公共文化服务平台

共 8 条记录，以下是 1-8

全选清除导出

排序方式：

GEO(Gene Expression Omnibus):高通量基因表达数据库被引量：10: 2007年; GEO(Gene Expression Omnibus)数据库包括高通量实验数据的广泛分类,有单通道和双通道以微阵列为基础的对mRNA丰度的测定;基因组DNA和蛋白质分子的实验数据;其中包括来自以非阵列为基础的高通量功能基因组学和蛋白质组学技术的数据也被存档,例如基因表达系列分析(serial analysis of gene expression,SAGE)和蛋白质鉴定技术.迄今为止,GEO数据库包含的数据含概10000个杂交实验和来自30种不同生物体的SAGE库.本文概述了GEO数据库的查询和浏览,数据下载和格式,数据分析,贮存与更新,并着重分析GEO数据浏览器中控制词汇的使用,阐述了GEO数据库的数据挖掘以及GEO在分子生物学领域中的应用前景.GEO可由此公众网址直接登陆http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/geo/.; 刘华马文丽郑文岭; 关键词：基因表达数据库数据挖掘

骨质疏松对生物型全髋关节置换术后假体周围骨密度的影响研究: 背景人工髋关节置换术,作为二十世纪以来最成功的骨科手术之一,是目前治疗各种髋部疾病的最有效治疗方法。目前全球有超过1000万患者行人工关节置换,预计到2030年,人工全髋关节置换术的数量将翻一番。然而,根据目前的研究统...; 刘华; 关键词：全髋关节置换术骨质疏松骨密度无菌性松动; 文献传递

荧光交换标记法基因表达芯片的数据挖掘: 2008年; 目的探讨荧光染料交换标记设计的基因芯片数据挖掘方法,并对低剂量电离辐射影响人成纤维细胞基因表达谱数据进行分析。方法应用GeneSifter在线软件和Panther生物学信息数据库,对下载于NCBI的GEO数据库的8个样品GSM(包含4个时间点),选择正确的参数设置上载数据,运用ANOVA方法进行数据挖掘,并对差异表达基因进行功能归类分析。结果获得203条差异表达基因,合并相同基因名后为176条基因。双向聚类和主成分分析发现,样品的24 h时间点基因表达谱与前3个时间点有显著差异,功能归类分析提示,多个生物通路如细胞周期、核酸代谢、DNA代谢等被显著激活。结论应用这种方法可以挖掘荧光交换标记的微阵列数据,低剂量电离辐射对人成纤维细胞基因表达有时间累积效应,可能引起DNA损伤、细胞周期阻滞等变化,诱导细胞凋亡。; 廖之君马文丽梁爽刘华张海燕陈数珍郑文岭; 关键词：荧光成纤维细胞电离芯片分析技术自动数据处理

肺组织钩虫感染的基因表达谱分析: 2008年; 目的:从基因水平研究蠕虫感染和自身免疫性疾病之间的关系,发展治疗自身免疫病的新策略。方法:使用Gene Ontology和two-way ANOVA的方法,通过GeneSifter VizX Labs LLC,Seattle,WA,USA软件对肺组织钩虫感染的基因表达谱进行分析。结果:得到具有种系效应的517个差异基因,对这些基因聚类,可以划分为在WT小鼠高表达和低表达两类,其中参与黄体酮代谢的基因Afp在WT小鼠肺组织呈过表达状态。结论:Th2细胞活化对自身免疫性疾病多发性硬化(MS)具有抑制作用,并筛选出了Th2反应中的9个特异基因。; 刘华马文丽廖之君丁大鹏郑文岭; 关键词：基因表达谱多发性硬化自身免疫性疾病

小鼠肺钩虫感染基因表达谱的生物信息学分析—种系效应: 2008年; 目的从基因水平探索肌萎缩侧索硬化(ALS)其发病机制并发现治疗ALS的新靶点。方法通过GeneSifter软件对野生型(WT)和重度联合免疫缺陷型(SCID)小鼠肺组织钩虫感染的微阵列表达谱进行分析,使用two-way ANOVA的统计学方法对数据聚类,并结合Gene Ontology和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genesand Genomes)生物学通路,深入分析具有种系效应的517个差异基因(P<0.001)。结果显示ALS的信号转导通路在两组小鼠间差异具有统计学意义(Z>2),与Th2反应相关的多个基因对ALS的代谢异常具有保护作用。结论筛选出的3个特异基因,可作为治疗肌萎缩侧索硬化的新候选基因。; 刘华马文丽丁大鹏柯杰兵郑文岭; 关键词：基因表达谱肌萎缩侧索硬化

使用GeneSifter对小鼠肺钩虫感染基因表达谱的分析: 2008年; [目的]从基因水平探索肌萎缩侧索硬化(ALS)其发病机制并发现治疗ALS的新靶点。[方法]通过GeneSifter软件对野生型(WT)和重度联合免疫缺陷型(SCID)小鼠肺组织钩虫感染的微阵列表达谱进行分析,使用two-way ANOVA的统计学方法对数据聚类,并结合Gene Ontology和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)生物学通路,深入分析具有种系效应的517个差异基因(P﹤0.001)。[结果]显示ALS的信号转导通路在两组小鼠间差异有统计学意义(Z﹥2),与Th2反应相关的多个基因对ALS的代谢异常具有保护作用。[结论]筛选出的3个特异基因,可作为治疗肌萎缩侧索硬化的新候选基因。; 刘华马文丽柯杰兵丁大鹏郑文岭; 关键词：基因表达谱肌萎缩侧索硬化

神经内镜下第三脑室底造瘘治疗脑积水的临床研究: 研究背景及目的：　　脑积水是神经外科最常见的临床疾病之一，近些年来分流装置的改进和微侵袭神经内镜的发展使脑积水的外科疗效得到了明显改善，但对于其定义分类以及复杂的病理机制等方面均存在许多争议[1-6]。20世纪早期，...; 刘华; 关键词：脑积水神经内镜临床病理; 文献传递

小鼠肺组织钩虫感染时间序列基因表达谱的生物信息学分析: 生物信息学作为一种生物数据存储、检索和分析的工具，已经成为生命科学研究中必可不少的研究手段，其中对基因芯片的数据分析是至关重要的环节。基因芯片在一次实验中能够检测多个基因甚至整个基因组表达的情况，获得的数据量可能十分庞大...; 刘华; 关键词：钩虫病基因表达生物信息学; 文献传递

全选清除导出

共1页<1>

刘华