高晓彤
- 作品数:1 被引量:2H指数:1
- 供职机构:四川师范大学化学与材料科学学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:理学更多>>
- 分子动力学研究F_1-ATP合酶对三磷酸腺苷的稳定和定位作用(英文)被引量:2
- 2015年
- F1-ATP合酶通过与ATP之间建立广泛的相互作用,实现对ATP的位置进行精确的定位.这些相互作用为ATP的合成/水解创造了稳定的环境.理解这些相互作用是理解ATP的合成/水解机理的基础.我们通过分子动力学模拟方法研究这些相互作用,找出在稳定化过程中起到重要作用的残基.通过检测ATP和F1-ATP合酶之间的非键相互作用,发现残基段158–164所形成的loop区域及残基R189,Y345对ATP存在显著相互作用.其中,该loop区域对ATP的三磷酸部分形成一个半包围结构,封闭活性位点区域,并通过氢键网络约束ATP三磷酸的运动,为ATP合成/水解创造稳定的环境.此外,关键残基Y345通过π–π叠加相互作用对ATP的碱基进行约束,但是ATP的碱基可以在平行于Y345芳香环的平面内进行滑动,我们推断这种滑动运动有利于促进ATP的水解.
- 伍绍贵高晓彤李权廖杰徐成刚
- 关键词:氢键分子动力学突变