赵艳
- 作品数：7 被引量：59H指数：4
- 供职机构：河北北方学院农林科技学院更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项河北省科技厅科研项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学医药卫生更多>>
- 谷子超氧化物歧化酶基因家族生物信息学分析被引量：3
- 2018年
- 超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)是重要的抗氧化酶,在生物体内广泛存在。以谷子基因数据库为搜索平台,利用生物信息学方法对谷子超氧化物歧化酶基因家族进行全基因组扫描和生物信息学分析。结果表明:谷子SOD基因家族包含8个基因,不均匀的分布在6条染色体上,8个基因的外显子数量为1~9个,蛋白质的氨基酸序列长度在56~334 aa之间。谷子中的8个SOD蛋白,有5个具有Cu-SOD基序,3个具有Mn-SOD基序。进化树分析表明,谷子SOD蛋白与水稻、高粱SOD蛋白序列具有较高的同源性。该研究结果可以为进一步了解谷子SOD基因家族和谷子抗氧化机制提供一定参考。
- 赵艳生云龙宋亚菲张佳阔瓮巧云袁进成赵治海刘颖慧
- 关键词：谷子超氧化物歧化酶生物信息分析
- 不同品种谷子醇提物抗氧化活性比较被引量：2
- 2017年
- 为了解谷子的抗氧化功效,以5个谷子品种为研究对象,测定了谷子醇提物中抗氧化活性物质的含量,比较了不同谷子品种醇提物的抗氧化能力,并分析了抗氧化能力与活性成分含量的相关性。结果显示,5个谷子品种总酚、黄酮、α-生育酚含量分别为369.9~793.1、162.1~459.3、7.1~17.1 mg/kg;谷子醇提物的DPPH自由基清除率、OH自由基清除率、还原力的IC50值分别为0.09~0.24、0.41~0.74、0.98~2.35 mg/mL。其中,张杂谷9号的黄酮含量最高,总酚、α-生育酚含量最低,DPPH自由基清除能力最强;8311总酚和α-生育酚含量最高,黄酮含量最低,OH自由基清除能力最强;张杂谷3号提取物的还原力高于其他4个品种。相关性分析结果显示,谷子提取物对DPPH自由基的清除能力与总酚、α-生育酚含量呈显著正相关,与黄酮含量呈显著负相关;对OH自由基的清除能力与总酚、α-生育酚含量呈显著负相关,与黄酮含量呈显著正相关;还原力与α-生育酚含量呈显著负相关。
- 王凌云宋小清王晓明范光宇赵治海赵艳刘颖慧
- 关键词：谷子醇提取物活性成分抗氧化作用
- 玉米HSP70基因家族的全基因组鉴定与分析被引量：17
- 2017年
- 热激蛋白70(HSP70)是生物体应答各种胁迫反应产生的一类蛋白,广泛存在于生物体中,在几乎所有的活细胞中都起着重要的作用。为全面解析玉米基因组HSP70基因信息,利用从Pfam数据库中下载的隐马氏模型文件PF00012在Gramene数据库进行基因搜索,并利用多种生物软件或在线工具对所鉴定的基因进行生物信息学分析。结果表明,试验共鉴定得到35个玉米HSP70基因,分别命名为Zm HSP70-1~Zm HSP70-35。这些基因不均衡地分布在玉米的10条染色体上,其中5号染色体上分布最多(6个),9号染色体上分布最少(1个)。进化树分析显示35个基因聚为6组,且同组基因具有相似的基因结构,其基序数量、类型和顺序也是相似的。物种间进化树分析不同物种的86个基因,存在8对直系同源基因和17对旁系同源基因,直系同源基因中7对存在于玉米和水稻之间,仅1对存在于水稻和拟南芥之间,说明起源于共同祖先基因的直系同源基因对虽在单/双子叶植物差异分离前就存在,但玉米与水稻间的进化关系要比与拟南芥间更为亲近。表达谱分析表明,大多数Zm HSP70基因属组成型表达,但表达模式和表达量不同。本研究结果为进一步研究玉米HSP70家族基因的功能奠定了理论基础。
- 宋晋辉马海莲瓮巧云袁进成赵艳刘颖慧
- 关键词：玉米HSP70系统进化树
- 谷子酶解物抗氧化性的研究及超氧化物歧化酶的生物信息学分析
- 谷子是我国传统的粮食作物之一，主要种植在北方。谷子的基因组小、生育期短、且为二倍体，与玉米、水稻、高粱等作物具有很高的共线性，使其成为禾本科基因组研究的模式植物之一，也成为研究C4植物的模式植物。本研究以谷子为研究对象，...
- 赵艳
- 关键词：酶解液活性肽超氧化物歧化酶抗氧化机制
- 文献传递
- 转玉米ZmABI3-L基因增加拟南芥的抗旱和耐盐性被引量：6
- 2016年
- ABI3(abscisic acid insensitive 3)是编码ABA信号转导途径中的重要调控因子,广泛地存在于玉米、小麦、水稻等谷类作物中。本研究从玉米中获得一个新的ABI3-like基因,命名为ZmABI3-L,该基因全长1735bp,开放阅读框1212bp,编码蛋白含404个氨基酸。同源比对表明ZmABI3-L和谷子、高粱的同源蛋白相似性高,分别为64%和58%。基因的表达分析表明该基因是组成型表达,在幼胚、穗子和花丝中表达量较高,同时基因的转录水平可以为盐、ABA、干旱和冷所诱导。将ZmABI3-L基因转化到拟南芥中,对T3代转ZmABI3-L基因拟南芥进行抗逆性分析,结果显示ZmABI3-L基因可以增强拟南芥的耐盐和抗旱能力。在150mmol/L高盐培养基中转基因拟南芥的根和茎长度分别为对照的8.6和1.4倍,在50mmol/L甘露醇的渗透培养基中转基因植株的发芽率是74.5%,而对照仅为33.6%。研究表明ZmABI3-L是一个对干旱和盐损伤均有响应而显著上调的基因,同时该基因可以增加拟南芥的抗旱和耐盐性。
- 袁进成宋晋辉马海莲瓮巧云王凌云赵艳刘颖慧
- 关键词：玉米干旱胁迫盐胁迫转基因拟南芥
- 谷子蔗糖合成酶基因家族鉴定及生物信息学分析被引量：6
- 2017年
- 蔗糖合成酶(sucrose synthase,SuS)是蔗糖代谢的关键酶,在植物的代谢反应中起重要作用。以谷子基因组数据库为平台,借用生物信息学手段对谷子SiSuS基因家族进行挖掘和分析。结果表明,谷子的SiSuS基因家族包括9个基因,它们不均匀地分布在5条染色体上。该家族氨基酸序列长度为809~1 088 aa,外显子数目为10~16个,大多数蛋白质为弱酸性。谷子SiSuS的氨基酸序列具有9个保守基序;进化树分析结果表明,谷子、水稻、高粱SiSuS蛋白聚在一起。
- 王凌云郭明赵艳瓮巧云马海莲宋晋辉袁进成董志平刘颖慧
- 关键词：谷子蔗糖合成酶生物信息学分析蛋白结构
- 谷子ARF基因家族的鉴定与生物信息学分析被引量：26
- 2016年
- 生长素应答因子(ARF,auxin response factors)是一类可以结合在生长素应答基因启动子部位的转录因子,在植物的生长发育中起至关重要的作用。本研究以谷子为材料,共鉴定出24个ARF基因,命名为Si ARFs。利用生物信息学对谷子Si ARFs基因的结构、染色体分布、基因倍增模式、系统进化以及基因的表达模式进行分析。结果表明,Si ARF基因家族在染色体上呈不均匀分布,除2号染色体外,其他染色体上都有该家族基因,基因的扩增模式为分散复制与片段复制。Si ARFs基因家族具有相对保守的结构,即包含1个保守的B3 DNA结构域、ARF结构域和Aux/IAA结构域,ARF蛋白的3D结构含有3个α螺旋和7个β折叠结构。进化树分析表明谷子ARF蛋白和物种相近的高粱、玉米聚在一起。大多数ARF基因在谷子根、茎、叶和穗中都有表达,且不同基因表达量有较大差异。
- 赵艳瓮巧云马海莲宋晋辉袁进成王凌云董志平刘颖慧
- 关键词：谷子ARF生物信息学分析蛋白结构
