李楠楠
- 作品数：37 被引量：30H指数：4
- 供职机构：中国农业科学院郑州果树研究所更多>>
- 发文基金：国家现代农业产业技术体系建设项目更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 西瓜网纹果皮覆纹特征SNP位点、其CAPS分子标记、引物及应用
- 本发明涉及一种西瓜网纹果皮覆纹特征SNP位点、其CAPS分子标记、引物及应用。所述西瓜网纹果皮覆纹特征的SNP位点为西瓜基因组6号染色体上第25950735位核苷酸G→A；所述CAPs标记的引物组包括正向引物5’‑TGG...
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- 文献传递
- 与西瓜极小种子基因ts共分离的InDel分子标记、其引物及应用
- 本发明公开了一种与西瓜极小种子基因ts共分离的InDel分子标记、其引物及应用，旨在解决现有技术无法快速准确的对西瓜种子小且少性状种群进行种质鉴定的技术问题。本发明筛选了一种与西瓜极小种子基因ts共分离的InDel分子标...
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- 文献传递
- 西瓜粘籽基因SNP分子标记及其筛选方法和应用
- 本发明公开了一种西瓜粘籽基因SNP分子标记及其筛选方法和应用。明确了一种西瓜粘籽基因的SNP位点。设计了一种所述SNP位点的dCAPs分子标记，其上游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示；其下游引物核苷酸序列如SE...
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- 西瓜果实形状的分子精准鉴定被引量：9
- 2021年
- 为了实现西瓜果实形状的分子精准鉴定,利用“国家西瓜甜瓜中期库”的资源和高通量测序平台,利用两个不同的杂交分离群体(F_(2)和BC_(1)P_(1))分别鉴定到1个159 bp插入缺失和1个非同义SNP导致的果形突变(由圆果形变为长果形),且SNP突变在159 bp插入缺失的基因组区域内。利用这个SNP开发CAPS标记Markersun在两个群体和128份西瓜种质中进行分析,发现标记Markersun在两个群体中与果形表型共分离;在西瓜种质中可同时区分插入缺失和SNP的变异,且与果形表型共分离。同时这两个变异与果形的共分离在196份西瓜核心种质的基因型分型中也得到验证。此外,通过对不同类型西瓜种质的基因型分析发现,SNP变异导致的长果形出现的时间更早且独立遗传,而159 bp插入缺失引起的长果形是栽培西瓜驯化过程中产生的。本研究中首次利用不同类型的西瓜核心种质实现了西瓜果形的分子精准鉴定,还挖掘到两个西瓜果形的功能变异并开发标记,为西瓜果形的分子精准鉴定提供技术支撑,同时为果形性状基因功能验证提供靶标,加速了西瓜果形性状基因的调控机理研究。
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- 关键词：西瓜果形核心种质
- 西瓜果实大小基因SNP分子标记及其应用
- 本发明公开了一种西瓜果实大小基因SNP分子标记及其应用，旨在解决对西瓜果实大小主效基因缺乏识别、鉴定方法的技术问题。本发明提供了一种西瓜果实大小基因的SNP位点（基于西瓜97103参考基因组V2版8号染色体第271050...
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- 西瓜籽粒大小基因及其SNP分子标记和应用
- 本发明公开了一种西瓜籽粒大小基因及其SNP分子标记和应用。该基因核苷酸序列如SEQ ID NO.1，编码的蛋白质序列如SEQ ID NO.2；还设计了与所述基因具有90%以上的同源性，且编码相同功能蛋白质的基因；明确了一...
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- 文献传递
- 鉴定甜瓜果实苦味性状的InDel分子标记2mBi134及其引物和应用
- 本发明公开了一种鉴定甜瓜果实苦味性状的InDel分子标记2mBi134及其引物和应用，旨在解决现有技术无法快速准确的对甜瓜果实苦味性状种群进行种质鉴定的技术问题。本发明筛选了一种鉴定甜瓜果实苦味性状的InDel分子标记，...
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- 鉴定西瓜枯萎病的InDel分子标记及其引物和应用
- 本发明具体涉及一种鉴定西瓜枯萎病的InDel分子标记及其引物和在西瓜抗枯萎病育种中的应用。该InDel分子标记的核苷酸序列为：TTTATTTTTTATTTTTTATTT，其引物序列：InDel1_fon1F：TTCCAA...
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- 一个获得与缺失变异(PAV)调控甜瓜果实苦味被引量：5
- 2020年
- 甜瓜苦味物质严重影响其口感和品质。本研究利用不苦的薄皮甜瓜品系C69和苦的薄皮甜瓜品系C14构建了一个包含100个单株的F2群体。首先利用2b-RAD测序构建一个遗传连锁图谱。其次,结合群体的苦味性状进行全基因组的QTL定位和关联分析。然后,利用2b-RAD测序特有的技术优势进行群体的获得与缺失变异(PAV)的挖掘。最后,利用亲本的重测序信息确定控制苦味性状的关键基因。结果发现,F1的果实表现出强烈的苦味,F2群体中苦与不苦的单株分别为81个和19个,符合3∶1的分离比(χ^2=1.92,P=0.1659),表型表明所用甜瓜材料的苦味主要是由一个显性的基因位点控制。利用477个SNP标记构建一张包含10个连锁群的连锁图谱,总长为337.79 cM,标记间平均间隔0.71 cM。全基因组QTL定位在8号连锁群(对应9号染色体),检测到一个解释表型变异为20%的甜瓜苦味QTL。全基因组关联分析检测到7个SNPs与苦味性状相关,全部位于9号染色体苦味QTL的基因组区域。通过PAV分型分析仅发现一个特有的大片段缺失(21707702~21743072 bp),位于QTL区域,且在所有的不苦株系中存在,而苦的株系中不存在。基于两个亲本材料的深度重测序信息,发现这个PAV的区域更大,约为62 Kb,共涉及到9个连续的基因(MELO3C005601、MELO3C005602、MELO3C005603、MELO3C005604、MELO3C005605、MELO3C005606、MELO3C005607、MELO3C005608和MELO3C005609),其中5个是细胞色素P450基因。构建的系统发育树表明,这5个细胞色素P450基因与参与葫芦素C/B/E合成的细胞色素P450基因簇CYP81Q58、CYP81Q59和CYP712D8在一个进化枝,可能行使类似的功能,为潜在的类似于黄瓜葫芦素C合成的基因簇的一部分。前人通过比较基因组学研究获得的2个控制葫芦素B合成的bHLH转录因子CmBr(MELO3C005610)和CmBt(MELO3C005611)同在9号染色体,与本研究检测到的PAV紧密挨在一起。我们的研究结果为后续不苦甜瓜�
- 李娜尚建立周丹李楠楠王吉明马双武
- 关键词：甜瓜苦味QTL
- 西瓜种皮厚度紧密连锁SNP分子标记及其应用
- 本发明公开了一种西瓜种皮厚度紧密连锁的SNP分子标记及其应用，旨在解决对西瓜果种皮厚度基因缺乏识别、鉴定方法的技术问题。本发明提供了一种西瓜种皮厚度紧密连锁的SNP位点（西瓜基因组6号染色体第7046144bp处碱基由T...
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