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陈辰
作品数:
1
被引量:4
H指数:1
供职机构:
浙江大学浙江加州国际纳米技术研究院
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发文基金:
国家高技术研究发展计划
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相关领域:
医药卫生
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合作作者
刘杰
浙江大学浙江加州国际纳米技术研...
楼小燕
浙江大学浙江加州国际纳米技术研...
邵娇芳
浙江大学浙江加州国际纳米技术研...
林标扬
浙江大学浙江加州国际纳米技术研...
邱庆崇
浙江大学浙江加州国际纳米技术研...
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楼小燕
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陈辰
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刘杰
传媒
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中华肿瘤杂志
年份
1篇
2015
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结直肠癌患者二代测序鉴定微小RNA单核苷酸多态性位点及其对微小RNA功能的影响
被引量:4
2015年
目的:探讨微小RNA( miRNA)相关单核苷酸多态性( SNP )与结直肠癌发生发展之间的关系。方法收集30例结直肠癌患者的癌和癌旁组织,提取基因组DNA。将癌和癌旁组织混合,应用NimbleGen私人订制的芯片对685个miRNA基因目的区域进行捕获,经过洗脱扩增处理后,采用二代测序技术对捕获区域进行深度测序,并对测序数据进行分析。结果共鉴定43个miRNA的64个SNPs,其中60个SNPs为新发现。 TargetScan和mirSNP 检测结果显示, hsa-mir-1273-G/A、hsa-mir-548h-3-C/U、hsa-mir-1290-A/G和hsa-mir-1273-C/U突变后,其成熟miRNA的表达量降低。 hsa-mir-1268-U/C、hsa-mir-1268-C/U和hsa-mir-1285-1-U/C突变后其表达量增加。 hsa-mir-376b-C/G、hsa-mir-604-T/C、hsa-mir-1268-T/G 和 hsa-mir-146a-C/G 突变前后的靶基因均发生改变。 mir-146a rs1052918 C>G突变促进肿瘤的发展。结论 miRNA突变影响肿瘤的发生发展,在无Wnt信号的情况下,hsa-mir-146a突变后导致Wnt信号通路一直处于激活状态,导致细胞无限增殖。
邱庆崇
刘杰
邵娇芳
楼小燕
陈辰
林标扬
关键词:
结直肠肿瘤
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