张丽丽
- 作品数：5 被引量：38H指数：2
- 供职机构：山东大学生命科学学院微生物技术国家重点实验室更多>>
- 发文基金：山东省自然科学基金国家自然科学基金中央级公益性科研院所基本科研业务费专项更多>>
- 相关领域：生物学环境科学与工程轻工技术与工程更多>>
- 基于宏组学方法认识微生物群落及其功能被引量：32
- 2015年
- 进入后基因组学时代,测序技术飞速发展,测序成本明显下降,形成了涵盖宏基因组学、宏转录组学和宏蛋白质组学的宏组学技术,推动了对微生物群落的多样性、结构及潜在基因功能方面的深入研究。最近随着整合的宏组学技术的提出及应用,全面系统分析微生物群落动态变化及其代谢功能已成为可能,这将成为微生物生态学研究的新趋势。本文综述了宏组学在研究海洋湖泊、深海热泉、人体肠道、牛瘤胃生境、森林土壤与堆肥生境等环境中微生物群落的结构和功能方面的最新进展与成功应用案例。
- 马海霞张丽丽孙晓萌张怀强何明雄陈冠军王禄山
- 关键词：微生物群落宏基因组学
- 荧光光谱法定量测定纤维素酶活性架构中单个氨基酸突变对底物结合力的影响被引量：1
- 2016年
- 纤维素酶活性架构是酶分子中多个氨基酸残基构成的可结合并催化底物的功能区,其中色氨酸等芳香族残基在该区域中起着重要作用.本研究利用荧光光谱法,定量分析了纤维素酶Ch Cel5A活性架构中色氨酸与底物的结合动力学过程,通过色氨酸荧光猝灭的定量分析,确定了色氨酸特异性结合时的底物浓度范围,并且测定了Ch Cel5A活性架构中单个氨基酸突变导致的底物结合常数的变化,与催化动力学参数比较发现,荧光光谱法可准确表征纤维素酶与底物的结合力及其单个残基突变引起动力学参数的变化.此外,由于p NP中含有强的吸电子基团,因而以p NPC等为配体时会高估与色氨酸的结合常数约20-100倍.荧光光谱法可以测定纤维素酶结合糖分子底物的动力学参数,该方法具有灵敏和快速的特点,这为蛋白质与底物之间相互作用的定量分析提供了新的视角.
- 王培培张丽丽张庆王禄山陈冠军
- 关键词：荧光光谱法纤维素酶色氨酸结合力
- 基于整合宏组学技术认识腐生生境功能微生物区系
- 2017年
- 微生物区系在天然生境中分布广泛,利用传统纯培养等方法无法全面认识其分布和功能,因此被认为是地球上的"暗物质"。随着新一代测序技术与高分辨率质谱技术的快速发展,研究者可以在非培养条件下全面快速分析天然生境中微生物组及其动态变化,这开启了微生物组时代,使得研究地球上"暗物质"成为可能,从而改变了微生物学研究的现状。腐生生境作为生物地球化学循环的重要推动部分,因其高效降解转化有机废弃物能力而被广泛关注。腐生生境由于原料多变、环境复杂等原因未能被全面深入研究,而整合宏组学技术则为解析相关生境微生物区系的多样性及其功能动态演替规律奠定了技术基础。基于整合宏组学数据分析与环境参数的优化,可以在认识微生物组及其功能的动态水平上,针对复杂物料建立高效降解转化的绿色转化工艺,促进农牧业废弃物无害化和资源化利用进程。
- 潘晓光张丽丽张怀强王禄山
- 利用宏组学技术分析条堆发酵与塔式发酵堆肥生境中微生物群落及其关键酶系的动态变化
- 本研究针对天然高效降解木质纤维素生境中的微生物和糖苷水解酶多样性这一科学问题,利用宏蛋白组学、功能代谢组学及宏基因组学技术,对木质纤维素条堆与塔式堆肥生境中微生物种群及其胞外糖苷水解酶系进行系统分析.连续跟踪了玉米秸秆堆...
- 王禄山张丽丽张怀强陈冠军高培基
- 关键词：微生物群落
- 裂解多糖单加氧酶高效催化的研究进展被引量：5
- 2016年
- 裂解多糖单加氧酶(lytic polysaccharide monooxygenases,LPMOs)是一类新发现的铜离子依赖性的氧化酶,常具有多种模块化组合,能够高效氧化降解生物质多糖.LPMOs的催化结构域为β三明治结构,活性中心含有一个铜离子.该酶的催化反应过程相对于糖苷水解酶类更加复杂,LPMOs结合底物后,首先要接受电子供体提供的电子,通过电子传递链传递给活性中心的Cu[Ⅱ],将其还原为Cu[Ⅰ],Cu[Ⅰ]结合并活化分子氧后,再氧化降解多糖链的糖苷键,生成氧化产物和非氧化产物.近年来的研究表明,在木质纤维素降解酶系中加入LPMOs能显著提高其对结晶纤维素的转化效率,因此LPMOs相关研究的深入开展可以拓展人们对其高效降解机制的认识,从而为高效降解酶系的复配以降低工业规模的生产成本等提供理论指导.本文综述了该领域相关研究的最新进展,分析了LPMOs潜在的研究方向与工业化应用的前景.
- 李欣张丽丽田莉张怀强陈冠军王禄山
- 关键词：电子传递链
