袁月
- 作品数:5 被引量:32H指数:4
- 供职机构:南京农业大学园艺学院更多>>
- 发文基金:国家科技支撑计划江苏省科技厅基金引进国际先进农业科技计划更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 葡萄VvSUN基因的克隆及其控制果形功能初探被引量:6
- 2017年
- SUN基因是控制番茄果实形状的主效基因。该研究从NCBI中查找与番茄SUN相似性最高的葡萄序列,设计特异性引物,采用RT-PCR技术从‘天山’葡萄花穗中克隆出该序列,命名为VvSUN基因。序列分析表明,VvSUN基因开放阅读框长度为1 278bp,共编码425个氨基酸;预测蛋白质分子量为48.11kD,理论等电点为10.63。VvSUN蛋白不具有信号肽,为非跨膜蛋白,可能定位于细胞核和线粒体膜上,属于亲水性蛋白;二级结构分析表明α螺旋和无规则卷曲是VvSUN蛋白中主要的结构元件。VvSUN基因编码的氨基酸具有IQ保守结构域,与NCBI中其他7种植物IQD家族成员基因序列相似性在43%~53%;系统进化树分析表明,VvSUN基因与拟南芥IQD12基因亲缘关系最近;推测葡萄VvSUN蛋白质与番茄SUN蛋白质具有相似的功能。荧光定量PCR分析表明,VvSUN基因在两个葡萄品种中均在盛花期表达量最高,花后果实中的表达量均较低;GA3处理后果实果形指数显著增大,且幼果中VvSUN基因表达量明显上升。研究推测葡萄VvSUN基因可能参与果形拉长的调控。
- 张亚光袁月高世敏陶建敏
- 关键词:葡萄克隆赤霉素
- 葡萄VvGW2基因的克隆及表达被引量:2
- 2015年
- 为了从葡萄品种美人指中克隆Vv GW2基因,并对其结构特征及表达模式进行分析。在NCBI中查找与水稻粒形基因Os GW2同源性最高的葡萄序列,根据葡萄的GW2基因序列设计特异引物。采用改良CTAB法提取美人指花序中总RNA,运用RT-PCR技术进行克隆。利用NCBI数据库中的BLASTn和BLASTp程序进行相似性分析;利用Bioxm2.6推测分析蛋白质分子量和等电点;根据NCBI中Conserved Domains程序进行蛋白质保守域结构预测;用Ex Pa Sy提供的在线SOPMA程序进行蛋白质二级结构预测;利用实时荧光定量RT-PCR研究该基因表达模式。结果显示,从美人指中克隆得到1个GW2基因同源序列,命名为Vv GW2基因。Vv GW2基因开放阅读框长度为1 272 bp,共编码423个氨基酸,预测蛋白质分子量为46 960,理论等电点为4.68。该基因编码的氨基酸具有GW2蛋白质保守的环指结构域,该环指蛋白质为C5HC2类型。与Gen Bank中登录的其他植物GW2蛋白质序列相似性为47%~53%。根据Vv GW2基因所编码的氨基酸序列构建系统进化树,结果显示,葡萄与可可聚为一类。实时荧光定量RT-PCR分析结果显示,Vv GW2基因在美人指花或果实的各时期均有表达,其中在开花期基因表达量最高。不同葡萄品种中,Vv GW2基因的表达量存在差异,在指形葡萄品种美人指的表达量最高,在圆形葡萄品种中的表达量很低。表明Vv GW2基因在不同时期和不同品种中的表达量差异可能与葡萄果实形状相关。
- 宋新新袁月孙海龙余晓娟陶建敏
- 关键词:葡萄VV基因克隆
- 葡萄半不育花粉粒形态和细胞学观察及相关基因表达分析被引量:4
- 2015年
- 以葡萄品种‘魏可’(可育)及其自交后代单株‘魏可实生-3’和‘魏可实生-12’以及品种‘钟山红’(雄性不育)为材料,对花器官特征、花粉萌发率、花粉粒形态以及小孢子发育过程的细胞学特征进行观察,并对绒毡层发育相关基因(DYT1、TDF1和MYB4)的表达进行分析,以初步鉴定葡萄半不育单株的不育特征,揭示花粉败育与基因调控的关系。结果显示:(1)‘魏可实生-3’和‘魏可实生-12’的花粉萌发率均在10%左右,属于半不育花粉;其雄蕊主要特征为花丝卷曲,花丝短于花柱,花药内花粉量少,花药中既有正常长球形花粉粒也有异常近球形花粉粒。(2)‘魏可实生-3’、‘魏可实生-12’没有明显的药室壁结构,小孢子母细胞稀少、疏松;‘魏可实生-3’双核期绒毡层未完全降解,绒毡层细胞中的营养物质滞留没有及时供应小孢子的发育,致后期部分小孢子败育;‘魏可实生-12’绒毡层细胞在单核早期就大部分降解而导致营养供应异常,使部分小孢子败育。(3)在减数分裂期,‘魏可’的绒毡层发育相关基因DYT1和TDF1的表达均最高,MYB4最低,‘钟山红’的3个基因的表达与‘魏可’相反,‘魏可实生-3’和‘魏可实生-12’的表达水平均在‘魏可’与‘钟山红’之间;单核早期以后,3个基因在‘魏可’的表达一直均较低,钟山红’的DYT1基因表达一直最高,其余2个基因均在最低水平,而‘魏可实生-3’的TDF1、MYB4基因在单核早期表达量最高,‘魏可实生-12’的TDF1在双核期表达量最高。研究表明,‘魏可实生-3’的花粉败育发生在单核晚期至双核期,‘魏可实生-12’的花粉败育发生在单核早期;部分药室绒毡层的异常降解,小孢子发育营养供应不均衡可能是导致其花粉半不育发生的原因;‘魏可实生-3’的绒毡层延迟降解与减数分裂期DYT1基因的表达量不足、单核期TDF1基因的过量表达以及MYB4�
- 余晓娟袁月王继源陶建敏
- 关键词:葡萄细胞学绒毡层
- 葡萄OVATE基因家族生物信息学及表达被引量:8
- 2016年
- 【目的】OVATE是一类调控植物生长发育的转录抑制因子,对葡萄OVATE基因家族(Vv OFPs)进行生物信息学和组织特异性表达分析,为该类基因的功能研究奠定基础。【方法】根据OVATE保守域蛋白序列(PF04844)对葡萄OVATE基因家族进行鉴定,利用生物信息学方法对葡萄OVATE基因家族染色体定位、基因结构、保守结构域、亚细胞定位等方面进行预测和分析,并分析葡萄和拟南芥OVATE基因家族的进化关系。采用实时荧光定量PCR技术检测Vv OFPs组织表达特性。【结果】葡萄OVATE基因家族包含17个成员,不均匀地分布在11条染色体上,均没有内含子结构,编码115—444个氨基酸,等电点4.55—9.69,均为亲水蛋白;所有蛋白均包含完整的OVATE保守结构域,亚细胞定位主要在细胞核中。根据进化树拓扑结构,将葡萄和拟南芥OVATE蛋白家族聚为六类(Ⅰ—Ⅵ),其中,Ⅱ、Ⅲ、Ⅴ类仅包含两个基因,Ⅰ、Ⅳ、Ⅵ类中Vv OFPs和At OFPs相互交错地聚类在一起;Vv OFPs和At OFPs共包含10个未知基序,保守元件1和2位于OVATE结构域区域,此外,在OVATE结构域外每个类别均包含特有基序。Vv OFPs具有组织表达特异性,12个基因在根、茎、叶、花和果实中均可以检测到表达,其余5个基因仅在特定组织中表达。多数Vv OFPs在根、嫩茎和花中表达量较高,在嫩叶和果实中仅检测到少数基因表达;Vv OFPs在不同发育期表达量存在差异,通常在开花前1周和开花期表达量较高,而花后4周果实中表达量较低。1对旁系同源基因表达模式相似,3对旁系同源基因产生了新的表达模式。【结论】葡萄OVATE结构域序列比较保守,其在不同组织中呈现出多种表达模式,推测其可能参与了葡萄生长发育的调控。
- 袁月张亚光高世敏陶建敏
- 关键词:葡萄生物信息学
- 套袋及喷钙对魏可葡萄矿质元素和果实品质的影响被引量:12
- 2015年
- 以葡萄晚熟品种魏可为材料,测定分析套袋及喷钙处理对其矿质元素、果实品质、果皮着色程度及裂果率的影响。魏可葡萄果实套微孔袋和塑料袋后,膨大期和转色期果皮中Ca和Mg含量明显下降,而K和B含量无明显变化;果实单果质量和可溶性固形物含量均减少。套袋前分别喷施氨基酸钙和硝酸钾钙,果实单果质量和Ca含量均明显增加,而套微孔袋效果更好。对不套袋的魏可葡萄分别喷施2种钙,果实单果质量和Ca含量增加。魏可葡萄套微孔袋前分别喷2种钙,对防治葡萄裂果的效果较好,裂果发生率分别降低了78%和88%。与对照相比,套袋及喷钙使魏可葡萄果皮颜色明显加深,且喷施硝酸钾钙比氨基酸钙更能降低果实表皮明亮度,加深果皮颜色。可见,袋套及喷钙可以增加魏可葡萄果实的单果质量和Ca含量,降低裂果发生率,并对果实成熟起促进作用。
- 余阳袁月王继源殷健陶建敏
- 关键词:葡萄套袋喷钙果实品质果皮着色