彭永东
- 作品数：37 被引量：86H指数：6
- 供职机构：河北科技师范学院动物科技学院更多>>
- 发文基金：河北省自然科学基金国家自然科学基金国家现代农业产业技术体系建设项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学文化科学哲学宗教更多>>
- 赤狐ESR1基因启动子的克隆及生物信息学分析被引量：1
- 2021年
- 对赤狐ESR1基因启动子区转录因子结合位点进行了预测,为今后研究其转录调控机制提供参考依据。以赤狐基因组DNA为模板,通过PCR技术扩增克隆ESR1基因启动子序列,并构建至双荧光素酶报告基因载体;利用生物信息学方法对ESR1基因核心启动子区的关键转录因子结合位点进行预测。成功克隆出赤狐ESR1基因5’上游1880 bp的片段。通过在线软件分析预测发现,2个候选核心启动子位于转录起始位点上游634~842 bp;多种在线软件预测到赤狐ESR1基因启动子区存在Sp1,cEBP及NF-1等多个转录因子结合位点。推测这些转录因子可能对赤狐ESR1基因转录活性具有重要的调控作用。
- 周瑞红彭永东李祥龙
- 关键词：赤狐启动子生物信息学分析
- 北极狐酪氨酸酶基因cDNA序列分析及启动子预测被引量：1
- 2018年
- 为了探明北极狐酪氨酸酶（tyrosine,TYR）基因核心启动子活性区、转录因子结合位点、基因编码蛋白结构及功能,通过RT-PCR扩增及基因测序技术首次从北极狐皮肤组织中获得TYR基因c DNA序列,全长4 300 bp（包括5＇侧翼区2 681 bp,CDS区1 593 bp,3＇侧翼区26 bp）。生物信息学分析结果表明：北极狐TYR基因5＇侧翼区存在潜在的启动子区域,并发现TATA框和CAAT框等调控元件及髓细胞增生原癌基因（Myc）、胰十二指肠同源盒1（Pdx1）、V-Myb髓细胞组织增生病毒癌基因同源物（Myb）、E26转录因子1（Ets1）、特异性蛋白1（Sp1）和TATA盒结合蛋白（TBP）等多种转录因子。北极狐TYR基因编码蛋白的长度为530个氨基酸残基,编码蛋白是定位于生物膜上的不稳定可溶性亲水蛋白质,该蛋白以无规卷曲为主,主要参与信号转导和转录,存在跨膜区域和信号肽。北极狐与其他物种的系统进化树分析提示北极狐与家犬的遗传亲缘关系最近,不同物种间亲缘关系与生物进化观点基本一致,符合动物学分类。
- 郭敏牛迪刘艳军彭永东张文香刘铮铸冯敏山李祥龙巩元芳
- 关键词：北极狐酪氨酸酶基因生物信息学分析启动子转录因子结合位点
- 蓝狐MITF-M基因序列扩增及生物信息学分析被引量：2
- 2018年
- 试验旨在研究蓝狐MITF-M基因核心启动子活性区、转录因子结合位点、基因编码蛋白结构及功能,为探究该基因的表达调控机制提供理论依据。从成年蓝狐背部皮肤组织中采集1cm×1cm样品,采用RT-PCR扩增及测序技术首次获得MITF-M基因序列3 880bp(包括5′侧翼区2 262bp、CDS区1 260bp、3′侧翼区358bp),编码419个氨基酸残基。生物信息学分析结果显示,蓝狐MITF-M基因5′侧翼区存在潜在的启动子区域(-86^-336bp),且发现TATA框、CAAT框、GC框和CRE等调控元件及CREB、LSF和Sp1等多种转录因子。MITFM基因编码的蛋白是定位于细胞核和细胞质的不稳定、可溶性亲水蛋白质。亚细胞定位结果提示该蛋白在细胞核、细胞质和线粒体的概率较高,分别为65.2%、17.4%和8.7%。DNAMAN软件对MITF-M基因编码蛋白的二级结构预测发现,该蛋白由α螺旋(33.66%)、β折叠(16.66%)和无规卷曲(49.68%)组成,且不存在跨膜区域和信号肽。蓝狐与其他物种MITF-M基因编码的氨基酸序列同源性对比和系统进化树分析均提示蓝狐与犬的遗传亲缘关系最近,与哺乳动物和禽类均具有较高的同源性(>89.1%),说明MITF-M基因编码区在物种进化过程中较为保守。本研究为深入研究MITF-M基因调控狐狸被毛颜色的分子遗传机制奠定了理论基础。
- 郭敏张东林刘艳军彭永东王建涛付志新董淑珍刘铮铸巩元芳李祥龙
- 关键词：蓝狐编码区生物信息学分析
- 美洲水貂TYRP1基因编码蛋白质结构及功能的生物信息学分析被引量：6
- 2018年
- 基于生物基因组学数据库,对美洲水貂酪氨酸酶相关蛋白质1(TYRP1)基因进行生物信息学分析,为其遗传特性及编码蛋白质功能机制的研究提供基础数据。生物信息学分析结果表明,美洲水貂TYRP1基因共编码537个氨基酸,其编码产物为不稳定的亲水蛋白质。二级结构主要以α-螺旋和无规卷曲为主,含有1个酪氨酸酶超家族结构域,存在信号肽、跨膜结构域和二硫键。该蛋白质主要在内质网中发挥细胞被膜、运输和结合的作用,同时还通过信号转导在细胞内发挥其生物学作用。系统进化情况和动物分类学基本一致,美洲水貂和雪貂的亲缘关系最近。美洲水貂TYRP1基因编码蛋白质在生物进化中具有较强保守性,该基因结构和功能的分析为水貂TYRP1基因遗传特性的进一步研究奠定了基础。
- 王亚琪郭敏刘铮铸耿立英张传生巩元芳李祥龙彭永东
- 关键词：毛色蛋白质结构生物信息学
- 一种鉴定常见狐属彩狐和北极狐属彩狐的插入/缺失标记和方法
- 本发明提供一种鉴定常见狐属狐和北极狐狐属狐的插入/缺失标记和方法，包括如下步骤：基因组DNA的提取；PCR扩增；纯化后的PCR产物进行DNA测序，从而确定插入/缺失位点；通过序列比进行基因型分析，根据基因型结果进行狐群鉴...
- 彭永东李祥龙王瑞宁周瑞红赵子雅
- 文献传递
- 坝上长尾鸡pmel基因核心启动子的鉴定被引量：3
- 2018年
- 为探明坝上长尾鸡的前黑素小体蛋白(Pre-melanosomal protein,Pmel)基因核心启动子区,首先构建了双荧光素酶表达载体,通过脂质体瞬时转染鸡胚成纤维细胞DF1,并利用双荧光素酶检测试剂盒进行启动活性检测。成功克隆了坝上长尾鸡pmel基因5?侧翼区片段1268bp,预测启动子区(-1200–+68)含有2个CpG岛和多种转录因子结合位点,构建了9个含有不同长度pmel基因启动子片段的表达载体及1个核心启动子区突变载体,说明鸡pmel基因启动子的核心区域为-840–+68bp,其中-840–-590bp和-525–-266bp区域为正调控区,-590–-525bp区域为负调控区,多态位点(-456、-435、-410、-374和-341)对pmel基因启动子活性有较大影响。
- 刘小辉周荣艳彭永东张传生李兰会李祥龙
- 关键词：启动子转录因子
- 坝上长尾鸡原始生殖细胞的分离、培养与鉴定被引量：1
- 2016年
- 为了研究坝上长尾鸡的原始生殖细胞（primordial germcell，PGCs），试验分别从孵化至13-15期的坝上长尾鸡鸡胚血液和5．5d的鸡胚生殖嵴中分离得到PGCs，接种于24孔培养板，以鸡胚成纤维细胞（CEF）为饲养层，添加细胞因子的培养体系，在温度37℃、95％空气和5％CO2培养箱中进行体外培养和传代，借助组织化学及免疫组织化学方法进行染色，并采用PAS（高碘酸希夫氏染色）、AKP（碱性磷酸酶染色）以及SSEA-1等方法进行鉴定。结果表明：PGCs集落有典型的鸟巢状结构，且PAS、AKP以及SSEA-1染色呈阳性。
- 耿立英赵书雨张传生李祥龙刘小辉陈娟潘素敏彭永东王茂森
- 关键词：体外培养
- 水貂TYRP1基因启动子活性和Sp1结合位点被引量：4
- 2018年
- 以同源性较高的雪貂TYRP1基因序列（Gen Bank：NW_004569257．1）为模板，通过PCR扩增7个不同长度的启动子缺失片段，定向克隆至pGL3-Basic载体中，利用脂质体转染到A375和293T细胞，通过双荧光素酶检测系统检测活性，利用多个在线软件分别分析启动子区活性及转录因子结合位点，并构建突变体进行活性验证。结果显示：成功构建7个不同长度的启动子缺失片段重组质粒，其中6个片段具有明显的启动子活性。-367／＋70区域为水貂丁豫．P1基因核心启动子区域，-367／-144区域的缺失，启动子活性无明显变化，-144／-37区域的缺失使启动子活性明显下降，表明该区域可能存在正调控元件。通过生物信息学方法预测可能存在Spl转录因子结合位点，构建的Mut-Spl-2突变体活性明显低于野生型pGL3—215，差异极显著（P〈0．01）。结果表明：成功筛选了水貂TYRPl基因核心启动子区域（-367／＋70），确定Spl（-56／-45）结合位点为转录的正调控区域。
- 李丽莎李兰会李祥龙彭永东
- 关键词：水貂启动子
- IFITM和IFIT家族基因的抗病毒机制研究进展被引量：4
- 2019年
- 干扰素诱导的跨膜(Interferon-induced transmembrane,IFITM)蛋白家族和干扰素诱导(Interferon-induced proteins with tetratricopeptide repeats,IFIT)蛋白家族作为受干扰素所诱导的,执行抗病功能的家族,在免疫反应中扮演着至关重要的角色;特别是IFIT5是家禽体内存在唯一的IFIT家族成员。IFITM通过抑制病毒包膜与宿主细胞膜的融合,从而抑制病毒的入侵;而IFIT则是抑制病毒的转录与复制,阻断病毒繁殖,从而抑制病毒的感染。两者在生物体内协同发挥抗病毒功能,清除病毒,保护宿主细胞正常的生理活动。在数万年的进化中,病毒也进化出相应的机制来逃避免疫蛋白的抑制。文章就IFITM和IFIT基因家族抗病毒机制的研究进展进行总结,为之后的研究提供参考。
- 张贝郝文文耿立英彭永东张传生李祥龙
- 关键词：免疫逃避
- 北极狐MITF-M基因启动子活性及转录调控元件的分析被引量：1
- 2020年
- 为了探究MITF-M基因对狐狸毛色的遗传调控机制,利用PCR扩增技术对北极狐MITF-M基因启动子区6个缺失片段(2 279,1 738,1 313,1 040,524和236 bp)进行扩增,利用双荧光素酶报告基因检测技术对该基因启动子表达载体转染细胞(A375和293T)的相对活性进行检测,通过在线软件对核心启动子区转录因子结合位点进行预测,利用重叠延伸PCR和双荧光素酶报告系统检测技术对预测出来的转录因子结合位点进行点突变活性分析。结果表明,北极狐MITF-M基因启动子区524 bp(-510 bp/+13 bp)处活性最高,预测发现-510 bp/-222 bp区域存在CREB(-312 bp/-319 bp)、Sp1(-295 bp/-307 bp)和Sp1(-249 bp/-262 bp)转录因子结合位点,这3个转录因子结合位点突变后能使北极狐MITF-M基因的启动子活性上升。综上,北极狐MITF-M基因核心启动子区在-510 bp/-222 bp区域,转录因子结合位点CREB(-312 bp/-319 bp)、Sp1(-295 bp/-307 bp)和Sp1(-249 bp/-262 bp)对北极狐MITF-M基因的转录激活起到一定的调控作用。
- 郭敏李寒妹王瑞宁郑晓宁刘铮铸彭永东巩元芳李祥龙
- 关键词：北极狐启动子活性转录调控元件
