刘太岗
- 作品数：11 被引量：14H指数：2
- 供职机构：上海海洋大学信息学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金博士科研启动基金上海市科学技术委员会资助项目更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术生物学文化科学金属学及工艺更多>>
- 基于SVM-RFE算法的凋亡蛋白亚细胞定位预测被引量：4
- 2017年
- 获取凋亡蛋白亚细胞定位的信息对揭示细胞程序性死亡的机制和注解蛋白质功能都具有非常重要的意义。鉴于实验方法确定亚细胞定位不仅费时费力而且代价过高,开发快速有效的计算方法预测亚细胞定位已成为生物信息学领域的重要研究内容之一。首先基于位置特异性得分矩阵提取氨基酸组分、二肽组分和自协方差变量等特征构建蛋白质序列的特征表示模型,然后采用递归特征消除法进行特征选择,最后选用支持向量机分类器在两个常用数据集上进行夹克刀检验。实验结果表明,该方法优于大多数已报道的预测方法,从而证明了其有效性。
- 刘太岗王春华
- 关键词：支持向量机
- 浅谈一道高等数学竞赛试题的教学价值被引量：1
- 2016年
- 从一道全国大学生数学竞赛试题的证明出发,讨论了无穷级数与广义积分之间的关系,并将用到的技巧与方法进行归纳总结和拓展,以便在高等数学教学中培养学生的创新能力。
- 刘太岗张俊王春华
- 关键词：高等数学广义积分无穷级数
- 基于Visual Basic的智能粘贴软件(Smart-Stick)研发
- 2014年
- 学生成绩在线录入系统需要任课教师将每位学生的平时、期中、期末等诸多模块的成绩手动录入到网页表单中,如果选课人数过多,成绩录入工作将十分繁琐,且容易出错。利用表单之间光标切换转移的规律,结合Visual Basic 6.0编程语言,运用API函数和一些数据控件,以及Visual Basic与Excel连接的相关技术自主开发了一款智能粘贴软件(Smart-Stick)。该软件有效提高了高校教师成绩录入的效率和准确性。
- 王宇琛黄媛陈博欧刘太岗
- 关键词：API函数
- 函数的奇偶性在高等数学中的若干讨论
- 2016年
- 介绍了函数奇偶性的定义和图形特征,分析了奇偶函数的性质,并讨论了函数奇偶性在高等数学中的若干应用。
- 刘太岗王春华
- 关键词：函数奇偶性高等数学
- 机器学习方法在生物信息学中的应用
- 近年来,随着基因组测序技术和物质结构解析技术的发展,生物序列和结构的数据呈指数形式增长.传统的生物实验方法已不能满足目前处理这些海量生物数据的需要.在这种情况下,生物信息学应运而生,其目的在于通过对生物数据的获取、加工、...
- 刘太岗
- 关键词：生物信息学蛋白质亚细胞定位转录调控
- 文献传递
- 拟南芥花药基因的共表达分析
- 2010年
- 运用图论中最大团算法,对ATTED-Ⅱ数据库中提供的拟南芥共表达数据进行分析,为进一步研究基因功能提供了较为可靠的数据。文中提出的算法首先根据芯片数据鉴定拟南芥花药基因,然后以ATTED-Ⅱ数据库为基础构建每一个花药基因的共表达网络,最后利用最大团算法从共表达网络中挖掘共表达数据。基于这种方法,系统地分析了每一个拟南芥花药基因的共表达情况,有助于拟南芥花药发育分子机理和基因转录调控的深入研究。实验验证这种方法对拟南芥花药共表达基因的提取十分有效。
- 焦清局刘太岗郑小琪连爱娥黄继风
- 关键词：拟南芥花药共表达最大团
- 铜线拉丝模具的优化设计被引量：6
- 2014年
- 针对当前铜线拉拔过程中，铜线拉丝速度提高，模具磨损加重的问题，通过对铜线拉丝模具的几何尺寸和金属丝塑性变形的数学分析，基于经典的上界定理，建立数学模型，求解在铜线拉拔过程中，具有最小功率下铜线拉丝模具压缩区的最佳锥角，并估计其误差。采用拼合的凹模模拟铜杆拉拔过程，测得拉拔因子，同时就模具的材质、润滑条件和拉拔力对最佳锥角的影响进行了讨论。研究表明，当铜线截面压缩率为20％～25％之间时，铜线拉丝模具压缩区的锥角2α控制在17°～20°的范围中为最优，此时铜线拉拔过程可有效减少模具磨损，延长了模具寿命。
- 陈海杰刘金枝陈峰刘太岗
- 关键词：拉丝
- 基于最优分割位点的蛋白质亚细胞位点预测方法被引量：2
- 2011年
- 蛋白质的亚细胞位点信息有助于我们了解蛋白质的功能以及它们之间的相互作用,同时还可以为新药物的研发提供帮助。目前普遍采用的亚细胞位点预测方法主要是基于N端分选信号或氨基酸组分特征,但研究表明,单纯基于N端分选信号或氨基酸组分的方法都会丢失序列的序信息。为了克服此缺陷,本文提出了一种基于最优分割位点的蛋白质亚细胞位点预测方法。首先,把每条蛋白质序列分割为N端、中间和C端三部分,然后在每个子序列和整条序列中分别提取氨基酸组分、双肽组分和物理化学性质,最后我们把这些特征融合起来作为整条序列的特征。通过夹克刀检验,该方法在NNPSL数据集上得到的总体精度分别是87.8%和92.1%。
- 王伟郑小琪窦永超刘太岗赵娟王军
- 关键词：蛋白质序列
- 基于ACC变换和RFE算法的蛋白质亚核定位预测
- 2016年
- 获取真核细胞中细胞核内蛋白质定位的信息对注解蛋白质功能具有非常重要的意义。针对于利用计算方法预测蛋白质在亚核水平上的定位更具挑战性的问题,提出了基于自互协方差变换与递归特征消除预测蛋白质亚核定位的方法。该方法基于位置特异性得分矩阵利用自互协方差变换构建蛋白质序列的特征向量,采用递归特征消除法进行特征选择,选用支持向量机作为预测工具,并在两个经典数据集SC714和LD504上进行了夹克刀测试。实验结果表明,该方法比大多数已报道的预测方法具有更高的预测准确率。
- 李小苇刘太岗陶珮莹王春华
- 基于一种新型马尔科夫模型的预测蛋白质亚细胞位点的方法(英文)
- 2011年
- 亚细胞位点是蛋白质很重要的功能特征.找到一种有效的、可信度高的预测蛋白质位点的方法是很必要的.提出了一种基于马尔科夫模型的改进预测方法.首先,对于一条给定的蛋白质序列,通过计算在马尔科夫模型下20个氨基酸残基的状态转移矩阵,建立一个420维的特征向量,然后利用支持向量机进行训练和预测,最后夹克刀检验证实了该方法的预测精度与以前的马尔科夫模型相比得到了一定的提高.
- 赵娟秦玉芳刘太岗王军
- 关键词：马尔科夫模型支持向量机
