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排序方式：

利用不同G+C含量细菌基因组评估细菌ncRNA基因预测工具被引量：1: 2014年; 【目的】为识别已完成全测序细菌基因组中的ncRNA基因,对3个常用ncRNA预测工具s RNAPredict、PORTRAIT和s RNAscanner进行评估。【方法】选择了细菌ncRNA数据库BSRD收录的含有已知ncRNA基因数目大于30的9个细菌基因组,并按基因组G+C含量进行分类,比较s RNAPredict和PORTRAIT工具的预测准确性。提取不同G+C含量基因组中ncRNA基因转录起始和终止区的序列特征,对s RNAscanner预测结果进行评估。【结果】s RNAPredict对细菌ncRNA基因的预测特异性和阳性检出率均高于PORTRAIT,而敏感性则较差;两种工具预测效果均随基因组G+C含量不同而产生明显变化。在不同G+C含量的细菌基因组中,ncRNA基因启动子和终止子区域的序列特征有明显差异。利用这些序列特征能提高s RNAscanner预测ncRNA基因的平均水平。【结论】3种ncRNA基因工具预测效果随基因组G+C含量变化而不同。不同G+C含量基因组中ncRNA基因的转录起始和终止区特征可作为ncRNA基因预测的重要参数之一。; 刘林梦温权欧竑宇

肺炎克雷伯菌全基因组中菌株特有区域的分析: 本研究通过在高性能计算机群上重构和更新细菌基因组序列比对工具mGenomeSubtractor，对48株已全测序的肺炎克雷伯菌基因组进行了亲缘菌之间及和人类微生物基因组计划序列的比较分析，识别了肺炎克雷伯菌中菌株特有区域...; 温权; 关键词：肺炎克雷伯菌 DNA序列; 文献传递

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温权