缺失胎儿和1例(0.01%)15q13.3微重复胎儿。文献检索出15q13.3微缺失和微重复胎儿各1例。15q13.3微缺失:4例胎儿表型包括胆囊未显示、侧脑室轻度增宽、肠管回声增强和羊水增多,其中3例遗传自父母(2例父亲异常表型,1例母亲正常表型);随访发现3例选择终止妊娠,1例选择继续妊娠。15q13.3微重复:2例胎儿均遗传自表型正常母亲,其中1例存在心脏异常;随访发现2例胎儿中1例选择终止妊娠,1例选择继续妊娠。结论:15q13.3微缺失胎儿产前表型多样,多数遗传自父母,其中男性可能更易发病,孕妇多选择终止妊娠。15q13.3微重复胎儿产前可能有心脏异常表现,其致病性尚不明确,需进一步积累病例和随访数据。对产前诊断出15q13.3微缺失或微重复的胎儿进行遗传咨询时,建议充分考虑胎儿的临床信息和家族史,全面评估胎儿的潜在风险和疾病倾向,为孕妇提供准确的信息和合理的决策。 周冉 王艳 孟露露 许伊云 焦娇 李一鸣 胡平 许争峰关键词:产前诊断 基因组光学图谱技术在产前诊断中的应用 2023年 目的探讨基因组光学图谱技术(optical genome mapping,OGM)应用于产前诊断的可行性及临床应用价值。方法收集2022年6月至8月因超声软指标异常或结构畸形于南京市妇幼保健院行羊膜腔穿刺的病例60例,常规进行染色体微阵列分析(chromosomal microarray analysis,CMA)联合核型分析,平行进行OGM检测。以CMA联合核型分析的结果为对比,分析OGM在各类染色体变异中的检测效能。对于OGM额外检出的隐匿性重排使用荧光原位杂交验证。结果OGM与CMA联合核型分析在非整倍体、拷贝数变异、三倍体检测中的检出率差异无统计学意义(P<0.05)。OGM检测证实了6例存在染色体微重复的病例,确定了重复插入的位置及方向;额外检出了2例(3.3%)隐匿性易位,并确定了断裂点所处区间。结论OGM能以高分辨率一站式检测各种主要类型的结构变异并可明确重排模式及精细化断点,有望在产前诊断中成为CMA联合核型分析的可靠替代方案。 许伊云 张沁欣 季修庆 周冉 罗春玉 王艳 孟露露 胡平 许争峰关键词:产前诊断 染色体微阵列分析技术在复发性自然流产遗传学诊断中的应用 被引量:1 2023年 目的:探讨染色体微阵列分析(CMA)在复发性自然流产(RM)遗传学诊断中的应用价值,研究既往流产次数与胚胎染色体异常率的关系以及致病性微缺失/微重复与RM的相关性。方法:选取2011年8月至2021年9月在南京医科大学附属妇产医院就诊的1355例RM病例,取流产绒毛行CMA检测。结果:排除14例(1.0%,14/1355)重度母体细胞污染样本,共1341例病例纳入研究。1341例RM病例中,共检出致病性染色体异常813例(60.6%),其中异倍体597例(44.5%)、多倍体113例(8.4%)、大片段结构异常67例(5.0%)、致病性微缺失/微重复25例(1.9%)、单亲二体(UPD)11例(0.8%)。孕妇流产2次、3次和≥4次组病例的染色体异常率分别为62.6%、56.5%和51.9%,流产2次组病例的染色体异常率显著高于流产3次、≥4次组(P<0.05)。本研究发现5个可能与RM发生相关的复发性(n≥2)致病性微缺失/微重复(15q11.2、19p13.3、22q13.2q13.33微缺失和17p13.3、22q11.1q11.21微重复),其中22q13.2q13.33微缺失是首次报道。结论:染色体拷贝数异常(CNVs)在RM的发病机制中起着重要作用,对RM进行CNVs分析具有重要临床意义。 李一鸣 周冉 孟露露 夏政怡 焦娇 胡平 许争峰 王艳关键词:染色体异常 拷贝数变异 线粒体相关精浆微小核糖核酸作为人类严重弱精子症发生的标志物及其应用 本发明属于基因工程及生殖医学领域,公开了线粒体相关精浆微小核糖核酸作为人类严重弱精子症发生的标志物及其应用。该标志物为一些miRNA为线粒体相关miRNA,选自hsa-miR-101-3p、hsa-miR-151a-5p... 陆春城 周冉 秦玉峰 王嵘 傅广波 王晓燕 夏彦恺 王心如