孙娟
- 作品数:16 被引量:28H指数:4
- 供职机构:内蒙古医科大学附属医院更多>>
- 发文基金:内蒙古自治区自然科学基金内蒙古自治区高等学校科学研究项目更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 基于蛋白激酶的喉癌预后预测模型的构建与评估
- 2022年
- 目的基于蛋白激酶的生物信息学分析构建喉癌预后预测模型,并评价其对喉癌患者预后的预测能力。方法从美国癌症基因组图谱(TCGA)数据库获取96例喉癌患者的样本转录组数据及相关临床数据。利用R语言筛选喉癌预后相关基因,并与蛋白激酶基因取交集,获得与喉癌预后相关的蛋白激酶基因。通过最小绝对收缩与选择算子(LASSO)回归分析构建喉癌预后预测模型并进行风险评分。根据风险评分的中位值将总样本分为高危组和低危组,绘制生存分析曲线及受试者工作特征(ROC)曲线,并通过riskScore和survStat分析评估该模型的预测能力。利用GO功能分析模型中蛋白激酶基因的功能。结果25个蛋白激酶基因与喉癌患者的预后生存时间显著相关(P<0.05)。基于16个蛋白激酶基因构建的喉癌预后预测模型的风险评分能够将喉癌样本分成高危组和低危组,高危组的生存率显著低于低危组(P<0.05)。ROC曲线、riskScore和survStat分析结果显示,该模型具有较高的预测喉癌预后的能力。功能分析结果显示,喉癌预后相关蛋白激酶的功能主要富集在细胞黏附、细胞迁移正性调控、NF-kappaB及JUNK等信号通路的调控等(P<0.05)。结论本研究成功构建了基于蛋白激酶的喉癌预后预测模型,该模型对喉癌患者预后的预测能力较好。
- 孙娟杨莉娜崔昊晶胡文良苏琳
- 关键词:喉癌蛋白激酶预后
- 基于蛋白质互作网络的鼻咽癌基因模块化分析
- 2016年
- 目的基于蛋白质互作网络,筛选调节鼻咽癌的基因模块,为鼻咽癌的分子诊断和治疗提供新的靶点。方法利用GEO数据库中鼻咽癌的数据集(GSE12452)和SAM软件,筛选鼻咽癌中差异表达基因。利用String数据库,建立鼻咽癌中差异表达基因的蛋白质互作网络。基于构建的网络,利用生物信息学模块化分析方法筛选在鼻咽癌发生发展过程中起重要作用的基因模块。根据DAVID数据库,对模块进行GO分析,挖掘模块的调控功能。结果本次研究中共筛选出在鼻咽癌中差异表达的基因2 634个。根据String数据库,我们发现这些差异基因中共有4 729对蛋白质互作对,并据此建立鼻咽癌中的蛋白质互作网络。利用模块化分析筛选出蛋白质互作网络中的7个基因模块,GO分析显示这些模块的功能主要为调控细胞周期、糖代谢、细胞黏附、氧化还原反应等。结论鼻咽癌的蛋白质互作网络中共有7个基因模块,它们对鼻咽癌的发生发展具有重要的调控作用,这些功能模块的发现能够为鼻咽癌的分子靶向诊治提供新的切入点。
- 张姝崔晓波孙娟
- 关键词:鼻咽癌蛋白质互作网络
- 下咽癌中基因功能模块及潜在抗癌药物的筛选
- 2016年
- 目的筛选下咽癌中发挥重要作用的基因功能模块和调节这些模块的潜在抗癌药物,为下咽癌的分子治疗提供新靶点。方法利用GEO数据库和Me V软件筛选下咽癌中差异表达的基因。利用STRING数据库,获得差异基因的蛋白质互作网络关系,然后利用Cystoscape软件的MCODE插件筛选网络中的基因模块。利用DAVID数据库获得基因模块的生物学功能。最后,利用Drug Bank数据库筛选调控这些模块的药物以筛选潜在的抗下咽癌药物。结果在鼻咽癌基因组中,我们共筛选出差异表达基因1 222个(P<0.05),蛋白质互作关系219对,互作网络中的基因模块7个(MCODE分数大于1.5)。功能分析的结果显示5个基因模块参与了肿瘤发生发展相关的重要功能,如血管生成(regulation of angiogenesis)、细胞黏附(cell adhesion)、DNA代谢(DNA metabolic process)等(P<0.05)。药物筛选的结果显示共有50个药物能够调控这5个基因模块。结论共有5个基因模块调控下咽癌,并可能通过调控肿瘤血管生成、细胞黏附等生物学功能来发挥促下咽癌作用。它们的靶向药物可能有潜在的抗癌作用,为下咽癌的分子治疗提供新的靶点。
- 孙娟王薇胡文良孙学威李玲香崔晓波
- 关键词:下咽癌生物信息学抗癌药物
- 下咽癌组织中β-catenin、Oct-4和Nanog的表达及临床意义被引量:1
- 2018年
- 目的探讨下咽癌组织中β-连环蛋白(β-catenin)、Oct-4、Nanog的蛋白表达与临床病理特征及预后的相关性。方法选取2011年3月至2014年5月耳鼻咽喉头颈外科确诊的98例下咽癌患者手术切除的下咽癌组织为研究对象,选择其中24例的癌旁黏膜组织作为对照;酶联免疫吸附法(ELISA)测定下咽癌组织及癌旁黏膜组织中β-Catenin、Oct-4和Nanog蛋白含量,免疫组化法测定两种组织中β-catenin、Oct-4、Nanog蛋白表达情况。生存率评价采用直接计算法。结果 ELISA检测结果显示,下咽癌组织β-catenin、Oct-4、Nanog蛋白含量高于癌旁黏膜组织,差异均有统计学意义(P均<0. 01);免疫组化结果显示,下咽癌组织β-catenin、Oct-4、Nanog蛋白阳性表达率高于癌旁黏膜组织,差异有统计学意义(P均<0. 01);不同年龄者β-catenin、Oct-4、Nanog蛋白表达率无统计学差异(P均> 0. 05);从不同病理特征分析,在病理学分期高、TNM分期高、浸润深度深、有淋巴血管间隙浸润、有淋巴结转移患者中,其β-catenin、Oct-4、Nanog蛋白阳性表达率越高,差异有统计学意义(P均<0. 05);β-catenin、Oct-4、Nanog阴性表达者3年生存率及中位生存期均明显高于β-catenin、Oct-4、Nanog阳性表达者,差异有统计学意义(P <0. 01,P <0. 05)。结论β-catenin、Oct-4、Nanog蛋白可能在下咽癌的发生、发展过程中起促进作用;β-catenin、Oct-4、Nanog蛋白阴性表达者能获得较好的预后。
- 崔昊晶孙娟魏秀娟
- 关键词:下咽癌Β-CATENINOCT-4NANOG基因
- 针灸联合中医汤药治疗突发性耳聋伴耳鸣眩晕的疗效观察分析
- 2023年
- 研究分析针灸联合中医汤药治疗突发性耳聋伴耳鸣眩晕的疗效。方法 研究选取我院2022年1月-2022年12月收治的突发性耳聋伴耳鸣眩晕患者60例,分为对照组与实验组,每组各30例。对照组采用常规西药治疗,实验组加用针灸联合中医汤药治疗。分析比较两组患者治疗有效性、不良反应发生率等指标。结果 与对照组相比,实验组患者治疗有效性增高,不良反应发生率降低,P<0.05,差异具有统计学意义。结论 针灸联合中医汤药治疗突发性耳聋伴耳鸣眩晕的疗效较好。
- 沈少华孙娟
- 关键词:金纳多突发性耳聋耳鸣眩晕
- 鼻咽癌中高表达蛋白激酶及其抑制剂的生物信息学筛选被引量:1
- 2016年
- 目的筛选鼻咽癌中高表达的激酶基因以及调控这些激酶的激酶抑制剂,为鼻咽癌的分子治疗提供新的切入点。方法利用GEO数据库和SAM软件筛选鼻咽癌中高表达的激酶基因;利用DAVID数据库获得激酶调控的生物学功能;利用Selleckchem数据库筛选调控这些高表达激酶的激酶抑制剂,再通过文献挖掘技术筛选潜在的抗鼻咽癌新药。结果在鼻咽癌基因组中,我们共筛选出差异表达基因2 360个,其中高表达激酶基因21个,分别为CHEK1、CHEK2、PRKDC、AURKA、VRK2、STK17A、MELK、NUAK1、TRPM7、MASTL、AXL、BUB1、BUB1B、CDK4、TTK、CDC7、CASK、AKT3、TBK1和PBK(Fold Change≥2且P<0.05)。功能分析的结果显示21个高表达激酶主要参与10个功能term中,包括调节细胞活动相关功能,如"protein amino acid phosphorylation""phosphorylation""phosphate metabolic process"和调控细胞周期相关功能,如"mitotic cell cycle""cell cycle phase""regulation of cell cycle"等。通过Selleckchem数据库,我们发现9个高表达激酶具有已被证实的激酶抑制剂51个。文献挖掘的结果显示在这51个激酶抑制剂中,有18个在癌症方面的研究较少,文献小于10篇,具有成为抗鼻咽癌潜力的新药物。结论鼻咽癌中共有21个激酶高表达,并可能通过调控肿瘤细胞周期等生物学功能来发挥促鼻咽癌作用;它们的抑制剂可能有潜在的抗癌作用,为鼻咽癌的分子治疗提供新的靶点。
- 张姝崔晓波孙娟
- 关键词:鼻咽癌蛋白激酶激酶抑制剂
- 芩蒿滴鼻液对变应性鼻炎患者鼻分泌物中SP,TNF-α,Annexin1及VCAM-1含量的影响被引量:6
- 2017年
- 目的:探讨芩蒿滴鼻液对变应性鼻炎(AR)患者鼻分泌物中P物质(SP)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、膜联蛋白1(Annexin1)、血管细胞黏附分子-1(VCAM-1)含量的影响。方法:选取我院耳鼻喉科收治的AR患者92例,随机分为对照组和实验组两组。对照组46例患者予曲安奈德鼻喷雾剂治疗,实验组46例患者加用芩蒿滴鼻液治疗。另选取健康体检患者46例。采用酶联免疫法测定各组患者鼻分泌物中TNF-α、Annexin1及VCAM-1的含量,采用放射免疫法测定SP的含量。结果:治疗后,两组鼻分泌物中SP、TNF-α及VCAM-1含量均较治疗前显著下降,Annexin1含量明显升高(P<0.05);与对照组比较,实验组鼻分泌物中SP、TNF-α及VCAM-1含量较低(P<0.05),Annexin1含量较高(P<0.05),实验组临床有效率(91.30%)较对照组(73.91%)显著升高,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论:芩蒿滴鼻液能够明显降低AR患者鼻分泌物中SP、TNF-α、VCAM-1的含量,上调Annexin1的含量。
- 朱宏伟孙娟徐成伟牛俊徐明义崔晓波
- 关键词:变应性鼻炎血管细胞黏附分子-1
- 睡眠呼吸暂停低通气综合征患者持续气道正压通气治疗前后血气及C反应蛋白变化被引量:5
- 2020年
- 目的观察睡眠呼吸暂停低通气综合征(OSAHS)患者持续气道正压通气(CPAP)治疗前后血气及C反应蛋白(CRP)变化。方法本研究为前瞻性研究。选择2016年10月—2017年7月经内蒙古医科大学附属医院耳鼻咽喉科收治的中、重度OSAHS成年患者50例作为病例组,其中男40例,女10例,年龄30~65(47.24±10.28)岁,体质量指数(BMI)为(27.94±3.43)kg/m2;选取同期健康体检者50名作为对照组,其中男37名,女13名,年龄29~69(51.28±10.58)岁,BMI为(26.98±2.70)kg/m2。监测病例组CPAP治疗前、治疗15 d后及对照组治疗前血气[pH值、动脉血氧饱和度(arterial oxygen saturation,SaO2)、动脉二氧化碳分压(arterial partial pressure of carbondioxide,PaCO2)、动脉氧分压(arterial partial pressure of oxygen,PaO2)]及CRP的变化。将收集的数据采用SPSS 20.0统计学软件进行处理分析,符合正态分布的计量资料组间比较采取t检验,计数资料组间比较采用χ2检验。不符合正态分布的计量资料组间比较采用非参数秩和检验。结果病例组治疗前pH值、PaO2、SaO2均低于对照组[7.34±0.03比7.37±0.04,(75.93±9.08)mmHg比(80.07±10.94)mmHg,(89.71±6.09)mmHg比(93.29±5.36)mmHg,1 mmHg=0.133 kPa,P值均<0.05];PaCO2、CRP均高于对照组[(43.02±8.43)mmHg比(39.26±8.20)mmHg,1.28[0.27,5.83]mg/L(中位数[25分位数,75分位数],下同)比0.44[0.21,3.40]mg/L],差异均有统计学意义(P值均<0.05)。病例组CPAP治疗后pH值(7.36±0.04)、PaO2[(80.28±9.96)mmHg]、SaO2[(92.94±4.01)mmHg]均较治疗前升高,PaCO2[(39.46±8.36)mmHg]、CRP(0.44[0.21,3.40]mg/L)均较治疗前降低,差异均有统计学意义(P值均<0.05)。结论血气、CRP变化是评估OSAHS患者CPAP治疗前后病情的重要指标。
- 杨莉娜孙娟
- 关键词:连续气道正压通气血气分析C反应蛋白质
- 下咽癌中差异表达的蛋白激酶及抑制剂的研究进展被引量:2
- 2021年
- 在头颈恶性肿瘤中,下咽癌恶性程度高,患者生存质量较差且通常预后不良。下咽癌的治疗采用手术为主的方式,并辅助以放化疗。术后患者喉功能受损严重,寻找能够尽量保护喉功能的治疗方法是目前研究的重点。靶向治疗对下咽癌患者保护喉功能、提高生存质量意义重大。研究发现,下咽癌发生过程中涉及多种蛋白激酶介导的信号通路及基因,对可能在这一过程中有重要意义的蛋白激酶PKC-β、CDK4/6、Cdc42、Rac1、STK33、CK2和PHLPP作一综述,以期为蛋白激酶抑制剂作为下咽癌治疗的靶点提供新的方向。
- 王亚越(综述)孙娟
- 关键词:下咽癌肿瘤蛋白激酶蛋白激酶抑制剂靶点
- 人乳头瘤病毒相关性喉癌的研究进展
- 2023年
- 人乳头瘤病毒(HPV)是一种普遍存在的DNA病毒,其致病机制复杂,检测方法多样,且高危型HPV感染与人类多种癌症密切相关。研究表明,HPV感染是头颈部肿瘤的危险因素之一。目前,口咽癌已根据HPV状态进行分型治疗,但HPV状态对喉癌的意义尚不明确。近年来,虽然医疗水平有所提高,但喉癌的病死率并没有实质上的降低。因此,通过对HPV相关性喉癌的流行病学、发病机制、检测方法及预后进行综述,介绍HPV相关性喉癌的研究进展,为深入开展喉癌相关科学探索、有效指导其临床防治提供参考。
- 苏琳孙娟
- 关键词:喉癌鳞状细胞癌人乳头瘤病毒