胡双双
- 作品数:5 被引量:9H指数:2
- 供职机构:安徽理工大学医学院更多>>
- 发文基金:国家质检总局科技计划项目江苏检验检疫局科研项目更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 高分辨率熔解曲线分析技术在鼠形动物鉴定中的应用
- 2016年
- 目的探索一种能够快速鉴定常见鼠形动物的新型分子生物学方法。方法以线粒体基因组(mt DNA)细胞色素b(Cytochrome b,Cytb)基因为靶基因,根据Gen Bank公布的序列,设计测序引物,扩增5种常见鼠形动物的目的基因并测序。依据测序结果和Gen Bank公布的序列,设计分析引物,进行高分辨率熔解曲线分析。以新鲜提取的基因组DNA为模板,按照1∶10的比例梯度稀释,检测7个浓度梯度,进行敏感性检测。结果测序引物扩增出5种鼠形动物Cytb序列,分析引物扩增出5种鼠形动物的熔解曲线,并可根据曲线鉴别5种鼠形动物的种类,检测灵敏度为10-2ng/μl。结论利用高分辨率熔解曲线分析技术,可以快速准确鉴定5种常见鼠形动物。
- 何江周鹏程崔北金吴炳耀胡双双杨庆贵陈峰孙立新
- 关键词:高分辨率熔解曲线分析鼠形动物CYTB基因
- 江苏口岸小家鼠细胞色素氧化酶亚基COI基因的多态性研究被引量:5
- 2017年
- 目的研究小家鼠细胞色素氧化酶亚基COI基因的多态性特征,为国境口岸鼠类的鉴定和溯源提供技术支持。方法通过对江苏口岸本底及输入性小家鼠COI基因的扩增、测序和比对,结合Gen Bank的小家鼠信息,对小家鼠进行遗传多态性分析和分子系统树研究。结果获得81个国内外小家鼠COI基因序列,测出的590个序列位点中保守位点555个,可变异位点35个,核苷酸平均差异数为7.931。建立这些小家鼠COI序列的分子系统树,该分子系统树共分为两支,其中一个分支多以江苏本底的小家鼠为主,另一分支构成复杂。结论不同地区的小家鼠之间具有一定的种内差异,小家鼠种内亚种的划分与地理位置有一定的联系。
- 胡双双吴炳耀何江杨庆贵郭天宇孙立新
- 关键词:小家鼠COI基因基因多样性地理分布
- 小家鼠线粒体DNA控制区多态性和系统进化研究被引量:2
- 2017年
- 目的研究小家鼠线粒体基因组控制区(D-loop)的遗传多态性,为国境口岸鼠类鉴定和溯源提供技术支持。方法以2011-2015年江苏口岸地区捕获的本底和输入性小家鼠为研究对象,设计引物扩增线粒体D-loop基因,对扩增产物进行测序后获得D-loop基因序列,进行基因多态性分析和遗传进化研究。结果共获得21条国内外小家鼠D-loop基因序列,共有17个单倍型,测出533个序列位点,其中保守位点488个,可变异位点41个,核苷酸平均差异数为14.752 38。对21只小家鼠构建遗传进化树,分为3个分支。结论小家鼠种群具有丰富的种内差异,其遗传进化规律与地理分布存在显著的相关性。
- 胡双双陆永昌吴炳耀杨庆贵蔡佳何江孙立新
- 关键词:小家鼠地理分布
- 2014-2015年江苏口岸鼠形动物携带病原体调查分析被引量:1
- 2016年
- 目的了解江苏口岸鼠形动物携带病原体情况,为采取相应的防治措施提供依据。方法采用夹夜法在江苏17个口岸捕获鼠形动物;通过荧光定量PCR法对捕获的鼠形动物进行鼠疫杆菌、汉坦病毒核酸检测,并对阳性标本进行测序分型。结果 418份鼠样中鼠疫杆菌检测均为阴性,汉坦病毒检测有18例阳性,阳性率为4.31%,其中15例为汉城型(SEO),其宿主均为褐家鼠,来源于连云港口岸;其余3例为汉滩型(HTN),其宿主均为黑线姬鼠,来源于南京龙潭港。结论江苏口岸鼠体中未检出鼠疫杆菌,部分口岸鼠体中检出汉滩病毒,提示这些口岸存在肾综合征出血热发生和流行的风险,应加强对相应口岸鼠形动物的监测。
- 崔北金易海华吴炳耀何江胡双双杨庆贵孙立新
- 关键词:鼠形动物鼠疫杆菌汉坦病毒
- 江苏口岸褐家鼠线粒体DNA细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ基因的遗传多态性研究被引量:1
- 2017年
- 目的研究褐家鼠线粒体DNA细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)基因的遗传多态性特征,为国境口岸鼠形动物的鉴定和溯源提供技术支持。方法通过对江苏口岸本底及输入性褐家鼠COⅠ基因的扩增、测序和比对,结合GenBank的褐家鼠信息,对褐家鼠进行遗传多态性分析和系统发育树研究。结果获得48个国内外褐家鼠COⅠ基因序列,测出的605个序列位点中保守位点587个,可变异位点18个,核苷酸平均差异数为(2.510000±0.000640);江苏口岸本底褐家鼠仅为1个单倍型,非江苏口岸褐家鼠多态性丰富。结论不同地区的褐家鼠具有一定的种内差异,该差异与地理位置分布有一定的关系。
- 胡双双吴炳耀何江陆永昌杨庆贵陈峰孙立新
- 关键词:褐家鼠基因多样性地理分布