张焕萍 作品数:12 被引量:25 H指数:3 供职机构: 南京林业大学机械电子工程学院 更多>> 发文基金: 江苏省高等教育教改立项研究课题 国家重点基础研究发展计划 中国博士后科学基金 更多>> 相关领域: 生物学 自动化与计算机技术 文化科学 机械工程 更多>>
面向基因表达数据的致病基因挖掘方法研究 复杂疾病致病基因挖掘对于了解疾病的发病机理和提高医学临床水平具有重要的意义。生物信息学作为当今生命科学研究的重要途径,通过揭示人类基因组及遗传语言的规律,挖掘威胁人类健康的各种疾病的致病基因,提高人类对疾病的认识及治疗水... 张焕萍关键词:致病基因 基因表达数据 LOGISTIC回归 离散粒子群算法 文献传递 基于离散粒子群和支持向量机的特征基因选择算法 被引量:9 2007年 基因芯片表达谱信息,为识别疾病相关基因及对癌症等疾病分型、诊断及病理学研究提供一新途径。在基因表达谱数据中选择特征基因可以提高疾病诊断、分类的准确率,并降低分类器的复杂度。本文研究了基于离散粒子群(binary particle swarm optimization,BPSO)和支持向量机(support vector machine,SVM)封装模式的BPSO-SVM特征基因选择方法,首先随机产生若干种群(特征子集),然后用BPSO算法优化随机产生的特征基因,并用SVM分类结果指导搜索,最后选出最佳适应度的特征基因子集以训练SVM。结果表明,基于BPSO-SVM的特征基因选择方法,的确是一种行之有效的特征基因选择方法。 张焕萍 宋晓峰 王惠南关键词:离散粒子群 特征基因 支持向量机 基于SolidWorks的懒人取物器改进设计及仿真分析 被引量:1 2021年 取物器已广泛应用于日常生活工作中,针对取物器结构进行了改进和优化,并基于Solid Works软件对取物器工作时的状态进行了静应力仿真分析。改进的取物器利用三角操纵和夹持折叠装置,提高了夹头的综合力学性能,延长了取物器的使用寿命,使取物器在具备基本取物功能的同时,扩大了可拾取物品的角度和范围;放置于可折叠杆内的可转角视物镜能够使拾物者更好地观察物品,同时便于携带与收纳。改进的取物器操作方便,夹持牢靠,能更好地为人们的工作和生活提供便利。 施雨含 杨玉洁 熊梦娇 王典凡 景晨雨 张焕萍谱系特有基因研究进展 被引量:4 2015年 谱系特有基因(Lineage-specific genes,LSGs)是指在一个谱系中特有并与其他物种谱系所有基因没有明显序列相似性的基因,约为物种基因组全部基因数量的10%~20%,于1996年首次在完成全基因组测序的酵母基因组中大量发现。大规模测序技术的发展使谱系特有基因研究成为比较基因组学的研究热点,已在微生物、海洋低等生物、植物(如拟南芥、水稻、杨树)、昆虫及高等灵长类动物等多个物种或类群中展开,其生物功能对于阐明物种进化历程和生物适应性具有重要意义。文章介绍了谱系特有基因的研究背景和现状,从谱系特有基因获取、基因结构分析、进化起源、生物功能、表达特性分析等方面阐述谱系特有基因的研究进展,分析了存在的问题和后续研究方向,以期为相关研究提供参考。 张焕萍 尹佟明基于构型设计与CAD造型的工程图学教学研究 被引量:2 2018年 构型设计和三维造型能力的培养对增强学生的创新思维能力具有重要作用。探讨了在传统工程图学教学过程中对学生构型设计和三维造型能力的培养方法,详细阐述了如何将构型设计、三维造型技术与工程图学有效地融合在一起。研究表明基于构型设计和三维造型能力的课堂教学对工程图学课程的教学改革有着指导意义,为学生后续的三维CAD设计奠定基础。 郑建冬 孙青云 商庆清 张焕萍关键词:工程图学 构型设计 创新思维 基于互信息的差异共表达致病基因挖掘方法 被引量:6 2009年 为了挖掘基因表达数据中的差异共表达致病基因模块,提出了基于互信息和最大团相结合的方法.互信息用于度量基因表达谱之间的相互关系,计算任意2条基因表达谱在2种不同样本中的互信息值,得到2个互信息矩阵M1和M2,选定2个阈值T1和T2(T1>T2)将矩阵M1和M2二值化,并通过M1和M2中元素的逻辑"与"运算得到图的邻接矩阵,从邻接矩阵挖掘出的最大团则为差异共表达致病基因模块.将该方法应用于Colon数据,选定T1=2.2,T2=1.0,得到6个相互重叠的最大团,实验结果表明,该方法能有效挖掘出差异共表达致病基因模块. 张焕萍 王惠南 卢光明 钟元 张志强关键词:互信息 最大团 最小支撑树算法在基因表达数据聚类分析中的应用 被引量:1 2007年 聚类分析已成为对基因表达数据进行挖掘以提取生物医学信息的主要方法。本文提出了基于图论的最小支撑树(Minimum spanning tree,MST)聚类算法,用MST表示多维基因表达数据,可将数据的聚类转换为对最小支撑树的分割,相对于传统聚类方法,最小支撑树算法具有形象直观、对一些准则函数能产生全局最优解等优点;将MST算法分别与Memetic algorithm及人工免疫算法(Artificial immune network,aiNet)相结合,则产生更优化的聚类结果。对酵母基因表达数据的实验结果表明,最小支撑树聚类算法是一种有效的基因表达数据的聚类方法。 张焕萍 王惠南 宋晓峰关键词:最小支撑树 基因表达数据 聚类分析 DNA微阵列 用ENDEAVOUR软件鉴定肥胖症致病基因GAD2 被引量:2 2011年 鉴别复杂疾病致病基因对于治疗和预防疾病作用非常重要,致病基因预测软件是鉴别致病基因的有效工具。位于染色体10p12的基因GAD2是尚有争议的肥胖基因,许多研究者用实验方法研究基因GAD2,却得出了不一致的结论。基于生物计算的致病基因预测软件能弥补实验的不足,已成为揭示疾病发病机理和预测致病基因的有效途径,本文采用ENDEAVOUR软件来验证基因GAD2是否为肥胖症致病基因,该软件运用多种生物数据,根据每一个候选基因与已知致病基因的相似程度以排序,结果在35个候选基因中,基因GAD2排在最前面,表明基因GAD2最可能是肥胖症致病基因。预测结果有利于重新解释基因GAD2的生物功能,促使肥胖症药物的研制及治疗水平的提高。 张焕萍 张小白关键词:致病基因 肥胖症 NEW HYBRID AI-SVM ALGORITHM: COMBINATION OF SUPPORT VECTOR MACHINES AND ARTIFICIAL IMMUNE NETWORKS 2006年 Support vector machines (SVMs) are combined with the artificial immune network (aiNet), thus forming a new hybrid ai-SVM algorithm. The algorithm is used to reduce the number of samples and the training time of SVM on large datasets, aiNet is an artificial immune system (AIS) inspired method to perform the automatic data compression, extract the relevant information and retain the topology of the original sample distribution. The output of aiNet is a set of antibodies for representing the input dataset in a simplified way. Then the SVM model is built in the compressed antibody network instead of the original input data. Experimental results show that the ai-SVM algorithm is effective to reduce the computing time and simplify the SVM model, and the accuracy is not decreased. 张焕萍 王惠南 宋晓峰图例在工程制图教学中的合理选用探讨 2012年 图例在《工程制图》教学中应用广泛,合理的图例有助于学生掌握投影原理和表达方法,加深对制图知识的理解;不合理的图例则误导学生,降低教学质量。通过简单具体的例子,讨论在尺寸标注、标准件、零件图、装配图这些章节中,如何合理选用教学图例。 张焕萍 商庆清关键词:工程制图 教学方法